Protein–RNA interactions for Protein: P19961

AMY2B, Alpha-amylase 2B, humanhuman

Predictions only

Length 511 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMY2BP19961 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
AMY2BP19961 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
AMY2BP19961 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
AMY2BP19961 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
AMY2BP19961 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
AMY2BP19961 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
AMY2BP19961 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
AMY2BP19961 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
AMY2BP19961 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
AMY2BP19961 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
AMY2BP19961 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
AMY2BP19961 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
AMY2BP19961 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
AMY2BP19961 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
AMY2BP19961 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
AMY2BP19961 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
AMY2BP19961 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
AMY2BP19961 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
AMY2BP19961 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
AMY2BP19961 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
AMY2BP19961 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
AMY2BP19961 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
AMY2BP19961 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
AMY2BP19961 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
AMY2BP19961 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
AMY2BP19961 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
AMY2BP19961 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
AMY2BP19961 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
AMY2BP19961 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
AMY2BP19961 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
AMY2BP19961 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
AMY2BP19961 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
AMY2BP19961 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
AMY2BP19961 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
AMY2BP19961 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
AMY2BP19961 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
AMY2BP19961 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
AMY2BP19961 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
AMY2BP19961 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
AMY2BP19961 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
AMY2BP19961 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
AMY2BP19961 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
AMY2BP19961 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
AMY2BP19961 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
AMY2BP19961 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
AMY2BP19961 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
AMY2BP19961 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
AMY2BP19961 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
AMY2BP19961 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
AMY2BP19961 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
AMY2BP19961 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
AMY2BP19961 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
AMY2BP19961 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
AMY2BP19961 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
AMY2BP19961 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
AMY2BP19961 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
AMY2BP19961 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
AMY2BP19961 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
AMY2BP19961 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
AMY2BP19961 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
AMY2BP19961 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
AMY2BP19961 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
AMY2BP19961 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
AMY2BP19961 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
AMY2BP19961 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
AMY2BP19961 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
AMY2BP19961 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
AMY2BP19961 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
AMY2BP19961 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
AMY2BP19961 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
AMY2BP19961 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
AMY2BP19961 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
AMY2BP19961 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
AMY2BP19961 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
AMY2BP19961 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
AMY2BP19961 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
AMY2BP19961 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
AMY2BP19961 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
AMY2BP19961 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
AMY2BP19961 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
AMY2BP19961 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
AMY2BP19961 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
AMY2BP19961 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
AMY2BP19961 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
AMY2BP19961 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
AMY2BP19961 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
AMY2BP19961 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
AMY2BP19961 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
AMY2BP19961 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
AMY2BP19961 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
AMY2BP19961 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
AMY2BP19961 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
AMY2BP19961 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
AMY2BP19961 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
AMY2BP19961 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
AMY2BP19961 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
AMY2BP19961 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
AMY2BP19961 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
AMY2BP19961 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
AMY2BP19961 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.6 ms