Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMY3

SPOCD1, SPOC domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPOCD1Q6ZMY3 TFR2-201ENST00000223051 2888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPOCD1Q6ZMY3 AMIGO2-201ENST00000266581 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPOCD1Q6ZMY3 SYMPK-213ENST00000599460 5449 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPOCD1Q6ZMY3 ARHGEF1-202ENST00000347545 3091 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPOCD1Q6ZMY3 CNN2-201ENST00000263097 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPOCD1Q6ZMY3 CNN2-205ENST00000562958 2194 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPOCD1Q6ZMY3 MSH5-201ENST00000375703 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPOCD1Q6ZMY3 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPOCD1Q6ZMY3 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPOCD1Q6ZMY3 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPOCD1Q6ZMY3 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPOCD1Q6ZMY3 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPOCD1Q6ZMY3 Z82198.1-201ENST00000447396 437 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPOCD1Q6ZMY3 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SPOCD1Q6ZMY3 AC106760.1-201ENST00000508690 800 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SPOCD1Q6ZMY3 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPOCD1Q6ZMY3 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPOCD1Q6ZMY3 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPOCD1Q6ZMY3 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPOCD1Q6ZMY3 AC044839.1-204ENST00000634777 1058 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPOCD1Q6ZMY3 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPOCD1Q6ZMY3 DHRS4-AS1-204ENST00000555045 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPOCD1Q6ZMY3 MARVELD3-201ENST00000268485 2912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPOCD1Q6ZMY3 FAM163A-201ENST00000341785 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPOCD1Q6ZMY3 DNAJC21-202ENST00000382021 6208 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPOCD1Q6ZMY3 MAGEA2-203ENST00000611557 2024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPOCD1Q6ZMY3 B3GNT7-201ENST00000287590 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPOCD1Q6ZMY3 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPOCD1Q6ZMY3 SEPT6-204ENST00000360156 2609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPOCD1Q6ZMY3 AC139712.1-201ENST00000378256 1875 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SPOCD1Q6ZMY3 MARK3-205ENST00000429436 3371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPOCD1Q6ZMY3 SDR42E2-201ENST00000602312 2630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPOCD1Q6ZMY3 GGACT-201ENST00000376250 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPOCD1Q6ZMY3 PLCXD2-201ENST00000393934 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPOCD1Q6ZMY3 WDR45-224ENST00000485908 1301 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPOCD1Q6ZMY3 ZNF607-201ENST00000355202 4364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPOCD1Q6ZMY3 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPOCD1Q6ZMY3 TSPAN11-201ENST00000261177 5505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPOCD1Q6ZMY3 POLL-204ENST00000370168 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPOCD1Q6ZMY3 SNPH-202ENST00000381873 4995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPOCD1Q6ZMY3 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPOCD1Q6ZMY3 FOXL1-201ENST00000320241 3655 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPOCD1Q6ZMY3 SMTN-202ENST00000347557 3130 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPOCD1Q6ZMY3 ITSN1-210ENST00000399353 3913 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPOCD1Q6ZMY3 NMBR-201ENST00000258042 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPOCD1Q6ZMY3 CHDH-201ENST00000315251 7665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPOCD1Q6ZMY3 GDF9-201ENST00000296875 1796 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPOCD1Q6ZMY3 KHSRPP1-201ENST00000427983 1768 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SPOCD1Q6ZMY3 RNF166-210ENST00000568683 1768 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPOCD1Q6ZMY3 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPOCD1Q6ZMY3 SMOC2-201ENST00000354536 3150 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPOCD1Q6ZMY3 C12orf49-201ENST00000261318 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPOCD1Q6ZMY3 FGFR1-204ENST00000356207 3824 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPOCD1Q6ZMY3 NICN1-201ENST00000273598 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPOCD1Q6ZMY3 COL6A2-201ENST00000300527 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPOCD1Q6ZMY3 SMG8-201ENST00000300917 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPOCD1Q6ZMY3 DDR1-271ENST00000513240 2882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPOCD1Q6ZMY3 NAALADL1-204ENST00000358658 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPOCD1Q6ZMY3 KIF7-201ENST00000394412 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPOCD1Q6ZMY3 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPOCD1Q6ZMY3 AC239800.3-201ENST00000424684 5243 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPOCD1Q6ZMY3 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPOCD1Q6ZMY3 MROH1-209ENST00000534366 5092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPOCD1Q6ZMY3 TRAFD1-201ENST00000257604 3178 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPOCD1Q6ZMY3 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPOCD1Q6ZMY3 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPOCD1Q6ZMY3 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPOCD1Q6ZMY3 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPOCD1Q6ZMY3 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPOCD1Q6ZMY3 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPOCD1Q6ZMY3 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPOCD1Q6ZMY3 TMEM14B-204ENST00000461342 559 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPOCD1Q6ZMY3 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPOCD1Q6ZMY3 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPOCD1Q6ZMY3 BX088702.1-201ENST00000610784 235 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SPOCD1Q6ZMY3 ARID1B-222ENST00000637003 1290 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPOCD1Q6ZMY3 AL359881.3-201ENST00000602640 1721 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SPOCD1Q6ZMY3 CHD4-201ENST00000357008 6496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPOCD1Q6ZMY3 ATP6V0A1-203ENST00000393829 3028 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPOCD1Q6ZMY3 AC004890.2-205ENST00000416232 2804 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPOCD1Q6ZMY3 AL139260.2-201ENST00000622355 2171 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPOCD1Q6ZMY3 SIGLECL1-208ENST00000614422 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPOCD1Q6ZMY3 PDE8A-203ENST00000394553 3912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPOCD1Q6ZMY3 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPOCD1Q6ZMY3 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPOCD1Q6ZMY3 MKNK1-204ENST00000371946 2719 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPOCD1Q6ZMY3 STOML1-206ENST00000561656 1833 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPOCD1Q6ZMY3 ABCG1-205ENST00000398449 2998 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPOCD1Q6ZMY3 RET-201ENST00000340058 4149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPOCD1Q6ZMY3 KMT2E-201ENST00000257745 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPOCD1Q6ZMY3 TMEM181-201ENST00000367090 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SPOCD1Q6ZMY3 SBF1P1-201ENST00000444527 5631 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SPOCD1Q6ZMY3 MPP2-214ENST00000523501 2121 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SPOCD1Q6ZMY3 GAL3ST4-202ENST00000411994 1404 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SPOCD1Q6ZMY3 WNT9B-202ENST00000393461 2654 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SPOCD1Q6ZMY3 SPATS2L-209ENST00000409988 2698 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SPOCD1Q6ZMY3 WNT3A-201ENST00000284523 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SPOCD1Q6ZMY3 TRIM67-201ENST00000366653 3936 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SPOCD1Q6ZMY3 CSAD-203ENST00000379846 1962 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SPOCD1Q6ZMY3 CTNND2-202ENST00000458100 1962 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.7 ms