Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP72

RAB18, Ras-related protein Rab-18, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB18Q9NP72 SLC19A1-201ENST00000311124 3811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
RAB18Q9NP72 CALCB-203ENST00000533448 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
RAB18Q9NP72 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
RAB18Q9NP72 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
RAB18Q9NP72 FBXO34-201ENST00000313833 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
RAB18Q9NP72 MAOB-201ENST00000378069 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
RAB18Q9NP72 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
RAB18Q9NP72 AC068888.1-207ENST00000546793 2863 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
RAB18Q9NP72 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
RAB18Q9NP72 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
RAB18Q9NP72 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC12.63□□□□□ -0.39
RAB18Q9NP72 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC12.63□□□□□ -0.39
RAB18Q9NP72 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC12.63□□□□□ -0.39
RAB18Q9NP72 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
RAB18Q9NP72 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
RAB18Q9NP72 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC12.63□□□□□ -0.39
RAB18Q9NP72 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
RAB18Q9NP72 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC12.63□□□□□ -0.39
RAB18Q9NP72 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
RAB18Q9NP72 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC12.63□□□□□ -0.39
RAB18Q9NP72 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC12.63□□□□□ -0.39
RAB18Q9NP72 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
RAB18Q9NP72 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
RAB18Q9NP72 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
RAB18Q9NP72 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
RAB18Q9NP72 CDC25B-205ENST00000439880 3096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
RAB18Q9NP72 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
RAB18Q9NP72 KLHL13-207ENST00000540167 3396 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
RAB18Q9NP72 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
RAB18Q9NP72 SLC26A8-201ENST00000355574 3463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
RAB18Q9NP72 CDHR5-203ENST00000397542 3489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
RAB18Q9NP72 PYGM-202ENST00000377432 2611 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
RAB18Q9NP72 TIGD1-201ENST00000408957 2625 ntAPPRIS P1 BASIC12.63□□□□□ -0.39
RAB18Q9NP72 ZBTB20-215ENST00000481632 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
RAB18Q9NP72 GPSM2-202ENST00000406462 7433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
RAB18Q9NP72 PROM2-203ENST00000403131 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
RAB18Q9NP72 CD48-201ENST00000368045 1793 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
RAB18Q9NP72 NRXN1-222ENST00000625672 8113 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
RAB18Q9NP72 AGO3-201ENST00000246314 3211 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
RAB18Q9NP72 ADAM12-201ENST00000368676 3313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
RAB18Q9NP72 GDPD2-204ENST00000536730 2171 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
RAB18Q9NP72 DLGAP1-213ENST00000534970 2365 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
RAB18Q9NP72 NPR1-202ENST00000368680 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
RAB18Q9NP72 CACNA2D4-220ENST00000585732 2566 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
RAB18Q9NP72 AC108134.1-201ENST00000382225 3061 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
RAB18Q9NP72 MYOM3-202ENST00000374434 5804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
RAB18Q9NP72 TNFRSF1B-201ENST00000376259 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
RAB18Q9NP72 AC244021.1-201ENST00000417218 3662 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
RAB18Q9NP72 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
RAB18Q9NP72 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
RAB18Q9NP72 HLA-DPA1-242ENST00000419277 1704 ntAPPRIS P2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
RAB18Q9NP72 DSN1-207ENST00000448110 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
RAB18Q9NP72 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
RAB18Q9NP72 MAGI2-218ENST00000630991 2349 ntTSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
RAB18Q9NP72 RUSC1-204ENST00000368352 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
RAB18Q9NP72 ADCY3-202ENST00000405392 4397 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
RAB18Q9NP72 SLC4A7-213ENST00000454389 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
RAB18Q9NP72 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
RAB18Q9NP72 BRWD1-201ENST00000333229 10141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
RAB18Q9NP72 APLP2-203ENST00000338167 3270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
RAB18Q9NP72 PTPA-205ENST00000357197 2653 ntTSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
RAB18Q9NP72 SLCO2B1-217ENST00000532236 2593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
RAB18Q9NP72 RASGEF1C-202ENST00000393371 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
RAB18Q9NP72 COL22A1-201ENST00000303045 6346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
RAB18Q9NP72 RRAGB-202ENST00000374941 2061 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
RAB18Q9NP72 NRP2-201ENST00000272849 5909 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
RAB18Q9NP72 FLJ40288-201ENST00000332558 1998 ntTSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
RAB18Q9NP72 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
RAB18Q9NP72 NT5C3A-213ENST00000610140 1670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
RAB18Q9NP72 AFAP1-204ENST00000420658 7768 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
RAB18Q9NP72 COG5-202ENST00000347053 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
RAB18Q9NP72 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
RAB18Q9NP72 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
RAB18Q9NP72 WNT2B-202ENST00000369684 3818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
RAB18Q9NP72 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
RAB18Q9NP72 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
RAB18Q9NP72 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
RAB18Q9NP72 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
RAB18Q9NP72 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
RAB18Q9NP72 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
RAB18Q9NP72 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC12.62□□□□□ -0.39
RAB18Q9NP72 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
RAB18Q9NP72 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC12.62□□□□□ -0.39
RAB18Q9NP72 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
RAB18Q9NP72 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC12.62□□□□□ -0.39
RAB18Q9NP72 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
RAB18Q9NP72 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
RAB18Q9NP72 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
RAB18Q9NP72 BOLL-203ENST00000392296 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
RAB18Q9NP72 AC138894.1-201ENST00000635887 2824 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
RAB18Q9NP72 STIP1-203ENST00000358794 2743 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
RAB18Q9NP72 POFUT1-202ENST00000375749 5235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
RAB18Q9NP72 MED15-203ENST00000382974 2235 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
RAB18Q9NP72 DNER-201ENST00000341772 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
RAB18Q9NP72 LETMD1-235ENST00000552739 1713 ntTSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
RAB18Q9NP72 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
RAB18Q9NP72 RNASEH2C-201ENST00000308418 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
RAB18Q9NP72 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
RAB18Q9NP72 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
RAB18Q9NP72 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.62□□□□□ -0.39
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