Protein–RNA interactions for Protein: Q13422

IKZF1, DNA-binding protein Ikaros, humanhuman

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Length 519 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IKZF1Q13422 ATXN2L-204ENST00000382686 3739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
IKZF1Q13422 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
IKZF1Q13422 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
IKZF1Q13422 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
IKZF1Q13422 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
IKZF1Q13422 UBE2F-223ENST00000612130 2135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
IKZF1Q13422 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
IKZF1Q13422 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
IKZF1Q13422 PHF8-202ENST00000338154 6062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
IKZF1Q13422 UBA1-201ENST00000335972 3559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
IKZF1Q13422 ZNF782-205ENST00000481138 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
IKZF1Q13422 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
IKZF1Q13422 AL355390.1-201ENST00000325811 2328 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
IKZF1Q13422 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
IKZF1Q13422 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
IKZF1Q13422 TBC1D8-202ENST00000409318 3803 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
IKZF1Q13422 COL4A3-202ENST00000396578 8097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
IKZF1Q13422 PLCB3-202ENST00000325234 3946 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
IKZF1Q13422 ATRN-202ENST00000446916 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
IKZF1Q13422 CRTC1-202ENST00000338797 6929 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
IKZF1Q13422 TP73-207ENST00000378290 1831 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
IKZF1Q13422 MPZ-204ENST00000491222 1824 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
IKZF1Q13422 KCNIP1-208ENST00000520740 1845 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
IKZF1Q13422 ZNF7-203ENST00000525266 1874 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
IKZF1Q13422 PAPPA-201ENST00000328252 10959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
IKZF1Q13422 LPO-203ENST00000421678 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
IKZF1Q13422 AGAP1-201ENST00000304032 10832 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
IKZF1Q13422 HOXA7-201ENST00000242159 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
IKZF1Q13422 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
IKZF1Q13422 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
IKZF1Q13422 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
IKZF1Q13422 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
IKZF1Q13422 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
IKZF1Q13422 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
IKZF1Q13422 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC13.02□□□□□ -0.33
IKZF1Q13422 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
IKZF1Q13422 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
IKZF1Q13422 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
IKZF1Q13422 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
IKZF1Q13422 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
IKZF1Q13422 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
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IKZF1Q13422 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
IKZF1Q13422 ITGAM-202ENST00000544665 4718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
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IKZF1Q13422 MOG-221ENST00000376917 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
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IKZF1Q13422 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
IKZF1Q13422 TLE1-203ENST00000376499 3893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
IKZF1Q13422 ZNRF3-202ENST00000406323 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
IKZF1Q13422 RNF170-209ENST00000534961 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
IKZF1Q13422 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
IKZF1Q13422 RNF220-203ENST00000361799 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
IKZF1Q13422 RNF220-204ENST00000372247 3010 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
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IKZF1Q13422 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
IKZF1Q13422 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
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IKZF1Q13422 TM9SF1-202ENST00000396854 2055 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
IKZF1Q13422 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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IKZF1Q13422 ANK1-205ENST00000347528 8237 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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IKZF1Q13422 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
IKZF1Q13422 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
IKZF1Q13422 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
IKZF1Q13422 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
IKZF1Q13422 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
IKZF1Q13422 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
IKZF1Q13422 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
IKZF1Q13422 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
IKZF1Q13422 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
IKZF1Q13422 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
IKZF1Q13422 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
IKZF1Q13422 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
IKZF1Q13422 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
IKZF1Q13422 CFAP46-202ENST00000368586 8278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
IKZF1Q13422 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
IKZF1Q13422 LRRC34-208ENST00000522830 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
IKZF1Q13422 COL1A2-201ENST00000297268 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
IKZF1Q13422 B3GAT1-203ENST00000524765 5737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
IKZF1Q13422 PSEN2-202ENST00000366783 2306 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
IKZF1Q13422 ST3GAL5-203ENST00000393805 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
IKZF1Q13422 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
IKZF1Q13422 AP001972.5-201ENST00000624624 2338 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
IKZF1Q13422 PDHX-201ENST00000227868 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
IKZF1Q13422 CRMP1-205ENST00000512574 2764 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
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