Protein–RNA interactions for Protein: A0A599

TCRBV5S2, T-cell receptor beta variable 5-6 (Fragment), humanhuman

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Length 114 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCRBV5S2A0A599 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TCRBV5S2A0A599 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TCRBV5S2A0A599 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
TCRBV5S2A0A599 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TCRBV5S2A0A599 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TCRBV5S2A0A599 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TCRBV5S2A0A599 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TCRBV5S2A0A599 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TCRBV5S2A0A599 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TCRBV5S2A0A599 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TCRBV5S2A0A599 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TCRBV5S2A0A599 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TCRBV5S2A0A599 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TCRBV5S2A0A599 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TCRBV5S2A0A599 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TCRBV5S2A0A599 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TCRBV5S2A0A599 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
TCRBV5S2A0A599 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TCRBV5S2A0A599 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TCRBV5S2A0A599 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TCRBV5S2A0A599 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TCRBV5S2A0A599 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TCRBV5S2A0A599 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TCRBV5S2A0A599 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TCRBV5S2A0A599 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TCRBV5S2A0A599 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TCRBV5S2A0A599 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TCRBV5S2A0A599 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TCRBV5S2A0A599 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TCRBV5S2A0A599 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TCRBV5S2A0A599 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TCRBV5S2A0A599 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TCRBV5S2A0A599 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
TCRBV5S2A0A599 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TCRBV5S2A0A599 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TCRBV5S2A0A599 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TCRBV5S2A0A599 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TCRBV5S2A0A599 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
TCRBV5S2A0A599 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
TCRBV5S2A0A599 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
TCRBV5S2A0A599 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TCRBV5S2A0A599 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TCRBV5S2A0A599 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC21.31■■□□□ 1
TCRBV5S2A0A599 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
TCRBV5S2A0A599 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TCRBV5S2A0A599 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TCRBV5S2A0A599 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TCRBV5S2A0A599 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TCRBV5S2A0A599 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TCRBV5S2A0A599 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TCRBV5S2A0A599 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TCRBV5S2A0A599 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
TCRBV5S2A0A599 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
TCRBV5S2A0A599 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
TCRBV5S2A0A599 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
TCRBV5S2A0A599 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TCRBV5S2A0A599 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TCRBV5S2A0A599 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TCRBV5S2A0A599 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TCRBV5S2A0A599 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
TCRBV5S2A0A599 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TCRBV5S2A0A599 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC21.29■■□□□ 1
TCRBV5S2A0A599 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TCRBV5S2A0A599 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TCRBV5S2A0A599 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
TCRBV5S2A0A599 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TCRBV5S2A0A599 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TCRBV5S2A0A599 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TCRBV5S2A0A599 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TCRBV5S2A0A599 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
TCRBV5S2A0A599 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TCRBV5S2A0A599 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
TCRBV5S2A0A599 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
TCRBV5S2A0A599 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TCRBV5S2A0A599 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
TCRBV5S2A0A599 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TCRBV5S2A0A599 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TCRBV5S2A0A599 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TCRBV5S2A0A599 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TCRBV5S2A0A599 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TCRBV5S2A0A599 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TCRBV5S2A0A599 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TCRBV5S2A0A599 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TCRBV5S2A0A599 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TCRBV5S2A0A599 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
TCRBV5S2A0A599 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TCRBV5S2A0A599 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
TCRBV5S2A0A599 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
TCRBV5S2A0A599 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TCRBV5S2A0A599 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TCRBV5S2A0A599 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
TCRBV5S2A0A599 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
TCRBV5S2A0A599 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TCRBV5S2A0A599 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TCRBV5S2A0A599 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
TCRBV5S2A0A599 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
TCRBV5S2A0A599 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
TCRBV5S2A0A599 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TCRBV5S2A0A599 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TCRBV5S2A0A599 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
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