Protein–RNA interactions for Protein: Q9UFW8

CGGBP1, CGG triplet repeat-binding protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 167 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CGGBP1Q9UFW8 EHD4-201ENST00000220325 6416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CGGBP1Q9UFW8 ARHGAP45-202ENST00000539243 4184 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CGGBP1Q9UFW8 CCT4-201ENST00000394440 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CGGBP1Q9UFW8 RASGEF1C-202ENST00000393371 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CGGBP1Q9UFW8 PLXNB3-209ENST00000538966 6377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CGGBP1Q9UFW8 CILP2-202ENST00000586018 4234 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CGGBP1Q9UFW8 SLC35E2-202ENST00000355439 2078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CGGBP1Q9UFW8 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CGGBP1Q9UFW8 MCC-202ENST00000408903 3476 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CGGBP1Q9UFW8 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CGGBP1Q9UFW8 LTB4R-203ENST00000396789 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CGGBP1Q9UFW8 CHPF2-204ENST00000495645 2709 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CGGBP1Q9UFW8 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CGGBP1Q9UFW8 STX1B-201ENST00000215095 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CGGBP1Q9UFW8 CLASRP-204ENST00000544944 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CGGBP1Q9UFW8 SDCBP2-AS1-201ENST00000446423 1811 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CGGBP1Q9UFW8 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
CGGBP1Q9UFW8 MBD1-201ENST00000269468 3259 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
CGGBP1Q9UFW8 ATP6V0A4-201ENST00000310018 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
CGGBP1Q9UFW8 FBXO21-202ENST00000427718 4138 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
CGGBP1Q9UFW8 RNF170-209ENST00000534961 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
CGGBP1Q9UFW8 TLN1-201ENST00000314888 8823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
CGGBP1Q9UFW8 COL1A2-201ENST00000297268 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
CGGBP1Q9UFW8 BLCAP-205ENST00000397137 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
CGGBP1Q9UFW8 MFNG-202ENST00000416983 2034 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.31
CGGBP1Q9UFW8 OSBPL8-203ENST00000393250 3157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
CGGBP1Q9UFW8 TMEM212-201ENST00000334567 1881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
CGGBP1Q9UFW8 LOXL3-202ENST00000393937 2398 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
CGGBP1Q9UFW8 MFAP3-201ENST00000322602 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CGGBP1Q9UFW8 TOP3B-201ENST00000357179 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CGGBP1Q9UFW8 LINC01138-206ENST00000622328 2212 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
CGGBP1Q9UFW8 GOLIM4-202ENST00000470487 4373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CGGBP1Q9UFW8 TNK2-202ENST00000381916 4223 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
CGGBP1Q9UFW8 GSTCD-206ENST00000507281 2091 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
CGGBP1Q9UFW8 KIAA1257-204ENST00000511438 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
CGGBP1Q9UFW8 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
CGGBP1Q9UFW8 CRMP1-205ENST00000512574 2764 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
CGGBP1Q9UFW8 C17orf53-201ENST00000245382 2272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CGGBP1Q9UFW8 SC5D-202ENST00000392789 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CGGBP1Q9UFW8 NTN4-201ENST00000343702 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CGGBP1Q9UFW8 SDC1-201ENST00000254351 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CGGBP1Q9UFW8 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
CGGBP1Q9UFW8 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CGGBP1Q9UFW8 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
CGGBP1Q9UFW8 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CGGBP1Q9UFW8 SLC19A1-201ENST00000311124 3811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CGGBP1Q9UFW8 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
CGGBP1Q9UFW8 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CGGBP1Q9UFW8 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
CGGBP1Q9UFW8 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
CGGBP1Q9UFW8 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CGGBP1Q9UFW8 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
CGGBP1Q9UFW8 PHYHD1-203ENST00000372592 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
CGGBP1Q9UFW8 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
CGGBP1Q9UFW8 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
CGGBP1Q9UFW8 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
CGGBP1Q9UFW8 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
CGGBP1Q9UFW8 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
CGGBP1Q9UFW8 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
CGGBP1Q9UFW8 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
CGGBP1Q9UFW8 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CGGBP1Q9UFW8 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
CGGBP1Q9UFW8 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
CGGBP1Q9UFW8 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
CGGBP1Q9UFW8 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
CGGBP1Q9UFW8 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
CGGBP1Q9UFW8 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
CGGBP1Q9UFW8 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
CGGBP1Q9UFW8 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
CGGBP1Q9UFW8 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
CGGBP1Q9UFW8 RSPO3-201ENST00000356698 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CGGBP1Q9UFW8 RFTN1-203ENST00000432519 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CGGBP1Q9UFW8 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
CGGBP1Q9UFW8 ENDOV-206ENST00000518901 2549 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
CGGBP1Q9UFW8 XPR1-201ENST00000367589 4126 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CGGBP1Q9UFW8 MSH5-201ENST00000375703 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CGGBP1Q9UFW8 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CGGBP1Q9UFW8 AC011899.2-202ENST00000438047 4302 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CGGBP1Q9UFW8 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
CGGBP1Q9UFW8 DUSP18-204ENST00000403268 2920 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CGGBP1Q9UFW8 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CGGBP1Q9UFW8 AC109583.3-201ENST00000641183 3128 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
CGGBP1Q9UFW8 CBFA2T3-202ENST00000327483 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CGGBP1Q9UFW8 IGF2BP2-202ENST00000382199 3688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CGGBP1Q9UFW8 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CGGBP1Q9UFW8 ADAM12-201ENST00000368676 3313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CGGBP1Q9UFW8 CDH1-213ENST00000612417 2068 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
CGGBP1Q9UFW8 AGRN-201ENST00000379370 7323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CGGBP1Q9UFW8 KDM5B-202ENST00000367264 6449 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CGGBP1Q9UFW8 TAOK2-204ENST00000543033 4072 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CGGBP1Q9UFW8 BTNL8-206ENST00000508408 1717 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CGGBP1Q9UFW8 MST1P2-201ENST00000457982 2291 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
CGGBP1Q9UFW8 MBNL1-205ENST00000355460 5941 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CGGBP1Q9UFW8 MLLT10-201ENST00000307729 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CGGBP1Q9UFW8 STK32B-201ENST00000282908 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CGGBP1Q9UFW8 ARMCX6-208ENST00000539247 1928 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.07□□□□□ -0.32
CGGBP1Q9UFW8 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CGGBP1Q9UFW8 SMTN-223ENST00000619644 3227 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
CGGBP1Q9UFW8 PEX5-207ENST00000455147 2689 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
CGGBP1Q9UFW8 LILRP2-201ENST00000413439 2127 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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