Protein–RNA interactions for Protein: P60608

ERVFC1-1, Endogenous retrovirus group FC1 member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 527 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVFC1-1P60608 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
ERVFC1-1P60608 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
ERVFC1-1P60608 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
ERVFC1-1P60608 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
ERVFC1-1P60608 A1BG-AS1-204ENST00000595302 2130 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
ERVFC1-1P60608 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC11.64□□□□□ -0.55
ERVFC1-1P60608 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
ERVFC1-1P60608 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
ERVFC1-1P60608 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
ERVFC1-1P60608 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
ERVFC1-1P60608 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
ERVFC1-1P60608 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
ERVFC1-1P60608 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
ERVFC1-1P60608 RBBP8NL-201ENST00000252998 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
ERVFC1-1P60608 ATP12A-201ENST00000218548 3732 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
ERVFC1-1P60608 LRSAM1-204ENST00000373324 3044 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
ERVFC1-1P60608 SPTBN2-210ENST00000611817 2890 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
ERVFC1-1P60608 KRT17P5-203ENST00000445433 2333 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
ERVFC1-1P60608 USH1C-201ENST00000005226 2700 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
ERVFC1-1P60608 AC020915.4-201ENST00000597230 2708 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
ERVFC1-1P60608 PIK3CG-205ENST00000496166 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
ERVFC1-1P60608 PTPRK-204ENST00000368210 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
ERVFC1-1P60608 SETD3-204ENST00000436070 2592 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
ERVFC1-1P60608 YLPM1-207ENST00000552421 4899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
ERVFC1-1P60608 NLRP7-207ENST00000590030 3209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
ERVFC1-1P60608 AC004846.1-201ENST00000554614 3050 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
ERVFC1-1P60608 HPS3-201ENST00000296051 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
ERVFC1-1P60608 SCAF4-202ENST00000399804 4127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
ERVFC1-1P60608 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
ERVFC1-1P60608 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
ERVFC1-1P60608 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
ERVFC1-1P60608 ZSWIM3-201ENST00000255152 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
ERVFC1-1P60608 GUSBP11-206ENST00000455485 3816 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
ERVFC1-1P60608 AC016397.2-201ENST00000624848 1985 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
ERVFC1-1P60608 POLM-201ENST00000242248 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
ERVFC1-1P60608 SLC8A3-205ENST00000394330 2622 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
ERVFC1-1P60608 NAA60-203ENST00000414063 2619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
ERVFC1-1P60608 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
ERVFC1-1P60608 TBC1D24-201ENST00000293970 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
ERVFC1-1P60608 CYTH1-215ENST00000591455 3286 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
ERVFC1-1P60608 TMEM130-203ENST00000416379 2881 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
ERVFC1-1P60608 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
ERVFC1-1P60608 ATRIP-204ENST00000412052 2721 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
ERVFC1-1P60608 SPATA7-217ENST00000556553 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
ERVFC1-1P60608 NTSR1-201ENST00000370501 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
ERVFC1-1P60608 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
ERVFC1-1P60608 TGFBRAP1-201ENST00000258449 2827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
ERVFC1-1P60608 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
ERVFC1-1P60608 GMEB2-203ENST00000370077 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
ERVFC1-1P60608 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
ERVFC1-1P60608 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
ERVFC1-1P60608 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
ERVFC1-1P60608 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
ERVFC1-1P60608 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
ERVFC1-1P60608 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
ERVFC1-1P60608 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
ERVFC1-1P60608 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
ERVFC1-1P60608 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
ERVFC1-1P60608 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
ERVFC1-1P60608 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
ERVFC1-1P60608 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
ERVFC1-1P60608 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
ERVFC1-1P60608 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
ERVFC1-1P60608 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
ERVFC1-1P60608 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
ERVFC1-1P60608 SNX33-201ENST00000308527 8008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
ERVFC1-1P60608 RFTN1-203ENST00000432519 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
ERVFC1-1P60608 CD48-201ENST00000368045 1793 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
ERVFC1-1P60608 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
ERVFC1-1P60608 ZFP64-203ENST00000361387 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
ERVFC1-1P60608 SMC6-201ENST00000351948 5173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
ERVFC1-1P60608 SPOCK3-226ENST00000541354 2797 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
ERVFC1-1P60608 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
ERVFC1-1P60608 SMPDL3B-202ENST00000373894 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
ERVFC1-1P60608 NDNF-201ENST00000379692 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
ERVFC1-1P60608 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
ERVFC1-1P60608 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
ERVFC1-1P60608 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
ERVFC1-1P60608 CCDC117-201ENST00000249064 3985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
ERVFC1-1P60608 ADAMTSL2-201ENST00000354484 4068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
ERVFC1-1P60608 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
ERVFC1-1P60608 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
ERVFC1-1P60608 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC11.63□□□□□ -0.55
ERVFC1-1P60608 ASH2L-201ENST00000343823 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
ERVFC1-1P60608 AL357143.1-202ENST00000640531 5777 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
ERVFC1-1P60608 NUMA1-233ENST00000616538 6998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
ERVFC1-1P60608 CALCB-203ENST00000533448 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
ERVFC1-1P60608 MDM1-201ENST00000303145 2918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
ERVFC1-1P60608 TM4SF19-203ENST00000446879 1582 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
ERVFC1-1P60608 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
ERVFC1-1P60608 FAM160A2-202ENST00000449352 3354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
ERVFC1-1P60608 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
ERVFC1-1P60608 AC015921.1-201ENST00000574885 2546 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
ERVFC1-1P60608 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
ERVFC1-1P60608 POTEE-201ENST00000356920 4159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
ERVFC1-1P60608 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
ERVFC1-1P60608 CCNG1-202ENST00000393929 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
ERVFC1-1P60608 SLC35F2-203ENST00000525071 3331 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
ERVFC1-1P60608 BX324167.2-201ENST00000623717 3316 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
ERVFC1-1P60608 AP002851.1-201ENST00000640504 2130 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.9 ms