Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTR0

NLRP9, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 991 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP9Q7RTR0 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NLRP9Q7RTR0 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NLRP9Q7RTR0 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NLRP9Q7RTR0 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NLRP9Q7RTR0 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NLRP9Q7RTR0 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
NLRP9Q7RTR0 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
NLRP9Q7RTR0 OR2V1-202ENST00000641318 2665 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NLRP9Q7RTR0 PHLDB2-203ENST00000412622 5996 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NLRP9Q7RTR0 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NLRP9Q7RTR0 GOPC-201ENST00000052569 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NLRP9Q7RTR0 UNC5B-202ENST00000373192 6451 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NLRP9Q7RTR0 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NLRP9Q7RTR0 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NLRP9Q7RTR0 PRNP-203ENST00000430350 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NLRP9Q7RTR0 NUP98-203ENST00000359171 7023 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NLRP9Q7RTR0 BLK-201ENST00000259089 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NLRP9Q7RTR0 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NLRP9Q7RTR0 CAMSAP1-203ENST00000409386 5730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NLRP9Q7RTR0 DBN1-203ENST00000393565 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NLRP9Q7RTR0 ARPC4-TTLL3-201ENST00000397256 2466 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NLRP9Q7RTR0 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NLRP9Q7RTR0 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NLRP9Q7RTR0 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NLRP9Q7RTR0 HECW1-203ENST00000453890 5169 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NLRP9Q7RTR0 LRRC20-204ENST00000373224 3095 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NLRP9Q7RTR0 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NLRP9Q7RTR0 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NLRP9Q7RTR0 MAOB-201ENST00000378069 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NLRP9Q7RTR0 FES-202ENST00000394300 2302 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NLRP9Q7RTR0 GAK-214ENST00000511163 4280 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NLRP9Q7RTR0 PLCXD2-201ENST00000393934 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NLRP9Q7RTR0 FHDC1-202ENST00000511601 6583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NLRP9Q7RTR0 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NLRP9Q7RTR0 CACNA2D1-201ENST00000356253 3858 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NLRP9Q7RTR0 PNPLA5-204ENST00000593866 2197 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NLRP9Q7RTR0 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NLRP9Q7RTR0 ABHD16A-202ENST00000440843 1906 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NLRP9Q7RTR0 LINC00887-202ENST00000414120 2880 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NLRP9Q7RTR0 SC5D-202ENST00000392789 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NLRP9Q7RTR0 AGO3-201ENST00000246314 3211 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NLRP9Q7RTR0 TCAF1-205ENST00000479870 5733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NLRP9Q7RTR0 PLK2-201ENST00000274289 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NLRP9Q7RTR0 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NLRP9Q7RTR0 AC244021.1-201ENST00000417218 3662 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NLRP9Q7RTR0 PDE4A-209ENST00000592685 2707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NLRP9Q7RTR0 AC023632.2-201ENST00000523011 1789 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NLRP9Q7RTR0 LINC01225-202ENST00000562339 2113 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NLRP9Q7RTR0 RET-201ENST00000340058 4149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NLRP9Q7RTR0 CICP8-201ENST00000455800 2813 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
NLRP9Q7RTR0 ENDOU-203ENST00000545824 1513 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NLRP9Q7RTR0 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NLRP9Q7RTR0 APBA1-201ENST00000265381 6534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NLRP9Q7RTR0 AC007920.1-201ENST00000356133 2674 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NLRP9Q7RTR0 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NLRP9Q7RTR0 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NLRP9Q7RTR0 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
NLRP9Q7RTR0 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
NLRP9Q7RTR0 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NLRP9Q7RTR0 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
NLRP9Q7RTR0 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
NLRP9Q7RTR0 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NLRP9Q7RTR0 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NLRP9Q7RTR0 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NLRP9Q7RTR0 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NLRP9Q7RTR0 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NLRP9Q7RTR0 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NLRP9Q7RTR0 AC092634.8-201ENST00000639687 773 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NLRP9Q7RTR0 PTGES3-207ENST00000614328 2077 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NLRP9Q7RTR0 ENDOV-206ENST00000518901 2549 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NLRP9Q7RTR0 CCNJ-201ENST00000265992 4115 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NLRP9Q7RTR0 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NLRP9Q7RTR0 LRRK1-201ENST00000388948 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NLRP9Q7RTR0 PEX5L-215ENST00000485199 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NLRP9Q7RTR0 TRIM46-210ENST00000545012 2979 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NLRP9Q7RTR0 GOLGA2-212ENST00000609374 2973 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NLRP9Q7RTR0 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NLRP9Q7RTR0 SH3BP5L-201ENST00000366472 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NLRP9Q7RTR0 SPRY2-201ENST00000377102 2708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NLRP9Q7RTR0 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NLRP9Q7RTR0 RILPL1-202ENST00000376874 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NLRP9Q7RTR0 PCDHA9-202ENST00000532602 6293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NLRP9Q7RTR0 CRMP1-205ENST00000512574 2764 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NLRP9Q7RTR0 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NLRP9Q7RTR0 NYNRIN-201ENST00000382554 7857 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NLRP9Q7RTR0 PHLDA1-201ENST00000266671 8069 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NLRP9Q7RTR0 RUSC1-204ENST00000368352 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NLRP9Q7RTR0 FBN3-205ENST00000600128 9362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NLRP9Q7RTR0 ARHGEF1-202ENST00000347545 3091 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NLRP9Q7RTR0 MYRF-203ENST00000389602 2052 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NLRP9Q7RTR0 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NLRP9Q7RTR0 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NLRP9Q7RTR0 ST7L-202ENST00000358039 4528 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NLRP9Q7RTR0 CNOT9-201ENST00000273064 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NLRP9Q7RTR0 ZNF718-202ENST00000609714 2772 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NLRP9Q7RTR0 MN1-201ENST00000302326 7556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NLRP9Q7RTR0 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NLRP9Q7RTR0 EPHB4-210ENST00000616502 3737 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NLRP9Q7RTR0 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NLRP9Q7RTR0 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45 ms