Protein–RNA interactions for Protein: Q8N3C7

CLIP4, CAP-Gly domain-containing linker protein 4, humanhuman

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Length 705 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP4Q8N3C7 RNASEH2C-201ENST00000308418 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
CLIP4Q8N3C7 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
CLIP4Q8N3C7 ATP8B3-201ENST00000310127 5095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
CLIP4Q8N3C7 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
CLIP4Q8N3C7 LMNA-213ENST00000473598 2015 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
CLIP4Q8N3C7 ARHGAP45-201ENST00000313093 4273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
CLIP4Q8N3C7 OPRL1-203ENST00000355631 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
CLIP4Q8N3C7 NDUFC2-201ENST00000281031 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
CLIP4Q8N3C7 FAAP100-201ENST00000327787 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
CLIP4Q8N3C7 ZBTB1-201ENST00000358738 4119 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
CLIP4Q8N3C7 PAPD7-207ENST00000631941 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
CLIP4Q8N3C7 CORO7-201ENST00000251166 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
CLIP4Q8N3C7 LOXL3-202ENST00000393937 2398 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
CLIP4Q8N3C7 SLC7A4-202ENST00000403586 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
CLIP4Q8N3C7 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
CLIP4Q8N3C7 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
CLIP4Q8N3C7 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
CLIP4Q8N3C7 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC14□□□□□ -0.17
CLIP4Q8N3C7 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
CLIP4Q8N3C7 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
CLIP4Q8N3C7 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
CLIP4Q8N3C7 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC14□□□□□ -0.17
CLIP4Q8N3C7 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
CLIP4Q8N3C7 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
CLIP4Q8N3C7 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
CLIP4Q8N3C7 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
CLIP4Q8N3C7 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
CLIP4Q8N3C7 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
CLIP4Q8N3C7 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
CLIP4Q8N3C7 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
CLIP4Q8N3C7 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
CLIP4Q8N3C7 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
CLIP4Q8N3C7 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
CLIP4Q8N3C7 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
CLIP4Q8N3C7 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
CLIP4Q8N3C7 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
CLIP4Q8N3C7 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
CLIP4Q8N3C7 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
CLIP4Q8N3C7 PRDM16-206ENST00000511072 4282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
CLIP4Q8N3C7 SFSWAP-201ENST00000261674 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
CLIP4Q8N3C7 ZNF619-201ENST00000314686 2233 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
CLIP4Q8N3C7 PRKD1-202ENST00000415220 3189 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
CLIP4Q8N3C7 LINC00163-201ENST00000434081 2155 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
CLIP4Q8N3C7 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
CLIP4Q8N3C7 AP001267.2-201ENST00000532619 2086 ntBASIC14□□□□□ -0.17
CLIP4Q8N3C7 LRRC41-201ENST00000343304 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
CLIP4Q8N3C7 DRC3-203ENST00000399187 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
CLIP4Q8N3C7 HOXA3-207ENST00000612286 3396 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
CLIP4Q8N3C7 ACTR10-201ENST00000254286 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
CLIP4Q8N3C7 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
CLIP4Q8N3C7 MAP3K4-204ENST00000392142 5490 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
CLIP4Q8N3C7 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
CLIP4Q8N3C7 HIST3H2BB-201ENST00000620438 2364 ntAPPRIS P1 BASIC14□□□□□ -0.17
CLIP4Q8N3C7 AC073869.1-201ENST00000415574 2762 ntBASIC14□□□□□ -0.17
CLIP4Q8N3C7 TNFRSF11A-201ENST00000269485 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CLIP4Q8N3C7 SUGP2-214ENST00000600377 4752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CLIP4Q8N3C7 PLAU-202ENST00000446342 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CLIP4Q8N3C7 ADD3-202ENST00000356080 3081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CLIP4Q8N3C7 MYH14-201ENST00000262269 3848 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CLIP4Q8N3C7 PPIL2-202ENST00000398831 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CLIP4Q8N3C7 TFR2-201ENST00000223051 2888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
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CLIP4Q8N3C7 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
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CLIP4Q8N3C7 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
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CLIP4Q8N3C7 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
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CLIP4Q8N3C7 ITGAM-202ENST00000544665 4718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CLIP4Q8N3C7 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CLIP4Q8N3C7 NFATC4-207ENST00000553469 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CLIP4Q8N3C7 SLC12A7-201ENST00000264930 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CLIP4Q8N3C7 MFAP3-201ENST00000322602 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CLIP4Q8N3C7 DNAJB6-201ENST00000262177 2527 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CLIP4Q8N3C7 PRNP-203ENST00000430350 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CLIP4Q8N3C7 FAM213A-205ENST00000606162 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CLIP4Q8N3C7 ADAMTS10-201ENST00000270328 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CLIP4Q8N3C7 ARHGAP45-202ENST00000539243 4184 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CLIP4Q8N3C7 KIF1A-201ENST00000320389 8832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CLIP4Q8N3C7 PRKD1-209ENST00000616995 3498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CLIP4Q8N3C7 AKAP12-204ENST00000402676 8432 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CLIP4Q8N3C7 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
CLIP4Q8N3C7 AP001627.1-201ENST00000437426 1754 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CLIP4Q8N3C7 ST6GAL1-201ENST00000169298 4645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CLIP4Q8N3C7 FIG4-201ENST00000230124 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
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