Protein–RNA interactions for Protein: Q08209

PPP3CA, Serine/threonine-protein phosphatase 2B catalytic subunit alpha isoform, humanhuman

Predictions only

Length 521 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP3CAQ08209 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PPP3CAQ08209 RAB37-216ENST00000613645 1653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PPP3CAQ08209 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PPP3CAQ08209 OSBPL5-203ENST00000389989 3619 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PPP3CAQ08209 SRRD-201ENST00000215917 4020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PPP3CAQ08209 SDCBP2-AS1-201ENST00000446423 1811 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PPP3CAQ08209 C1orf228-218ENST00000458657 1818 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PPP3CAQ08209 KIAA1211L-201ENST00000397899 3907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PPP3CAQ08209 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PPP3CAQ08209 HYOU1-218ENST00000614668 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PPP3CAQ08209 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PPP3CAQ08209 GPR132-203ENST00000539291 2779 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PPP3CAQ08209 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PPP3CAQ08209 PRKD1-202ENST00000415220 3189 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PPP3CAQ08209 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PPP3CAQ08209 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PPP3CAQ08209 TSPAN18-207ENST00000520358 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PPP3CAQ08209 TNN-203ENST00000622870 3719 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PPP3CAQ08209 USP4-203ENST00000415188 1454 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PPP3CAQ08209 CUX1-215ENST00000556210 4044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PPP3CAQ08209 CACTIN-203ENST00000429344 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PPP3CAQ08209 GGACT-201ENST00000376250 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PPP3CAQ08209 GRK6-211ENST00000528793 2571 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PPP3CAQ08209 ZFP36-203ENST00000597629 1786 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PPP3CAQ08209 LINC00299-202ENST00000442956 2342 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PPP3CAQ08209 ATE1-203ENST00000369043 4900 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PPP3CAQ08209 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PPP3CAQ08209 AP000552.1-203ENST00000416615 1930 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PPP3CAQ08209 GCLM-204ENST00000615724 3008 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PPP3CAQ08209 TIGD1-201ENST00000408957 2625 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PPP3CAQ08209 SNRPN-202ENST00000390687 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PPP3CAQ08209 SLCO2B1-203ENST00000428359 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PPP3CAQ08209 SLC7A8-212ENST00000529705 1819 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PPP3CAQ08209 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PPP3CAQ08209 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PPP3CAQ08209 AC007240.1-201ENST00000641498 1996 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PPP3CAQ08209 CUX1-214ENST00000550008 4350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PPP3CAQ08209 CICP16-201ENST00000502609 2813 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
PPP3CAQ08209 BST2-201ENST00000252593 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PPP3CAQ08209 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PPP3CAQ08209 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
PPP3CAQ08209 FZR1-201ENST00000313639 1215 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PPP3CAQ08209 ANAPC11-202ENST00000357385 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PPP3CAQ08209 PRAF2-201ENST00000376386 801 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PPP3CAQ08209 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PPP3CAQ08209 ATP6V1E1-202ENST00000399796 1208 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PPP3CAQ08209 LINC00278-201ENST00000425031 528 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PPP3CAQ08209 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PPP3CAQ08209 RNF216P1-213ENST00000494947 946 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PPP3CAQ08209 SBSN-202ENST00000518157 957 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PPP3CAQ08209 RNF41-210ENST00000552244 716 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PPP3CAQ08209 C1QTNF1-AS1-202ENST00000581579 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PPP3CAQ08209 TNNT1-212ENST00000588981 1163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PPP3CAQ08209 COPS9-205ENST00000607357 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PPP3CAQ08209 PHF14-215ENST00000634607 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PPP3CAQ08209 UBASH3A-203ENST00000398367 1733 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PPP3CAQ08209 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PPP3CAQ08209 ANKRD13B-201ENST00000394859 3214 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PPP3CAQ08209 ZNF84-215ENST00000543758 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PPP3CAQ08209 AC093520.1-201ENST00000567545 1767 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PPP3CAQ08209 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PPP3CAQ08209 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
PPP3CAQ08209 DPY19L2P2-201ENST00000312132 4078 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
PPP3CAQ08209 PUS1-202ENST00000376649 4094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
PPP3CAQ08209 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PPP3CAQ08209 MAX-219ENST00000618858 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PPP3CAQ08209 PIGT-203ENST00000372689 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PPP3CAQ08209 CTNND2-202ENST00000458100 1962 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PPP3CAQ08209 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PPP3CAQ08209 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PPP3CAQ08209 CD48-203ENST00000613788 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PPP3CAQ08209 CRCP-201ENST00000338592 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PPP3CAQ08209 SLC44A2-201ENST00000335757 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PPP3CAQ08209 NICN1-201ENST00000273598 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PPP3CAQ08209 TMEM117-207ENST00000551577 2643 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PPP3CAQ08209 TBCE-202ENST00000406207 2012 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PPP3CAQ08209 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PPP3CAQ08209 GLUL-203ENST00000339526 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PPP3CAQ08209 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PPP3CAQ08209 KIAA1683-209ENST00000612316 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PPP3CAQ08209 UBXN11-202ENST00000357089 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PPP3CAQ08209 DLX4-202ENST00000411890 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PPP3CAQ08209 RNF167-214ENST00000576229 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PPP3CAQ08209 KRTAP19-7-201ENST00000334849 440 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PPP3CAQ08209 AK6-201ENST00000380818 1183 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PPP3CAQ08209 MORN2-204ENST00000409665 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PPP3CAQ08209 Z82198.1-201ENST00000447396 437 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PPP3CAQ08209 BNIP3P42-201ENST00000454982 569 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
PPP3CAQ08209 AC010973.2-201ENST00000485974 1230 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PPP3CAQ08209 AC080188.2-201ENST00000508985 552 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PPP3CAQ08209 C8orf37-AS1-202ENST00000517655 562 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PPP3CAQ08209 ACR-203ENST00000529621 708 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PPP3CAQ08209 MT1H-202ENST00000569155 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PPP3CAQ08209 CYGB-203ENST00000589145 788 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PPP3CAQ08209 AC009955.4-201ENST00000597192 544 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
PPP3CAQ08209 BNIP3P29-201ENST00000598302 571 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
PPP3CAQ08209 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PPP3CAQ08209 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PPP3CAQ08209 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
PPP3CAQ08209 AC011447.5-201ENST00000616168 564 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 98 ms