Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2L6

FRMD4B, FERM domain-containing protein 4B, humanhuman

Predictions only

Length 1,034 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRMD4BQ9Y2L6 ACSF2-202ENST00000427954 2251 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
FRMD4BQ9Y2L6 RAB11FIP1-201ENST00000287263 6253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FRMD4BQ9Y2L6 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
FRMD4BQ9Y2L6 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FRMD4BQ9Y2L6 NMBR-201ENST00000258042 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FRMD4BQ9Y2L6 DNAJC14-201ENST00000317269 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FRMD4BQ9Y2L6 CDK5RAP3-201ENST00000338399 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FRMD4BQ9Y2L6 ZBED1-203ENST00000381223 4510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
FRMD4BQ9Y2L6 TJP3-202ENST00000541714 3350 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
FRMD4BQ9Y2L6 TFE3-201ENST00000315869 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FRMD4BQ9Y2L6 ESRP2-202ENST00000473183 3793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FRMD4BQ9Y2L6 TMEM63C-201ENST00000298351 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FRMD4BQ9Y2L6 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FRMD4BQ9Y2L6 TMEM141-201ENST00000290079 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FRMD4BQ9Y2L6 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FRMD4BQ9Y2L6 SPATA16-201ENST00000351008 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FRMD4BQ9Y2L6 TPM2-202ENST00000360958 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FRMD4BQ9Y2L6 THEMIS2-204ENST00000373927 1082 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FRMD4BQ9Y2L6 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
FRMD4BQ9Y2L6 VGLL4-214ENST00000451674 938 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FRMD4BQ9Y2L6 AP001790.1-201ENST00000511947 570 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
FRMD4BQ9Y2L6 AC109479.1-201ENST00000519603 624 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
FRMD4BQ9Y2L6 DIO3OS-203ENST00000554441 1068 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FRMD4BQ9Y2L6 MIR4683-201ENST00000579659 81 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
FRMD4BQ9Y2L6 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
FRMD4BQ9Y2L6 PLXNB1-204ENST00000456774 5859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FRMD4BQ9Y2L6 SYNGR1-203ENST00000328933 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FRMD4BQ9Y2L6 ZNF541-203ENST00000391901 4580 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
FRMD4BQ9Y2L6 FAM160A2-202ENST00000449352 3354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FRMD4BQ9Y2L6 CNOT9-201ENST00000273064 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FRMD4BQ9Y2L6 PCDHGB7-201ENST00000398594 4765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FRMD4BQ9Y2L6 C1QTNF9-201ENST00000332018 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FRMD4BQ9Y2L6 STOML1-206ENST00000561656 1833 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
FRMD4BQ9Y2L6 EPAS1-201ENST00000263734 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FRMD4BQ9Y2L6 ADRB2-201ENST00000305988 3443 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
FRMD4BQ9Y2L6 KCTD10-208ENST00000540089 3096 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
FRMD4BQ9Y2L6 ABLIM2-209ENST00000505872 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
FRMD4BQ9Y2L6 NOS2P2-202ENST00000639528 1659 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FRMD4BQ9Y2L6 CD27-201ENST00000266557 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FRMD4BQ9Y2L6 AC099850.1-201ENST00000451775 1338 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
FRMD4BQ9Y2L6 AC097374.1-201ENST00000568768 6624 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FRMD4BQ9Y2L6 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FRMD4BQ9Y2L6 FBXL12-201ENST00000247977 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FRMD4BQ9Y2L6 TUSC3-201ENST00000382020 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FRMD4BQ9Y2L6 DHX36-213ENST00000496811 6733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FRMD4BQ9Y2L6 TRIM45-201ENST00000256649 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FRMD4BQ9Y2L6 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FRMD4BQ9Y2L6 MBD6-201ENST00000355673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FRMD4BQ9Y2L6 STEAP2-202ENST00000394621 7033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FRMD4BQ9Y2L6 ITPK1-207ENST00000555495 3035 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FRMD4BQ9Y2L6 C12orf76-209ENST00000615315 1580 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FRMD4BQ9Y2L6 SLC26A11-201ENST00000361193 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FRMD4BQ9Y2L6 RBBP4-204ENST00000414241 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FRMD4BQ9Y2L6 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FRMD4BQ9Y2L6 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FRMD4BQ9Y2L6 CDK2AP1-205ENST00000542174 1812 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FRMD4BQ9Y2L6 SEMA4F-202ENST00000357877 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FRMD4BQ9Y2L6 TRIM25-201ENST00000316881 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FRMD4BQ9Y2L6 CDK17-201ENST00000261211 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FRMD4BQ9Y2L6 ERLIN2-205ENST00000518586 2623 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FRMD4BQ9Y2L6 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FRMD4BQ9Y2L6 MB-205ENST00000406324 582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FRMD4BQ9Y2L6 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FRMD4BQ9Y2L6 U82695.1-202ENST00000428676 700 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FRMD4BQ9Y2L6 CTBP2P5-201ENST00000454986 1264 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
FRMD4BQ9Y2L6 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FRMD4BQ9Y2L6 AP002992.1-201ENST00000527519 491 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FRMD4BQ9Y2L6 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FRMD4BQ9Y2L6 AC023310.1-201ENST00000554836 735 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
FRMD4BQ9Y2L6 MIR22HG-212ENST00000577164 931 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FRMD4BQ9Y2L6 STRADA-221ENST00000582137 1238 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FRMD4BQ9Y2L6 AL512343.1-201ENST00000605837 169 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
FRMD4BQ9Y2L6 MIR6074-201ENST00000612054 107 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
FRMD4BQ9Y2L6 MVK-217ENST00000639206 367 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FRMD4BQ9Y2L6 KNDC1-201ENST00000304613 6793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FRMD4BQ9Y2L6 KRT8P4-201ENST00000509735 1454 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
FRMD4BQ9Y2L6 FAM107A-206ENST00000474531 2271 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FRMD4BQ9Y2L6 NDNF-201ENST00000379692 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FRMD4BQ9Y2L6 LINC00887-202ENST00000414120 2880 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FRMD4BQ9Y2L6 HTR7-202ENST00000336152 3126 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FRMD4BQ9Y2L6 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FRMD4BQ9Y2L6 CDKN1A-208ENST00000615513 2102 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FRMD4BQ9Y2L6 XRCC3-211ENST00000555055 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FRMD4BQ9Y2L6 HTR7-203ENST00000371719 3033 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FRMD4BQ9Y2L6 RWDD4-205ENST00000510968 1551 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FRMD4BQ9Y2L6 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
FRMD4BQ9Y2L6 PDLIM2-201ENST00000265810 4592 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FRMD4BQ9Y2L6 DUSP27-201ENST00000271385 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FRMD4BQ9Y2L6 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FRMD4BQ9Y2L6 AC092506.1-201ENST00000634580 2275 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
FRMD4BQ9Y2L6 RABL6-211ENST00000629216 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
FRMD4BQ9Y2L6 DNAJC27-201ENST00000264711 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FRMD4BQ9Y2L6 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FRMD4BQ9Y2L6 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FRMD4BQ9Y2L6 FANCA-213ENST00000563673 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FRMD4BQ9Y2L6 WWC2-201ENST00000403733 8826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
FRMD4BQ9Y2L6 KCTD3-201ENST00000259154 3931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FRMD4BQ9Y2L6 PI4K2A-201ENST00000370631 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FRMD4BQ9Y2L6 MAGIX-208ENST00000616266 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
FRMD4BQ9Y2L6 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms