Protein–RNA interactions for Protein: Q13148

TARDBP, TAR DNA-binding protein 43, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 414 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TARDBPQ13148 STX3-206ENST00000533637 1024 ntTSL 216.33■□□□□ 0.22e-6■■■■■ 32
TARDBPQ13148 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.122e-6■■■■■ 32
TARDBPQ13148 STX3-207ENST00000633708 3111 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.322e-6■■■■■ 32
TARDBPQ13148 STX3-208ENST00000641815 3236 ntBASIC4.92□□□□□ -1.622e-6■■■■■ 32
TARDBPQ13148 AGPAT3-215ENST00000484865 588 ntTSL 211.35□□□□□ -0.593e-7■■■■■ 32
TARDBPQ13148 AGPAT3-211ENST00000467358 3955 ntTSL 29.83□□□□□ -0.843e-7■■■■■ 32
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TARDBPQ13148 CLASP2-217ENST00000486796 656 ntTSL 215.25■□□□□ 0.034e-9■■■■■ 32
TARDBPQ13148 CLASP2-215ENST00000482896 580 ntTSL 410.42□□□□□ -0.744e-9■■■■■ 32
TARDBPQ13148 CLASP2-224ENST00000498331 452 ntTSL 45.72□□□□□ -1.494e-9■■■■■ 32
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TARDBPQ13148 HDAC6-203ENST00000376619 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.695e-7■■■■■ 32
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TARDBPQ13148 RAF1-201ENST00000251849 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.188e-7■■■■■ 31.9
TARDBPQ13148 UBE3A-208ENST00000625681 654 ntTSL 523.52■■□□□ 1.365e-7■■■■■ 31.9
TARDBPQ13148 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.021e-9■■■■■ 31.9
TARDBPQ13148 TAX1BP1-207ENST00000433216 3174 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.381e-9■■■■■ 31.9
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TARDBPQ13148 TAX1BP1-208ENST00000457186 1174 ntTSL 56.1□□□□□ -1.431e-9■■■■■ 31.9
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TARDBPQ13148 TMEM116-210ENST00000550037 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 34.54□□□□□ -1.686e-9■■■■■ 31.8
TARDBPQ13148 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.484e-7■■■■■ 31.8
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TARDBPQ13148 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.432e-9■■■■■ 31.7
TARDBPQ13148 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.332e-9■■■■■ 31.7
TARDBPQ13148 C11orf80-211ENST00000531400 367 ntTSL 312.72□□□□□ -0.372e-9■■■■■ 31.7
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TARDBPQ13148 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.165e-7■■■■■ 31.7
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TARDBPQ13148 MGAT1-213ENST00000506889 1104 ntTSL 223.18■■□□□ 1.35e-7■■■■■ 31.7
TARDBPQ13148 MGAT1-224ENST00000514438 607 ntTSL 420.13■□□□□ 0.815e-7■■■■■ 31.7
TARDBPQ13148 MGAT1-222ENST00000513431 555 ntTSL 218.32■□□□□ 0.525e-7■■■■■ 31.7
TARDBPQ13148 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.145e-7■■■■■ 31.7
TARDBPQ13148 MGAT1-217ENST00000510341 553 ntTSL 415.02■□□□□ -05e-7■■■■■ 31.7
TARDBPQ13148 MGAT1-216ENST00000508702 313 ntTSL 415.02■□□□□ -05e-7■■■■■ 31.7
TARDBPQ13148 MGAT1-202ENST00000333055 8863 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.055e-7■■■■■ 31.7
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TARDBPQ13148 MGAT1-218ENST00000510962 445 ntTSL 511.74□□□□□ -0.535e-7■■■■■ 31.7
TARDBPQ13148 MGAT1-207ENST00000504385 540 ntTSL 411.51□□□□□ -0.575e-7■■■■■ 31.7
TARDBPQ13148 MGAT1-219ENST00000512080 532 ntTSL 511.11□□□□□ -0.635e-7■■■■■ 31.7
TARDBPQ13148 MGAT1-212ENST00000506708 745 ntTSL 28.16□□□□□ -1.15e-7■■■■■ 31.7
TARDBPQ13148 MGAT1-221ENST00000513149 356 ntTSL 47.35□□□□□ -1.235e-7■■■■■ 31.7
TARDBPQ13148 MGAT1-225ENST00000514760 613 ntTSL 36.97□□□□□ -1.295e-7■■■■■ 31.7
TARDBPQ13148 MGAT1-215ENST00000508090 475 ntTSL 45.14□□□□□ -1.595e-7■■■■■ 31.7
TARDBPQ13148 FBXO11-209ENST00000492225 2216 ntTSL 1 (best)11.59□□□□□ -0.551e-6■■■■■ 31.7
TARDBPQ13148 FBXO11-202ENST00000403359 4055 ntTSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.091e-6■■■■■ 31.7
TARDBPQ13148 FBXO11-204ENST00000424163 560 ntTSL 43.67□□□□□ -1.821e-6■■■■■ 31.7
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TARDBPQ13148 TMEM181-201ENST00000367090 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.112e-7■■■■■ 31.7
TARDBPQ13148 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.862e-9■■■■■ 31.7
TARDBPQ13148 DDX54-207ENST00000550016 594 ntTSL 518.94■□□□□ 0.622e-9■■■■■ 31.7
TARDBPQ13148 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.389e-7■■■■■ 31.7
TARDBPQ13148 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.312e-9■■■■■ 31.7
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