RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000536424.2

ADD1-222, Transcript of adducin 1, human

TSL 5

Gene ADD1, Length 594 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ADD1-222	ENST00000536424	NISCH	Q9Y2I1	1504 aa		39.11	■■■■□ 3.85
ADD1-222	ENST00000536424	ABCC9	O60706	1549 aa		35.75	■■■■□ 3.31
ADD1-222	ENST00000536424	CCDC180	Q9P1Z9	1646 aa		35.21	■■■■□ 3.23
ADD1-222	ENST00000536424	DNAJC5B	Q9UF47	199 aa		33.88	■■■■□ 3.01
ADD1-222	ENST00000536424	RB1CC1	Q8TDY2	1594 aa		33.77	■■■■□ 3
ADD1-222	ENST00000536424	NACAD	O15069	1562 aa		33.43	■■■□□ 2.94
ADD1-222	ENST00000536424	DCAF8L2	P0C7V8	631 aa		33.38	■■■□□ 2.93
ADD1-222	ENST00000536424	PABPN1	Q86U42	306 aa	Known RBP eCLIP	33.26	■■■□□ 2.91
ADD1-222	ENST00000536424	UNC13A	Q9UPW8	1703 aa		32.98	■■■□□ 2.87
ADD1-222	ENST00000536424	BICRA	Q9NZM4	1560 aa		32.79	■■■□□ 2.84
ADD1-222	ENST00000536424	MYO15B	Q96JP2	1530 aa		32.77	■■■□□ 2.84
ADD1-222	ENST00000536424	ZCCHC6	Q5VYS8	1495 aa	Known RBP	32.31	■■■□□ 2.76
ADD1-222	ENST00000536424	SHROOM4	Q9ULL8	1493 aa		32.24	■■■□□ 2.75
ADD1-222	ENST00000536424	CECR2	Q9BXF3	1484 aa		32.22	■■■□□ 2.75
ADD1-222	ENST00000536424	CC2D2A	Q9P2K1	1620 aa		32.22	■■■□□ 2.75
ADD1-222	ENST00000536424	DCAF1	Q9Y4B6	1507 aa		32.21	■■■□□ 2.75
ADD1-222	ENST00000536424	SCRIB	Q14160	1630 aa		32.17	■■■□□ 2.74
ADD1-222	ENST00000536424	EIF4G1	Q04637	1599 aa	Known RBP	32.03	■■■□□ 2.72
ADD1-222	ENST00000536424	DNAJC5	Q9H3Z4	198 aa		31.39	■■■□□ 2.62
ADD1-222	ENST00000536424	ERCC6	Q03468	1493 aa		30.9	■■■□□ 2.54
ADD1-222	ENST00000536424	CUX2	O14529	1486 aa		30.89	■■■□□ 2.54
ADD1-222	ENST00000536424	NCAPD3	P42695	1498 aa		30.87	■■■□□ 2.53
ADD1-222	ENST00000536424	ATAD2B	Q9ULI0	1458 aa		30.74	■■■□□ 2.51
ADD1-222	ENST00000536424	SMARCA2	P51531	1590 aa		30.62	■■■□□ 2.49
ADD1-222	ENST00000536424	SMARCA4	P51532	1647 aa		30.59	■■■□□ 2.49
ADD1-222	ENST00000536424	HMGXB3	Q12766	1538 aa		30.58	■■■□□ 2.49
ADD1-222	ENST00000536424	NES	P48681	1621 aa		30.58	■■■□□ 2.49
ADD1-222	ENST00000536424	BAZ1B	Q9UIG0	1483 aa	Known RBP	30.44	■■■□□ 2.46
ADD1-222	ENST00000536424	BAZ1A	Q9NRL2	1556 aa	Predicted RBP	30.38	■■■□□ 2.45
ADD1-222	ENST00000536424	THOC2	Q8NI27	1593 aa	Known RBP	30.28	■■■□□ 2.44
ADD1-222	ENST00000536424	PEG3	Q9GZU2	1588 aa		30.24	■■■□□ 2.43
ADD1-222	ENST00000536424	LAMC3	Q9Y6N6	1575 aa		30.24	■■■□□ 2.43
ADD1-222	ENST00000536424	MROH2B	Q7Z745	1585 aa		30.15	■■■□□ 2.42
ADD1-222	ENST00000536424	KIF21A	Q7Z4S6	1674 aa		30.13	■■■□□ 2.41
ADD1-222	ENST00000536424	PDS5B	Q9NTI5	1447 aa		30.12	■■■□□ 2.41
ADD1-222	ENST00000536424	TRIM41	Q8WV44	630 aa		29.96	■■■□□ 2.39
ADD1-222	ENST00000536424	CADPS	Q9ULU8	1353 aa		29.94	■■■□□ 2.38
ADD1-222	ENST00000536424	MRC2	Q9UBG0	1479 aa		29.87	■■■□□ 2.37
ADD1-222	ENST00000536424	WIZ	O95785	1651 aa		29.79	■■■□□ 2.36
ADD1-222	ENST00000536424	WDR62	O43379	1518 aa		29.77	■■■□□ 2.36
ADD1-222	ENST00000536424	CEP164	Q9UPV0	1460 aa		29.69	■■■□□ 2.34
ADD1-222	ENST00000536424	FANCD2	Q9BXW9	1451 aa		29.62	■■■□□ 2.33
ADD1-222	ENST00000536424	OSCAR	Q8IYS5	282 aa		29.5	■■■□□ 2.31
ADD1-222	ENST00000536424	CFTR	P13569	1480 aa		29.49	■■■□□ 2.31
ADD1-222	ENST00000536424	URB2	Q14146	1524 aa	Known RBP	29.39	■■■□□ 2.3
ADD1-222	ENST00000536424	RSF1	Q96T23	1441 aa	Predicted RBP	29.38	■■■□□ 2.29
ADD1-222	ENST00000536424	TOP2A	P11388	1531 aa	Known RBP	29.35	■■■□□ 2.29
ADD1-222	ENST00000536424	PRDM2	Q13029	1718 aa		29.12	■■■□□ 2.25
ADD1-222	ENST00000536424	ZNF608	Q9ULD9	1512 aa	Predicted RBP	29.11	■■■□□ 2.25
ADD1-222	ENST00000536424	RIMBP3C	A6NJZ7	1639 aa		29.11	■■■□□ 2.25
ADD1-222	ENST00000536424	RIMBP3B	A6NNM3	1639 aa		29.11	■■■□□ 2.25
ADD1-222	ENST00000536424	RIMBP3	Q9UFD9	1639 aa		29.11	■■■□□ 2.25
ADD1-222	ENST00000536424	IFT140	Q96RY7	1462 aa		29.09	■■■□□ 2.25
ADD1-222	ENST00000536424	CCDC88B	A6NC98	1476 aa		29.05	■■■□□ 2.24
ADD1-222	ENST00000536424	TOPBP1	Q92547	1522 aa		29	■■■□□ 2.23
ADD1-222	ENST00000536424	ARHGEF11	O15085	1522 aa		28.99	■■■□□ 2.23
ADD1-222	ENST00000536424	EIF4G3	O43432	1585 aa	Known RBP	28.9	■■■□□ 2.22
ADD1-222	ENST00000536424	ABCC8	Q09428	1581 aa		28.88	■■■□□ 2.21
ADD1-222	ENST00000536424	CYB5RL	Q6IPT4	315 aa		28.88	■■■□□ 2.21
ADD1-222	ENST00000536424	DNMBP	Q6XZF7	1577 aa		28.84	■■■□□ 2.21
ADD1-222	ENST00000536424	AQR	O60306	1485 aa	Known RBP eCLIP	28.81	■■■□□ 2.2	1e-6	■■■□□ 18.6
ADD1-222	ENST00000536424	FBLN2	P98095	1184 aa		28.8	■■■□□ 2.2
ADD1-222	ENST00000536424	CHD1	O14646	1710 aa		28.77	■■■□□ 2.2
ADD1-222	ENST00000536424	TRH	P20396	242 aa	Predicted RBP	28.74	■■■□□ 2.19
ADD1-222	ENST00000536424	TARBP1	Q13395	1621 aa	Known RBP	28.73	■■■□□ 2.19
ADD1-222	ENST00000536424	POLA1	P09884	1462 aa	Predicted RBP	28.67	■■■□□ 2.18
ADD1-222	ENST00000536424	ARAP1	Q96P48	1450 aa		28.67	■■■□□ 2.18
ADD1-222	ENST00000536424	RAD54L2	Q9Y4B4	1467 aa		28.62	■■■□□ 2.17
ADD1-222	ENST00000536424	TDRD9	Q8NDG6	1382 aa	Known RBP	28.6	■■■□□ 2.17
ADD1-222	ENST00000536424	SOGA1	O94964	1423 aa		28.58	■■■□□ 2.17
ADD1-222	ENST00000536424	SNAPC4	Q5SXM2	1469 aa		28.5	■■■□□ 2.15
ADD1-222	ENST00000536424	CHMP7	Q8WUX9	453 aa	Predicted RBP	28.47	■■■□□ 2.15
ADD1-222	ENST00000536424	FGD5	Q6ZNL6	1462 aa		28.46	■■■□□ 2.15
ADD1-222	ENST00000536424	CLASP1	Q7Z460	1538 aa		28.4	■■■□□ 2.14
ADD1-222	ENST00000536424	SYNJ1	O43426	1573 aa		28.38	■■■□□ 2.13
ADD1-222	ENST00000536424	WDR97	A6NE52	1622 aa		28.37	■■■□□ 2.13
ADD1-222	ENST00000536424	MAGI1	Q96QZ7	1491 aa	Predicted RBP	28.37	■■■□□ 2.13
ADD1-222	ENST00000536424	CUX1	P39880	1505 aa		28.36	■■■□□ 2.13
ADD1-222	ENST00000536424	GRIN2B	Q13224	1484 aa		28.34	■■■□□ 2.13
ADD1-222	ENST00000536424	SYNJ2	O15056	1496 aa		28.29	■■■□□ 2.12
ADD1-222	ENST00000536424	GAPVD1	Q14C86	1478 aa		28.21	■■■□□ 2.11
ADD1-222	ENST00000536424	AEBP2	Q6ZN18	517 aa	Predicted RBP	28.2	■■■□□ 2.1
ADD1-222	ENST00000536424	PBRM1	Q86U86	1689 aa		28.19	■■■□□ 2.1
ADD1-222	ENST00000536424	ABCA10	Q8WWZ4	1543 aa		28.08	■■■□□ 2.08
ADD1-222	ENST00000536424	ABCA5	Q8WWZ7	1642 aa		28.06	■■■□□ 2.08
ADD1-222	ENST00000536424	GRIN2A	Q12879	1464 aa		27.98	■■■□□ 2.07
ADD1-222	ENST00000536424	ERCC6L2	Q5T890	1561 aa		27.98	■■■□□ 2.07
ADD1-222	ENST00000536424	SUPT5H	O00267	1087 aa	Known RBP	27.94	■■■□□ 2.06
ADD1-222	ENST00000536424	WRN	Q14191	1432 aa	Predicted RBP eCLIP	27.92	■■■□□ 2.06
ADD1-222	ENST00000536424	ADAMTS12	P58397	1594 aa		27.89	■■■□□ 2.05
ADD1-222	ENST00000536424	CEP170	Q5SW79	1584 aa		27.89	■■■□□ 2.05
ADD1-222	ENST00000536424	NUP160	Q12769	1436 aa		27.87	■■■□□ 2.05
ADD1-222	ENST00000536424	FHAD1	B1AJZ9	1412 aa		27.82	■■■□□ 2.04
ADD1-222	ENST00000536424	SHROOM2	Q13796	1616 aa		27.78	■■■□□ 2.04
ADD1-222	ENST00000536424	TOP2B	Q02880	1626 aa		27.77	■■■□□ 2.04
ADD1-222	ENST00000536424	BIVM-ERCC5	R4GMW8	1640 aa		27.75	■■■□□ 2.03
ADD1-222	ENST00000536424	PRG4	Q92954	1404 aa	Predicted RBP	27.71	■■■□□ 2.03
ADD1-222	ENST00000536424	ERICH3	Q5RHP9	1530 aa		27.71	■■■□□ 2.03
ADD1-222	ENST00000536424	JPH4	Q96JJ6	628 aa		27.67	■■■□□ 2.02
ADD1-222	ENST00000536424	KIF13A	Q9H1H9	1805 aa		27.64	■■■□□ 2.01

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 12.8 ms