Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRA2

TXNDC17, Thioredoxin domain-containing protein 17, humanhuman

Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TXNDC17Q9BRA2 CRACR2A-203ENST00000440314 2697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
TXNDC17Q9BRA2 DNMT3B-202ENST00000328111 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
TXNDC17Q9BRA2 INO80-202ENST00000401393 5991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
TXNDC17Q9BRA2 LRCH3-206ENST00000438796 7394 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
TXNDC17Q9BRA2 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
TXNDC17Q9BRA2 RMDN3-201ENST00000260385 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
TXNDC17Q9BRA2 CELF2-206ENST00000608830 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
TXNDC17Q9BRA2 FAM124B-201ENST00000243806 2030 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
TXNDC17Q9BRA2 TRIM56-201ENST00000306085 10952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
TXNDC17Q9BRA2 TRPV1-206ENST00000571088 4105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
TXNDC17Q9BRA2 MFAP3-201ENST00000322602 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
TXNDC17Q9BRA2 TAGLN-207ENST00000532870 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
TXNDC17Q9BRA2 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
TXNDC17Q9BRA2 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
TXNDC17Q9BRA2 NLRX1-204ENST00000409991 3716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
TXNDC17Q9BRA2 KIAA1217-209ENST00000430453 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
TXNDC17Q9BRA2 KIAA1217-211ENST00000458595 5977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
TXNDC17Q9BRA2 LDB3-202ENST00000361373 5297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
TXNDC17Q9BRA2 GPR4-201ENST00000323040 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
TXNDC17Q9BRA2 ATP13A1-202ENST00000357324 3861 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
TXNDC17Q9BRA2 SPATA7-217ENST00000556553 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
TXNDC17Q9BRA2 SMOC2-201ENST00000354536 3150 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
TXNDC17Q9BRA2 OAS3-201ENST00000228928 6719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
TXNDC17Q9BRA2 SPPL2B-209ENST00000613503 3456 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
TXNDC17Q9BRA2 ST3GAL2-202ENST00000393640 8872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
TXNDC17Q9BRA2 FGF12-207ENST00000454309 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
TXNDC17Q9BRA2 AC008429.1-202ENST00000518818 2067 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
TXNDC17Q9BRA2 GNPNAT1-203ENST00000554230 2238 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
TXNDC17Q9BRA2 C9orf47-203ENST00000375851 4837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
TXNDC17Q9BRA2 MAP3K4-203ENST00000366920 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
TXNDC17Q9BRA2 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
TXNDC17Q9BRA2 TEX44-201ENST00000313965 1383 ntAPPRIS P1 BASIC11.56□□□□□ -0.56
TXNDC17Q9BRA2 FAM200B-201ENST00000422728 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
TXNDC17Q9BRA2 RPGRIP1-210ENST00000556336 2955 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
TXNDC17Q9BRA2 PLXNA1-201ENST00000393409 9066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
TXNDC17Q9BRA2 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
TXNDC17Q9BRA2 RAVER1-206ENST00000611074 3586 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
TXNDC17Q9BRA2 RNF157-AS1-204ENST00000590137 1812 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
TXNDC17Q9BRA2 ADAMTSL4-203ENST00000369039 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
TXNDC17Q9BRA2 MX1-202ENST00000398598 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
TXNDC17Q9BRA2 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
TXNDC17Q9BRA2 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
TXNDC17Q9BRA2 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
TXNDC17Q9BRA2 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC11.56□□□□□ -0.56
TXNDC17Q9BRA2 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
TXNDC17Q9BRA2 HPCAL4-201ENST00000372844 4856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
TXNDC17Q9BRA2 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC11.56□□□□□ -0.56
TXNDC17Q9BRA2 RTFDC1-203ENST00000395881 1572 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
TXNDC17Q9BRA2 MICB-202ENST00000399150 2346 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
TXNDC17Q9BRA2 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
TXNDC17Q9BRA2 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
TXNDC17Q9BRA2 ADAM17-203ENST00000497134 1873 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
TXNDC17Q9BRA2 DNAJC3-AS1-201ENST00000499499 2908 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
TXNDC17Q9BRA2 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC11.56□□□□□ -0.56
TXNDC17Q9BRA2 TBC1D9B-208ENST00000519746 2755 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
TXNDC17Q9BRA2 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
TXNDC17Q9BRA2 AMT-221ENST00000538581 2038 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
TXNDC17Q9BRA2 HPD-204ENST00000543163 1709 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
TXNDC17Q9BRA2 PRAME-214ENST00000543184 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
TXNDC17Q9BRA2 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
TXNDC17Q9BRA2 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
TXNDC17Q9BRA2 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
TXNDC17Q9BRA2 ACTG1-206ENST00000573283 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
TXNDC17Q9BRA2 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
TXNDC17Q9BRA2 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
TXNDC17Q9BRA2 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
TXNDC17Q9BRA2 PKP1-203ENST00000367324 5384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
TXNDC17Q9BRA2 MUC1-223ENST00000611571 4170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
TXNDC17Q9BRA2 ZNF251-201ENST00000292562 2807 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
TXNDC17Q9BRA2 APBB1-203ENST00000389906 2684 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
TXNDC17Q9BRA2 TMEM25-204ENST00000359862 2395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
TXNDC17Q9BRA2 ERICH6-201ENST00000295910 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
TXNDC17Q9BRA2 RHPN1-AS1-201ENST00000518049 1918 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
TXNDC17Q9BRA2 LINC01285-204ENST00000634601 1947 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
TXNDC17Q9BRA2 NEFH-201ENST00000310624 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
TXNDC17Q9BRA2 PEAR1-201ENST00000292357 4866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
TXNDC17Q9BRA2 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
TXNDC17Q9BRA2 SNED1-201ENST00000310397 8174 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
TXNDC17Q9BRA2 ATG13-215ENST00000529655 2566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
TXNDC17Q9BRA2 PTPRVP-205ENST00000641549 5067 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
TXNDC17Q9BRA2 AMT-201ENST00000273588 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
TXNDC17Q9BRA2 PGAM1P5-202ENST00000552554 2148 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
TXNDC17Q9BRA2 MAP7-201ENST00000354570 4152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
TXNDC17Q9BRA2 HELLS-202ENST00000348459 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
TXNDC17Q9BRA2 ELAVL4-207ENST00000448907 1951 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
TXNDC17Q9BRA2 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
TXNDC17Q9BRA2 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
TXNDC17Q9BRA2 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
TXNDC17Q9BRA2 NTNG1-204ENST00000370067 4628 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
TXNDC17Q9BRA2 PNMA5-205ENST00000535214 3198 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
TXNDC17Q9BRA2 HIC2-203ENST00000443632 6940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
TXNDC17Q9BRA2 AGAP5-201ENST00000374094 2394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
TXNDC17Q9BRA2 SF1-201ENST00000227503 2850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
TXNDC17Q9BRA2 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
TXNDC17Q9BRA2 ADGRG6-202ENST00000296932 6849 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
TXNDC17Q9BRA2 SPATA20-227ENST00000634597 2587 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
TXNDC17Q9BRA2 RMDN1-201ENST00000406452 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
TXNDC17Q9BRA2 CTIF-202ENST00000382998 4407 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
TXNDC17Q9BRA2 TCN2-202ENST00000405742 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
TXNDC17Q9BRA2 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.4 ms