Protein–RNA interactions for Protein: Q15366

PCBP2, Poly(rC)-binding protein 2, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 365 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCBP2Q15366 CPNE1-220ENST00000458038 596 ntTSL 319.74■□□□□ 0.752e-7■■□□□ 12.7
PCBP2Q15366 CPNE1-219ENST00000440240 746 ntTSL 519.1■□□□□ 0.652e-7■■□□□ 12.7
PCBP2Q15366 CPNE1-210ENST00000416778 744 ntTSL 216.64■□□□□ 0.252e-7■■□□□ 12.7
PCBP2Q15366 CPNE1-213ENST00000434795 831 ntTSL 316.64■□□□□ 0.252e-7■■□□□ 12.7
PCBP2Q15366 CPNE1-206ENST00000412056 998 ntTSL 313.32□□□□□ -0.282e-7■■□□□ 12.7
PCBP2Q15366 CPNE1-218ENST00000439806 748 ntTSL 510.3□□□□□ -0.762e-7■■□□□ 12.7
PCBP2Q15366 AF127577.4-201ENST00000432230 5929 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.496e-7■■□□□ 12.7
PCBP2Q15366 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.092e-25■■□□□ 12.7
PCBP2Q15366 RAB7A-205ENST00000485280 507 ntTSL 3 BASIC6.26□□□□□ -1.412e-25■■□□□ 12.7
PCBP2Q15366 UBE2K-207ENST00000513231 871 ntTSL 1 (best)22.44■■□□□ 1.188e-8■■□□□ 12.7
PCBP2Q15366 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.678e-8■■□□□ 12.7
PCBP2Q15366 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.628e-8■■□□□ 12.7
PCBP2Q15366 UBE2K-202ENST00000438068 2262 ntTSL 218.63■□□□□ 0.578e-8■■□□□ 12.7
PCBP2Q15366 UBE2K-206ENST00000510934 589 ntTSL 218.47■□□□□ 0.558e-8■■□□□ 12.7
PCBP2Q15366 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.528e-8■■□□□ 12.7
PCBP2Q15366 UBE2K-205ENST00000510719 566 ntTSL 38.85□□□□□ -0.998e-8■■□□□ 12.7
PCBP2Q15366 IDH3A-201ENST00000299518 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.664e-7■■□□□ 12.7
PCBP2Q15366 IDH3A-206ENST00000558535 2586 ntTSL 1 (best)5.73□□□□□ -1.494e-7■■□□□ 12.7
PCBP2Q15366 IDH3A-203ENST00000557960 424 ntTSL 35.37□□□□□ -1.554e-7■■□□□ 12.7
PCBP2Q15366 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.191e-45■■□□□ 12.7
PCBP2Q15366 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.742e-6■■□□□ 12.7
PCBP2Q15366 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.936e-8■■□□□ 12.7
PCBP2Q15366 PEG3-203ENST00000594389 411 ntTSL 320.19■□□□□ 0.826e-8■■□□□ 12.7
PCBP2Q15366 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.766e-8■■□□□ 12.7
PCBP2Q15366 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.716e-8■■□□□ 12.7
PCBP2Q15366 PEG3-204ENST00000594706 583 ntTSL 317.21■□□□□ 0.356e-8■■□□□ 12.7
PCBP2Q15366 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.116e-8■■□□□ 12.7
PCBP2Q15366 PEG3-209ENST00000599577 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best)15.15■□□□□ 0.026e-8■■□□□ 12.7
PCBP2Q15366 PEG3-202ENST00000593695 4741 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.516e-8■■□□□ 12.7
PCBP2Q15366 PEG3-201ENST00000326441 8723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -16e-8■■□□□ 12.7
PCBP2Q15366 PEG3-205ENST00000596261 570 ntTSL 47.93□□□□□ -1.146e-8■■□□□ 12.7
PCBP2Q15366 EPC2-205ENST00000457184 724 ntTSL 517.39■□□□□ 0.371e-6■■□□□ 12.7
PCBP2Q15366 EPC2-203ENST00000409654 1624 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.791e-6■■□□□ 12.7
PCBP2Q15366 EPC2-201ENST00000258484 3649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.51e-6■■□□□ 12.7
PCBP2Q15366 BRD2-212ENST00000482914 4834 ntTSL 1 (best)13.58□□□□□ -0.242e-6■■□□□ 12.7
PCBP2Q15366 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.592e-7■■□□□ 12.7
PCBP2Q15366 TSG101-210ENST00000545247 783 ntTSL 317.52■□□□□ 0.42e-7■■□□□ 12.7
PCBP2Q15366 TSG101-202ENST00000438874 581 ntTSL 1 (best)17.29■□□□□ 0.362e-7■■□□□ 12.7
PCBP2Q15366 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.052e-7■■□□□ 12.7
PCBP2Q15366 TSG101-209ENST00000544804 391 ntTSL 313.99□□□□□ -0.172e-7■■□□□ 12.7
PCBP2Q15366 TSG101-208ENST00000543087 714 ntTSL 312.15□□□□□ -0.462e-7■■□□□ 12.7
PCBP2Q15366 TSG101-207ENST00000543054 593 ntTSL 26.15□□□□□ -1.422e-7■■□□□ 12.7
PCBP2Q15366 TMEM184B-211ENST00000504337 1063 ntTSL 418.99■□□□□ 0.631e-18■■□□□ 12.7
PCBP2Q15366 NKD1-203ENST00000566396 748 ntTSL 312.73□□□□□ -0.371e-12■■□□□ 12.6
PCBP2Q15366 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.681e-6■■□□□ 12.6
PCBP2Q15366 AES-206ENST00000586742 1666 ntTSL 317.77■□□□□ 0.431e-6■■□□□ 12.6
PCBP2Q15366 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.281e-6■■□□□ 12.6
PCBP2Q15366 DDX39B-206ENST00000419338 928 ntTSL 512.95□□□□□ -0.344e-26■■□□□ 12.6
PCBP2Q15366 DDX39B-204ENST00000418897 583 ntTSL 311.36□□□□□ -0.594e-26■■□□□ 12.6
PCBP2Q15366 DDX39B-213ENST00000456976 720 ntTSL 511.36□□□□□ -0.594e-26■■□□□ 12.6
PCBP2Q15366 DDX39B-208ENST00000428098 817 ntTSL 311.2□□□□□ -0.624e-26■■□□□ 12.6
PCBP2Q15366 DDX39B-212ENST00000456662 932 ntTSL 511.2□□□□□ -0.624e-26■■□□□ 12.6
PCBP2Q15366 DDX39B-205ENST00000419020 583 ntTSL 311.04□□□□□ -0.644e-26■■□□□ 12.6
PCBP2Q15366 ATP6V1G2-DDX39B-203ENST00000480131 552 ntAPPRIS P1 TSL 410.85□□□□□ -0.674e-26■■□□□ 12.6
PCBP2Q15366 DDX39B-209ENST00000428450 633 ntTSL 410.78□□□□□ -0.684e-26■■□□□ 12.6
PCBP2Q15366 DDX39B-211ENST00000449757 591 ntTSL 39.47□□□□□ -0.894e-26■■□□□ 12.6
PCBP2Q15366 SH2B1-212ENST00000567536 484 ntTSL 321.34■■□□□ 1.012e-6■■□□□ 12.6
PCBP2Q15366 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.181e-6■■□□□ 12.6
PCBP2Q15366 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.011e-6■■□□□ 12.6
PCBP2Q15366 BRD2-213ENST00000495733 3404 ntTSL 213.92□□□□□ -0.181e-6■■□□□ 12.6
PCBP2Q15366 BRD2-206ENST00000456339 887 ntTSL 413.75□□□□□ -0.211e-6■■□□□ 12.6
PCBP2Q15366 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.872e-7■■□□□ 12.6
PCBP2Q15366 TATDN2-203ENST00000448281 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.812e-7■■□□□ 12.6
PCBP2Q15366 AKIRIN2-202ENST00000420494 413 ntTSL 27.1□□□□□ -1.272e-8■■□□□ 12.6
PCBP2Q15366 MGAT4B-221ENST00000523108 1080 ntTSL 520.43■□□□□ 0.862e-7■■□□□ 12.6
PCBP2Q15366 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.832e-7■■□□□ 12.6
PCBP2Q15366 MGAT4B-217ENST00000521305 1213 ntTSL 518.06■□□□□ 0.482e-7■■□□□ 12.6
PCBP2Q15366 B4GALNT1-216ENST00000553142 5580 ntTSL 214.72□□□□□ -0.055e-7■■□□□ 12.6
PCBP2Q15366 DHCR24-201ENST00000371269 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.29e-9■■□□□ 12.6
PCBP2Q15366 DHCR24-203ENST00000535035 4153 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.759e-9■■□□□ 12.6
PCBP2Q15366 NUCB1-211ENST00000485798 938 ntTSL 314.35□□□□□ -0.114e-32■■□□□ 12.6
PCBP2Q15366 MAP2K7-205ENST00000468058 1589 ntTSL 226.05■■□□□ 1.761e-6■■□□□ 12.6
PCBP2Q15366 LAMB1-205ENST00000439976 703 ntTSL 514.83□□□□□ -0.042e-6■■□□□ 12.6
PCBP2Q15366 LAMB1-202ENST00000393559 550 ntTSL 213.33□□□□□ -0.282e-6■■□□□ 12.6
PCBP2Q15366 LAMB1-201ENST00000222399 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.32e-6■■□□□ 12.6
PCBP2Q15366 LAMB1-203ENST00000393560 2806 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.812e-6■■□□□ 12.6
PCBP2Q15366 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.69e-21■■□□□ 12.6
PCBP2Q15366 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.519e-21■■□□□ 12.6
PCBP2Q15366 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.399e-21■■□□□ 12.6
PCBP2Q15366 RTN4-210ENST00000427710 589 ntTSL 413.99□□□□□ -0.179e-21■■□□□ 12.6
PCBP2Q15366 RTN4-202ENST00000337526 4790 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.279e-21■■□□□ 12.6
PCBP2Q15366 RTN4-206ENST00000394611 4161 ntTSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.039e-21■■□□□ 12.6
PCBP2Q15366 RTN4-208ENST00000404909 4102 ntTSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.839e-21■■□□□ 12.6
PCBP2Q15366 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.885e-8■■□□□ 12.6
PCBP2Q15366 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.465e-8■■□□□ 12.6
PCBP2Q15366 CPNE1-204ENST00000397443 1928 ntAPPRIS P1 TSL 520.59■□□□□ 0.895e-8■■□□□ 12.6
PCBP2Q15366 CPNE1-224ENST00000483359 1975 ntTSL 517.11■□□□□ 0.335e-8■■□□□ 12.6
PCBP2Q15366 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.335e-62■■□□□ 12.6
PCBP2Q15366 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.835e-62■■□□□ 12.6
PCBP2Q15366 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.442e-30■■□□□ 12.6
PCBP2Q15366 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.442e-30■■□□□ 12.6
PCBP2Q15366 DDX17-203ENST00000403230 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best)16.19■□□□□ 0.182e-30■■□□□ 12.6
PCBP2Q15366 DDX17-202ENST00000396821 4791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.132e-30■■□□□ 12.6
PCBP2Q15366 DDX17-204ENST00000431312 1853 ntTSL 1 (best)13.25□□□□□ -0.292e-30■■□□□ 12.6
PCBP2Q15366 DDX17-201ENST00000216019 6441 ntTSL 1 (best)12.63□□□□□ -0.392e-30■■□□□ 12.6
PCBP2Q15366 TMEM184B-212ENST00000633056 4792 nt14.57□□□□□ -0.082e-6■■□□□ 12.6
PCBP2Q15366 ENSA-202ENST00000339643 633 ntTSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.876e-8■■□□□ 12.6
PCBP2Q15366 ENSA-213ENST00000509582 716 ntTSL 39.39□□□□□ -0.916e-8■■□□□ 12.6
PCBP2Q15366 ENSA-204ENST00000356527 2546 ntTSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.236e-8■■□□□ 12.6
PCBP2Q15366 ENSA-201ENST00000271690 2818 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.266e-8■■□□□ 12.6
Retrieved 100 of 29,421 protein–RNA pairs in 175.7 ms