Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB2

COG3, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG3Q96JB2 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
COG3Q96JB2 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
COG3Q96JB2 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
COG3Q96JB2 VWCE-205ENST00000535710 1437 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
COG3Q96JB2 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
COG3Q96JB2 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
COG3Q96JB2 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
COG3Q96JB2 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC19.79■□□□□ 0.76
COG3Q96JB2 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
COG3Q96JB2 TMSB10-201ENST00000233143 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
COG3Q96JB2 NDUFB8-201ENST00000299166 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
COG3Q96JB2 RPAIN-201ENST00000327154 815 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
COG3Q96JB2 CD1E-202ENST00000368155 696 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
COG3Q96JB2 CD1E-204ENST00000368157 399 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
COG3Q96JB2 TSPO2-201ENST00000373158 718 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
COG3Q96JB2 RPL8P2-201ENST00000430538 502 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
COG3Q96JB2 LINC00322-201ENST00000450205 699 ntTSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
COG3Q96JB2 ZNF124-204ENST00000491356 956 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
COG3Q96JB2 NKX3-1-202ENST00000523261 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
COG3Q96JB2 NEU3-205ENST00000531619 582 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
COG3Q96JB2 PHBP15-201ENST00000574228 665 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
COG3Q96JB2 MIR3677-201ENST00000578964 60 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
COG3Q96JB2 NAT9-220ENST00000582870 896 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
COG3Q96JB2 NAT9-224ENST00000583757 583 ntTSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
COG3Q96JB2 ZNF286A-219ENST00000585194 607 ntTSL 4 BASIC19.79■□□□□ 0.76
COG3Q96JB2 Z84492.1-201ENST00000606589 408 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
COG3Q96JB2 AC018635.2-201ENST00000608625 364 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
COG3Q96JB2 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
COG3Q96JB2 MAGEA2-203ENST00000611557 2024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
COG3Q96JB2 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
COG3Q96JB2 TCL1A-203ENST00000554012 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
COG3Q96JB2 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
COG3Q96JB2 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
COG3Q96JB2 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
COG3Q96JB2 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
COG3Q96JB2 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
COG3Q96JB2 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
COG3Q96JB2 ZIM2-AS1-201ENST00000595954 2129 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
COG3Q96JB2 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
COG3Q96JB2 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
COG3Q96JB2 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
COG3Q96JB2 TARS2-203ENST00000369054 1998 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
COG3Q96JB2 AC015688.4-201ENST00000580780 1647 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
COG3Q96JB2 NUDT1-201ENST00000339737 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
COG3Q96JB2 NUDT1-202ENST00000343985 771 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
COG3Q96JB2 CABP1-203ENST00000351200 770 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
COG3Q96JB2 MBP-201ENST00000354542 575 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
COG3Q96JB2 AC083949.1-201ENST00000422013 657 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
COG3Q96JB2 EFCAB10-201ENST00000460135 717 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
COG3Q96JB2 SZRD1-203ENST00000471507 892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
COG3Q96JB2 TALDO1-203ENST00000528097 1231 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
COG3Q96JB2 SAP25-201ENST00000538735 837 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
COG3Q96JB2 LTBR-209ENST00000541102 1084 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
COG3Q96JB2 ERVK13-1-204ENST00000566343 567 ntTSL 4 BASIC19.78■□□□□ 0.76
COG3Q96JB2 EXOSC5-204ENST00000596905 826 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
COG3Q96JB2 BX537318.1-201ENST00000608290 1207 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
COG3Q96JB2 AC051619.9-201ENST00000623237 597 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
COG3Q96JB2 CNOT7-213ENST00000628418 432 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
COG3Q96JB2 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
COG3Q96JB2 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
COG3Q96JB2 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
COG3Q96JB2 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
COG3Q96JB2 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
COG3Q96JB2 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
COG3Q96JB2 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
COG3Q96JB2 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
COG3Q96JB2 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
COG3Q96JB2 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
COG3Q96JB2 IDH3B-212ENST00000613370 1400 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
COG3Q96JB2 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
COG3Q96JB2 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
COG3Q96JB2 SELPLG-202ENST00000388962 1613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
COG3Q96JB2 FBXL21-202ENST00000467490 1742 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
COG3Q96JB2 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
COG3Q96JB2 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
COG3Q96JB2 PDYN-AS1-201ENST00000446562 1802 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
COG3Q96JB2 ARHGAP25-216ENST00000497079 1843 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
COG3Q96JB2 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
COG3Q96JB2 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
COG3Q96JB2 ASCC2-201ENST00000307790 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
COG3Q96JB2 RNA5SP359-201ENST00000364838 113 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
COG3Q96JB2 AL009181.1-201ENST00000418471 1085 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
COG3Q96JB2 AC060234.1-201ENST00000422966 474 ntTSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
COG3Q96JB2 CSTF3-202ENST00000431742 715 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
COG3Q96JB2 AC093484.1-201ENST00000441875 477 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
COG3Q96JB2 UPK1B-205ENST00000497685 981 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
COG3Q96JB2 AP001160.1-201ENST00000535817 565 ntTSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
COG3Q96JB2 LGALS3-204ENST00000554715 916 ntTSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
COG3Q96JB2 MIR3147-201ENST00000577811 66 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
COG3Q96JB2 HS3ST3A1-202ENST00000578576 750 ntTSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
COG3Q96JB2 MIR5572-201ENST00000583188 137 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
COG3Q96JB2 AC079336.4-201ENST00000584219 408 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
COG3Q96JB2 FAAP24-204ENST00000590179 784 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
COG3Q96JB2 CUTA-215ENST00000611509 1199 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
COG3Q96JB2 LINC00969-254ENST00000625358 962 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
COG3Q96JB2 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
COG3Q96JB2 ZNF691-206ENST00000372508 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
COG3Q96JB2 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
COG3Q96JB2 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
COG3Q96JB2 CNTNAP2-225ENST00000639247 2064 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms