Protein–RNA interactions for Protein: Q13595

TRA2A, Transformer-2 protein homolog alpha, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 282 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRA2AQ13595 TAOK3-208ENST00000537822 597 ntTSL 37.78□□□□□ -1.163e-6■■■■□ 20.7
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TRA2AQ13595 NVL-212ENST00000469968 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.183e-6■■■■□ 20.7
TRA2AQ13595 STAMBP-208ENST00000478946 955 ntTSL 37.4□□□□□ -1.223e-6■■■■□ 20.7
TRA2AQ13595 STAMBP-202ENST00000394070 6691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.233e-6■■■■□ 20.7
TRA2AQ13595 ZC3H13-201ENST00000242848 8018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.293e-6■■■■□ 20.7
TRA2AQ13595 STAMBP-201ENST00000339566 6277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.293e-6■■■■□ 20.7
TRA2AQ13595 CASC3-205ENST00000577605 714 ntTSL 36.96□□□□□ -1.33e-6■■■■□ 20.7
TRA2AQ13595 TAOK3-206ENST00000537305 3932 ntTSL 55.4□□□□□ -1.553e-6■■■■□ 20.7
TRA2AQ13595 TAOK3-202ENST00000419821 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.32□□□□□ -1.723e-6■■■■□ 20.7
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TRA2AQ13595 NVL-204ENST00000436927 766 ntTSL 32.61□□□□□ -1.993e-6■■■■□ 20.7
TRA2AQ13595 NVL-219ENST00000488718 564 ntTSL 42.21□□□□□ -2.063e-6■■■■□ 20.7
TRA2AQ13595 NVL-221ENST00000492281 553 ntTSL 41.89□□□□□ -2.113e-6■■■■□ 20.7
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TRA2AQ13595 ZFC3H1-201ENST00000378743 7285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.683e-9■■■■□ 20.7
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TRA2AQ13595 CLU-202ENST00000405140 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.482e-16■■■■□ 20.6
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TRA2AQ13595 CLU-201ENST00000316403 3080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.892e-16■■■■□ 20.6
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TRA2AQ13595 MKI67-201ENST00000368653 11417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.584e-7■■■■□ 20.6
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TRA2AQ13595 ZRANB2-202ENST00000370920 3078 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.1□□□□□ -1.112e-10■■■■□ 20.3
TRA2AQ13595 ZRANB2-201ENST00000254821 2821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.752e-10■■■■□ 20.3
TRA2AQ13595 RBM6-208ENST00000438912 473 ntTSL 53.73□□□□□ -1.819e-9■■■■□ 20.3
TRA2AQ13595 UPF3B-203ENST00000478840 748 ntTSL 34.73□□□□□ -1.655e-6■■■■□ 20.3
TRA2AQ13595 SOS1-201ENST00000395038 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.543e-6■■■■□ 20.3
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TRA2AQ13595 SOS1-202ENST00000402219 8314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.833e-6■■■■□ 20.3
TRA2AQ13595 CENPE-208ENST00000611174 8260 ntTSL 5 BASIC4.15□□□□□ -1.741e-6■■■■□ 20.2
TRA2AQ13595 CENPE-202ENST00000380026 8241 ntTSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.761e-6■■■■□ 20.2
TRA2AQ13595 CENPE-201ENST00000265148 8612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.42□□□□□ -2.021e-6■■■■□ 20.2
TRA2AQ13595 RBM39-232ENST00000481037 687 ntTSL 35.43□□□□□ -1.543e-11■■■■□ 20.2
TRA2AQ13595 RBM39-210ENST00000425184 526 ntTSL 33.05□□□□□ -1.923e-11■■■■□ 20.2
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TRA2AQ13595 RTF1-201ENST00000389629 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.486e-8■■■■□ 20.2
TRA2AQ13595 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.844e-9■■■■□ 20.2
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TRA2AQ13595 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.174e-9■■■■□ 20.2
TRA2AQ13595 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.194e-9■■■■□ 20.2
TRA2AQ13595 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.224e-9■■■■□ 20.2
TRA2AQ13595 ADD1-207ENST00000446856 3745 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.354e-9■■■■□ 20.2
TRA2AQ13595 ADD1-210ENST00000503455 3206 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.764e-9■■■■□ 20.2
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