Protein–RNA interactions for Protein: P36897

TGFBR1, TGF-beta receptor type-1, humanhuman

Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGFBR1P36897 GIT2-201ENST00000320063 2094 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
TGFBR1P36897 STEAP2-202ENST00000394621 7033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TGFBR1P36897 PLPPR1-201ENST00000374874 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TGFBR1P36897 ADORA2A-AS1-201ENST00000326341 2557 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
TGFBR1P36897 OSBPL1A-201ENST00000319481 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TGFBR1P36897 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TGFBR1P36897 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
TGFBR1P36897 GNG4-202ENST00000366598 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TGFBR1P36897 AC010255.3-203ENST00000509403 1727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TGFBR1P36897 EPHA5-204ENST00000511294 5176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TGFBR1P36897 LINC00665-206ENST00000590622 1749 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TGFBR1P36897 TSPAN31-201ENST00000257910 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TGFBR1P36897 APBB3-202ENST00000356738 1804 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TGFBR1P36897 COG3-206ENST00000617493 1809 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TGFBR1P36897 YY1AP1-208ENST00000361831 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TGFBR1P36897 SPAG9-201ENST00000262013 8273 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TGFBR1P36897 TPO-202ENST00000345913 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TGFBR1P36897 PER1-202ENST00000354903 3115 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TGFBR1P36897 LINC00174-204ENST00000421767 4702 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TGFBR1P36897 MOB3C-203ENST00000371940 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TGFBR1P36897 ADAMTSL2-203ENST00000393061 4270 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TGFBR1P36897 TMEM121B-202ENST00000399875 3961 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TGFBR1P36897 GGA3-214ENST00000582717 2255 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TGFBR1P36897 LDB3-207ENST00000542786 1889 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TGFBR1P36897 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TGFBR1P36897 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
TGFBR1P36897 SLC4A2-201ENST00000392826 3947 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TGFBR1P36897 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TGFBR1P36897 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TGFBR1P36897 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TGFBR1P36897 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TGFBR1P36897 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
TGFBR1P36897 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
TGFBR1P36897 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TGFBR1P36897 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TGFBR1P36897 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TGFBR1P36897 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TGFBR1P36897 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TGFBR1P36897 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TGFBR1P36897 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TGFBR1P36897 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
TGFBR1P36897 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
TGFBR1P36897 NCDN-201ENST00000356090 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TGFBR1P36897 INPP5J-201ENST00000331075 3347 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TGFBR1P36897 PBRM1-204ENST00000394830 5071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TGFBR1P36897 PLAT-201ENST00000220809 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TGFBR1P36897 ABCA2-201ENST00000265662 8154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TGFBR1P36897 ACSM2A-202ENST00000396104 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TGFBR1P36897 PHLDA1-201ENST00000266671 8069 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TGFBR1P36897 HELZ2-204ENST00000467148 8064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TGFBR1P36897 SCAF4-201ENST00000286835 4193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TGFBR1P36897 IKBKB-218ENST00000520835 2403 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TGFBR1P36897 OPN4-201ENST00000241891 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TGFBR1P36897 NXF1-201ENST00000294172 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TGFBR1P36897 DNMT3B-206ENST00000456297 2315 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TGFBR1P36897 PIK3R1-213ENST00000521657 3891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TGFBR1P36897 SLC5A9-210ENST00000533824 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TGFBR1P36897 HIPK3-201ENST00000303296 7408 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TGFBR1P36897 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TGFBR1P36897 MAP2K3-214ENST00000613338 2029 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TGFBR1P36897 NEXN-201ENST00000330010 3195 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TGFBR1P36897 EGFR-206ENST00000454757 5464 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TGFBR1P36897 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
TGFBR1P36897 LCOR-203ENST00000371097 4852 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TGFBR1P36897 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TGFBR1P36897 EXOC3-201ENST00000315013 2682 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TGFBR1P36897 RHOH-220ENST00000615083 2156 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TGFBR1P36897 NCSTN-202ENST00000368063 3031 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TGFBR1P36897 TNFRSF21-201ENST00000296861 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TGFBR1P36897 AC013472.1-203ENST00000380387 1966 ntTSL 4 BASIC13.12□□□□□ -0.31
TGFBR1P36897 PPM1A-203ENST00000395076 8184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TGFBR1P36897 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TGFBR1P36897 ZMYM3-206ENST00000373988 6021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
TGFBR1P36897 TRMT11-201ENST00000334379 1565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TGFBR1P36897 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TGFBR1P36897 TYK2-205ENST00000525621 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TGFBR1P36897 DLGAP3-201ENST00000235180 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
TGFBR1P36897 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TGFBR1P36897 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
TGFBR1P36897 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
TGFBR1P36897 SYT1-204ENST00000457153 4592 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TGFBR1P36897 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
TGFBR1P36897 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
TGFBR1P36897 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TGFBR1P36897 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
TGFBR1P36897 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
TGFBR1P36897 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
TGFBR1P36897 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
TGFBR1P36897 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC13.12□□□□□ -0.31
TGFBR1P36897 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
TGFBR1P36897 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TGFBR1P36897 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
TGFBR1P36897 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
TGFBR1P36897 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC13.12□□□□□ -0.31
TGFBR1P36897 AL445250.1-201ENST00000641671 2259 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
TGFBR1P36897 PRKD1-201ENST00000331968 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TGFBR1P36897 UBE2E2-202ENST00000396703 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TGFBR1P36897 AL022323.5-201ENST00000624101 2059 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
TGFBR1P36897 AL928654.5-201ENST00000624831 2501 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
TGFBR1P36897 RNF14-201ENST00000347642 4213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.7 ms