Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2L6

FRMD4B, FERM domain-containing protein 4B, humanhuman

Predictions only

Length 1,034 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRMD4BQ9Y2L6 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC37.14■■■■□ 3.54
FRMD4BQ9Y2L6 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.91■■■■□ 3.5
FRMD4BQ9Y2L6 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC36.33■■■■□ 3.41
FRMD4BQ9Y2L6 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.24■■■■□ 3.39
FRMD4BQ9Y2L6 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
FRMD4BQ9Y2L6 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC35.95■■■■□ 3.35
FRMD4BQ9Y2L6 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
FRMD4BQ9Y2L6 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC35.64■■■■□ 3.3
FRMD4BQ9Y2L6 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC35.6■■■■□ 3.29
FRMD4BQ9Y2L6 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC35.39■■■■□ 3.26
FRMD4BQ9Y2L6 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.25
FRMD4BQ9Y2L6 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC35.29■■■■□ 3.24
FRMD4BQ9Y2L6 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
FRMD4BQ9Y2L6 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.77■■■■□ 3.16
FRMD4BQ9Y2L6 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.63■■■■□ 3.13
FRMD4BQ9Y2L6 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC34.5■■■■□ 3.11
FRMD4BQ9Y2L6 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC34.29■■■■□ 3.08
FRMD4BQ9Y2L6 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
FRMD4BQ9Y2L6 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
FRMD4BQ9Y2L6 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.16■■■■□ 3.06
FRMD4BQ9Y2L6 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
FRMD4BQ9Y2L6 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.08■■■■□ 3.05
FRMD4BQ9Y2L6 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC34.06■■■■□ 3.04
FRMD4BQ9Y2L6 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC34.04■■■■□ 3.04
FRMD4BQ9Y2L6 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.03■■■■□ 3.04
FRMD4BQ9Y2L6 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
FRMD4BQ9Y2L6 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.89■■■■□ 3.02
FRMD4BQ9Y2L6 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
FRMD4BQ9Y2L6 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC33.79■■■■□ 3
FRMD4BQ9Y2L6 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC33.76■■■■□ 3
FRMD4BQ9Y2L6 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
FRMD4BQ9Y2L6 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.55■■■□□ 2.96
FRMD4BQ9Y2L6 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.46■■■□□ 2.95
FRMD4BQ9Y2L6 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
FRMD4BQ9Y2L6 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
FRMD4BQ9Y2L6 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC33.32■■■□□ 2.92
FRMD4BQ9Y2L6 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
FRMD4BQ9Y2L6 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
FRMD4BQ9Y2L6 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC33.2■■■□□ 2.9
FRMD4BQ9Y2L6 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
FRMD4BQ9Y2L6 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
FRMD4BQ9Y2L6 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
FRMD4BQ9Y2L6 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
FRMD4BQ9Y2L6 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
FRMD4BQ9Y2L6 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
FRMD4BQ9Y2L6 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC32.95■■■□□ 2.87
FRMD4BQ9Y2L6 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
FRMD4BQ9Y2L6 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.87■■■□□ 2.85
FRMD4BQ9Y2L6 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
FRMD4BQ9Y2L6 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
FRMD4BQ9Y2L6 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC32.8■■■□□ 2.84
FRMD4BQ9Y2L6 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC32.8■■■□□ 2.84
FRMD4BQ9Y2L6 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
FRMD4BQ9Y2L6 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC32.7■■■□□ 2.83
FRMD4BQ9Y2L6 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC32.65■■■□□ 2.82
FRMD4BQ9Y2L6 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.59■■■□□ 2.81
FRMD4BQ9Y2L6 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.55■■■□□ 2.8
FRMD4BQ9Y2L6 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
FRMD4BQ9Y2L6 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
FRMD4BQ9Y2L6 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC32.5■■■□□ 2.79
FRMD4BQ9Y2L6 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
FRMD4BQ9Y2L6 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
FRMD4BQ9Y2L6 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC32.43■■■□□ 2.78
FRMD4BQ9Y2L6 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC32.41■■■□□ 2.78
FRMD4BQ9Y2L6 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
FRMD4BQ9Y2L6 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
FRMD4BQ9Y2L6 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC32.29■■■□□ 2.76
FRMD4BQ9Y2L6 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
FRMD4BQ9Y2L6 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
FRMD4BQ9Y2L6 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.22■■■□□ 2.75
FRMD4BQ9Y2L6 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
FRMD4BQ9Y2L6 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC32.19■■■□□ 2.74
FRMD4BQ9Y2L6 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
FRMD4BQ9Y2L6 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
FRMD4BQ9Y2L6 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC32.1■■■□□ 2.73
FRMD4BQ9Y2L6 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC32.08■■■□□ 2.73
FRMD4BQ9Y2L6 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
FRMD4BQ9Y2L6 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
FRMD4BQ9Y2L6 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
FRMD4BQ9Y2L6 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC31.95■■■□□ 2.71
FRMD4BQ9Y2L6 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.94■■■□□ 2.7
FRMD4BQ9Y2L6 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.93■■■□□ 2.7
FRMD4BQ9Y2L6 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
FRMD4BQ9Y2L6 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
FRMD4BQ9Y2L6 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
FRMD4BQ9Y2L6 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
FRMD4BQ9Y2L6 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
FRMD4BQ9Y2L6 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC31.78■■■□□ 2.68
FRMD4BQ9Y2L6 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.68
FRMD4BQ9Y2L6 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC31.74■■■□□ 2.67
FRMD4BQ9Y2L6 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
FRMD4BQ9Y2L6 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
FRMD4BQ9Y2L6 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC31.69■■■□□ 2.66
FRMD4BQ9Y2L6 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
FRMD4BQ9Y2L6 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
FRMD4BQ9Y2L6 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
FRMD4BQ9Y2L6 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC31.62■■■□□ 2.65
FRMD4BQ9Y2L6 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.6■■■□□ 2.65
FRMD4BQ9Y2L6 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC31.53■■■□□ 2.64
FRMD4BQ9Y2L6 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC31.48■■■□□ 2.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms