Protein–RNA interactions for Protein: Q15834

CCDC85B, Coiled-coil domain-containing protein 85B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 202 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85BQ15834 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC85BQ15834 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC85BQ15834 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC85BQ15834 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC85BQ15834 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC85BQ15834 SMARCA4-207ENST00000541122 5139 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC85BQ15834 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC85BQ15834 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC85BQ15834 KRT8P31-201ENST00000504812 1408 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC85BQ15834 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC85BQ15834 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC85BQ15834 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC85BQ15834 RPP14-202ENST00000445193 7985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC85BQ15834 KIAA0513-207ENST00000567328 1873 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC85BQ15834 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC85BQ15834 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC85BQ15834 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC85BQ15834 CYP4F23P-201ENST00000593402 1579 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC85BQ15834 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC85BQ15834 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC85BQ15834 PDE9A-208ENST00000398225 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC85BQ15834 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC85BQ15834 HIST1H2AE-201ENST00000303910 509 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC85BQ15834 RNA5SP359-201ENST00000364838 113 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC85BQ15834 SLC50A1-202ENST00000368401 1166 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC85BQ15834 AL390778.2-201ENST00000420883 886 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC85BQ15834 DMKN-256ENST00000492341 738 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC85BQ15834 ROPN1B-203ENST00000505382 713 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC85BQ15834 AC114947.1-202ENST00000514136 344 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC85BQ15834 AC130456.3-201ENST00000561762 633 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC85BQ15834 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC85BQ15834 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC85BQ15834 ASCC2-201ENST00000307790 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC85BQ15834 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC85BQ15834 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC85BQ15834 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC85BQ15834 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC85BQ15834 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC85BQ15834 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC85BQ15834 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC85BQ15834 GRM1-201ENST00000282753 6622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC85BQ15834 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC85BQ15834 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC85BQ15834 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC85BQ15834 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC85BQ15834 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC85BQ15834 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC85BQ15834 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC85BQ15834 INO80-201ENST00000361937 6439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC85BQ15834 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC85BQ15834 SNX19-201ENST00000265909 6535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC85BQ15834 ITSN1-212ENST00000399367 5722 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC85BQ15834 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CCDC85BQ15834 RAB11FIP1-201ENST00000287263 6253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CCDC85BQ15834 AC021305.1-201ENST00000520656 1514 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
CCDC85BQ15834 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CCDC85BQ15834 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CCDC85BQ15834 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CCDC85BQ15834 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CCDC85BQ15834 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CCDC85BQ15834 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CCDC85BQ15834 LINC00513-201ENST00000447430 1616 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CCDC85BQ15834 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC85BQ15834 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC85BQ15834 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC85BQ15834 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC85BQ15834 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC85BQ15834 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC85BQ15834 ABHD4-201ENST00000216327 716 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC85BQ15834 C2orf70-201ENST00000329615 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC85BQ15834 CMTM5-202ENST00000342473 725 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC85BQ15834 UQCC2-201ENST00000374214 432 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC85BQ15834 MIR566-201ENST00000385187 94 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC85BQ15834 CMTM5-205ENST00000397227 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC85BQ15834 PHACTR2-204ENST00000397980 745 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC85BQ15834 RN7SKP109-201ENST00000410592 316 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC85BQ15834 NAA60-205ENST00000424546 1149 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC85BQ15834 HMGB3-204ENST00000448905 812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC85BQ15834 RN7SL494P-201ENST00000461517 304 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC85BQ15834 MRPS36-204ENST00000512880 1200 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC85BQ15834 PRR7-AS1-204ENST00000514846 543 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC85BQ15834 CMTM5-208ENST00000555731 831 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC85BQ15834 MIR3188-201ENST00000583494 85 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC85BQ15834 TMEM205-210ENST00000588560 840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC85BQ15834 MRPS36-205ENST00000602380 1200 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC85BQ15834 AL078590.3-205ENST00000606039 465 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC85BQ15834 AL136040.2-201ENST00000618431 1130 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC85BQ15834 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC85BQ15834 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC85BQ15834 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC85BQ15834 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC85BQ15834 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC85BQ15834 CTSL-201ENST00000340342 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC85BQ15834 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC85BQ15834 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC85BQ15834 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC85BQ15834 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC85BQ15834 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC85BQ15834 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC85BQ15834 TMPRSS4-211ENST00000522307 1634 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
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