Protein–RNA interactions for Protein: P53794

SLC5A3, Sodium/myo-inositol cotransporter, humanhuman

Predictions only

Length 718 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC5A3P53794 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SLC5A3P53794 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SLC5A3P53794 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SLC5A3P53794 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SLC5A3P53794 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SLC5A3P53794 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SLC5A3P53794 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SLC5A3P53794 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SLC5A3P53794 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLC5A3P53794 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLC5A3P53794 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLC5A3P53794 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLC5A3P53794 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLC5A3P53794 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLC5A3P53794 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
SLC5A3P53794 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SLC5A3P53794 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SLC5A3P53794 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SLC5A3P53794 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SLC5A3P53794 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
SLC5A3P53794 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SLC5A3P53794 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SLC5A3P53794 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SLC5A3P53794 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SLC5A3P53794 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SLC5A3P53794 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SLC5A3P53794 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SLC5A3P53794 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SLC5A3P53794 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SLC5A3P53794 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SLC5A3P53794 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SLC5A3P53794 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
SLC5A3P53794 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
SLC5A3P53794 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SLC5A3P53794 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SLC5A3P53794 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SLC5A3P53794 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SLC5A3P53794 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SLC5A3P53794 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SLC5A3P53794 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SLC5A3P53794 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SLC5A3P53794 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SLC5A3P53794 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLC5A3P53794 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLC5A3P53794 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLC5A3P53794 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLC5A3P53794 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLC5A3P53794 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLC5A3P53794 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLC5A3P53794 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLC5A3P53794 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLC5A3P53794 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
SLC5A3P53794 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLC5A3P53794 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLC5A3P53794 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLC5A3P53794 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLC5A3P53794 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLC5A3P53794 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLC5A3P53794 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
SLC5A3P53794 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLC5A3P53794 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLC5A3P53794 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLC5A3P53794 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLC5A3P53794 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLC5A3P53794 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SLC5A3P53794 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SLC5A3P53794 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SLC5A3P53794 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SLC5A3P53794 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SLC5A3P53794 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SLC5A3P53794 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SLC5A3P53794 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
SLC5A3P53794 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SLC5A3P53794 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SLC5A3P53794 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SLC5A3P53794 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
SLC5A3P53794 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SLC5A3P53794 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SLC5A3P53794 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SLC5A3P53794 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SLC5A3P53794 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
SLC5A3P53794 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SLC5A3P53794 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SLC5A3P53794 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SLC5A3P53794 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SLC5A3P53794 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SLC5A3P53794 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
SLC5A3P53794 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
SLC5A3P53794 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SLC5A3P53794 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SLC5A3P53794 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SLC5A3P53794 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SLC5A3P53794 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SLC5A3P53794 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SLC5A3P53794 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLC5A3P53794 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLC5A3P53794 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLC5A3P53794 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLC5A3P53794 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLC5A3P53794 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms