Protein–RNA interactions for Protein: Q9BST9

RTKN, Rhotekin, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTKNQ9BST9 ZFAND6-222ENST00000613266 1729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RTKNQ9BST9 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RTKNQ9BST9 CENPBD1P1-204ENST00000487264 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RTKNQ9BST9 SLC22A15-202ENST00000369503 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RTKNQ9BST9 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RTKNQ9BST9 ITSN1-210ENST00000399353 3913 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RTKNQ9BST9 LDLR-202ENST00000455727 2333 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RTKNQ9BST9 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RTKNQ9BST9 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RTKNQ9BST9 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RTKNQ9BST9 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RTKNQ9BST9 HOXC12-201ENST00000243103 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RTKNQ9BST9 SYCE2-201ENST00000293695 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RTKNQ9BST9 CIDEC-201ENST00000336832 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RTKNQ9BST9 COL5A1-AS1-201ENST00000371813 336 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RTKNQ9BST9 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RTKNQ9BST9 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RTKNQ9BST9 KRTAP20-4-201ENST00000382828 224 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RTKNQ9BST9 SERF2-206ENST00000409291 807 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RTKNQ9BST9 LIMS4-201ENST00000413601 1215 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RTKNQ9BST9 CIDEC-203ENST00000423850 1036 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RTKNQ9BST9 RPL13AP19-201ENST00000434320 584 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
RTKNQ9BST9 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RTKNQ9BST9 USE1-202ENST00000445667 795 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RTKNQ9BST9 KRT18P66-201ENST00000452970 1269 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
RTKNQ9BST9 CIDEC-206ENST00000455015 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RTKNQ9BST9 AL590640.2-201ENST00000457038 527 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
RTKNQ9BST9 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RTKNQ9BST9 AC246817.2-203ENST00000517357 569 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RTKNQ9BST9 AC246817.2-202ENST00000519393 564 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RTKNQ9BST9 CSTF3-206ENST00000524827 693 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RTKNQ9BST9 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RTKNQ9BST9 UBXN1-214ENST00000533000 367 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RTKNQ9BST9 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RTKNQ9BST9 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RTKNQ9BST9 MIR6756-201ENST00000616240 63 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
RTKNQ9BST9 CASP16P-204ENST00000635032 809 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
RTKNQ9BST9 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RTKNQ9BST9 AL354989.2-201ENST00000435838 1540 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
RTKNQ9BST9 ZC3HAV1-204ENST00000471652 3182 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RTKNQ9BST9 RSPH6A-203ENST00000600188 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RTKNQ9BST9 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RTKNQ9BST9 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RTKNQ9BST9 ARFGAP1-203ENST00000370283 3281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RTKNQ9BST9 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RTKNQ9BST9 SOGA3-201ENST00000465909 3756 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RTKNQ9BST9 TMEM38A-201ENST00000187762 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RTKNQ9BST9 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RTKNQ9BST9 RCSD1-202ENST00000367854 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RTKNQ9BST9 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RTKNQ9BST9 PLA2G4B-202ENST00000458483 2734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RTKNQ9BST9 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RTKNQ9BST9 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RTKNQ9BST9 ZDHHC4-204ENST00000396709 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RTKNQ9BST9 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RTKNQ9BST9 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RTKNQ9BST9 SMARCE1-205ENST00000431889 1569 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RTKNQ9BST9 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RTKNQ9BST9 TJP3-202ENST00000541714 3350 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RTKNQ9BST9 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RTKNQ9BST9 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RTKNQ9BST9 TPO-201ENST00000329066 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RTKNQ9BST9 AL365209.1-201ENST00000624418 6473 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
RTKNQ9BST9 AC104452.1-203ENST00000636166 2266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RTKNQ9BST9 SLC52A3-202ENST00000381944 3060 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RTKNQ9BST9 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RTKNQ9BST9 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RTKNQ9BST9 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RTKNQ9BST9 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RTKNQ9BST9 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RTKNQ9BST9 MGAT1-202ENST00000333055 8863 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RTKNQ9BST9 AFF4-201ENST00000265343 9552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RTKNQ9BST9 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RTKNQ9BST9 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RTKNQ9BST9 BATF-201ENST00000286639 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RTKNQ9BST9 IL27-201ENST00000356897 1044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RTKNQ9BST9 CITED1-202ENST00000373619 886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RTKNQ9BST9 CST9L-201ENST00000376979 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RTKNQ9BST9 MIR1227-201ENST00000408484 88 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
RTKNQ9BST9 AC011742.3-201ENST00000439053 820 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
RTKNQ9BST9 RN7SL8P-201ENST00000461771 266 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
RTKNQ9BST9 AC018680.1-202ENST00000500324 525 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RTKNQ9BST9 GDNF-AS1-201ENST00000503382 604 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RTKNQ9BST9 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RTKNQ9BST9 ANAPC13-205ENST00000511751 896 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RTKNQ9BST9 SAXO2-207ENST00000566861 404 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RTKNQ9BST9 AC005357.2-202ENST00000590507 1060 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
RTKNQ9BST9 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
RTKNQ9BST9 AC073352.2-201ENST00000609385 439 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
RTKNQ9BST9 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RTKNQ9BST9 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RTKNQ9BST9 SLC1A7-206ENST00000620347 2873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RTKNQ9BST9 LINC00639-201ENST00000553932 4496 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RTKNQ9BST9 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RTKNQ9BST9 NELFA-202ENST00000382882 3343 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RTKNQ9BST9 AC008132.1-202ENST00000342005 1389 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
RTKNQ9BST9 COG8-206ENST00000306875 4247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RTKNQ9BST9 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RTKNQ9BST9 SERP1-201ENST00000239944 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RTKNQ9BST9 ABR-228ENST00000574437 3196 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.7 ms