Protein–RNA interactions for Protein: Q504Y0

SLC39A12, Zinc transporter ZIP12, humanhuman

Predictions only

Length 691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC39A12Q504Y0 PDE9A-208ENST00000398225 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SLC39A12Q504Y0 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SLC39A12Q504Y0 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC39A12Q504Y0 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC39A12Q504Y0 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC39A12Q504Y0 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC39A12Q504Y0 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC39A12Q504Y0 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC39A12Q504Y0 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC39A12Q504Y0 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC39A12Q504Y0 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC39A12Q504Y0 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC39A12Q504Y0 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC39A12Q504Y0 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC39A12Q504Y0 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC39A12Q504Y0 CDPF1-203ENST00000404583 1439 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC39A12Q504Y0 RABL6-211ENST00000629216 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC39A12Q504Y0 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC39A12Q504Y0 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC39A12Q504Y0 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC39A12Q504Y0 MRPS12-201ENST00000308018 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC39A12Q504Y0 NFYC-202ENST00000372651 1202 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC39A12Q504Y0 ETV2-201ENST00000379023 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC39A12Q504Y0 SERPINE3-201ENST00000400389 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC39A12Q504Y0 VDAC1P1-201ENST00000439229 848 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC39A12Q504Y0 RN7SL11P-201ENST00000471305 293 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC39A12Q504Y0 AC010973.2-201ENST00000485974 1230 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC39A12Q504Y0 MARK2P5-201ENST00000507649 634 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC39A12Q504Y0 AC025810.1-201ENST00000569986 981 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC39A12Q504Y0 NAT9-212ENST00000581136 1011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC39A12Q504Y0 SELENOW-204ENST00000595615 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC39A12Q504Y0 KLK3-207ENST00000595952 969 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC39A12Q504Y0 AC010323.1-201ENST00000598884 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC39A12Q504Y0 C17orf50-202ENST00000604830 477 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC39A12Q504Y0 SELENOW-216ENST00000612212 875 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC39A12Q504Y0 PCDHB13-201ENST00000341948 5061 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC39A12Q504Y0 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC39A12Q504Y0 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC39A12Q504Y0 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC39A12Q504Y0 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC39A12Q504Y0 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC39A12Q504Y0 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC39A12Q504Y0 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC39A12Q504Y0 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC39A12Q504Y0 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC39A12Q504Y0 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC39A12Q504Y0 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC39A12Q504Y0 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC39A12Q504Y0 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC39A12Q504Y0 GOLGA8R-201ENST00000327271 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC39A12Q504Y0 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC39A12Q504Y0 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC39A12Q504Y0 CD48-203ENST00000613788 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC39A12Q504Y0 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC39A12Q504Y0 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC39A12Q504Y0 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC39A12Q504Y0 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC39A12Q504Y0 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC39A12Q504Y0 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC39A12Q504Y0 CCNA1-204ENST00000630422 1751 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC39A12Q504Y0 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC39A12Q504Y0 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC39A12Q504Y0 ANXA6-202ENST00000377751 1430 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC39A12Q504Y0 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC39A12Q504Y0 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC39A12Q504Y0 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC39A12Q504Y0 INHBE-201ENST00000266646 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC39A12Q504Y0 MPP6-201ENST00000222644 8452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC39A12Q504Y0 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC39A12Q504Y0 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC39A12Q504Y0 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC39A12Q504Y0 PSME1-201ENST00000206451 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC39A12Q504Y0 MAX-201ENST00000246163 897 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC39A12Q504Y0 AL138767.1-201ENST00000354527 744 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC39A12Q504Y0 KRTAP10-3-201ENST00000391620 971 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC39A12Q504Y0 SLC16A6P1-201ENST00000413214 1059 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC39A12Q504Y0 AL008707.1-201ENST00000422498 534 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC39A12Q504Y0 AL157407.1-201ENST00000435784 904 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC39A12Q504Y0 AL157392.3-216ENST00000437446 462 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC39A12Q504Y0 AL358393.1-201ENST00000456771 532 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC39A12Q504Y0 HLA-J-204ENST00000495278 958 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC39A12Q504Y0 AC129492.3-201ENST00000498285 460 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC39A12Q504Y0 UCHL1-207ENST00000508768 827 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC39A12Q504Y0 AC105362.1-201ENST00000511234 564 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC39A12Q504Y0 SCARNA21-201ENST00000517026 139 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC39A12Q504Y0 HDAC2-AS2-213ENST00000520891 603 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC39A12Q504Y0 AL160314.3-201ENST00000556041 767 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC39A12Q504Y0 SNORD3B-2-202ENST00000571722 791 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC39A12Q504Y0 RN7SL774P-201ENST00000577467 290 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC39A12Q504Y0 AC011447.3-201ENST00000590606 722 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC39A12Q504Y0 HDDC2-204ENST00000608295 879 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC39A12Q504Y0 PPA1-206ENST00000625364 644 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC39A12Q504Y0 AL805961.1-203ENST00000641078 1258 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC39A12Q504Y0 F10-203ENST00000409306 1450 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC39A12Q504Y0 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC39A12Q504Y0 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC39A12Q504Y0 CHIA-206ENST00000430615 1320 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC39A12Q504Y0 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC39A12Q504Y0 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC39A12Q504Y0 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms