Protein–RNA interactions for Protein: Q13296

SCGB2A2, Mammaglobin-A, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCGB2A2Q13296 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
SCGB2A2Q13296 NEK4-201ENST00000233027 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
SCGB2A2Q13296 CACNA1G-214ENST00000505165 6633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
SCGB2A2Q13296 MICAL1-201ENST00000358577 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
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SCGB2A2Q13296 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
SCGB2A2Q13296 CELSR3-201ENST00000164024 11956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
SCGB2A2Q13296 WNT5A-202ENST00000474267 6042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
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SCGB2A2Q13296 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
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SCGB2A2Q13296 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC12.33□□□□□ -0.43
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SCGB2A2Q13296 SRSF2-203ENST00000392485 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
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SCGB2A2Q13296 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
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SCGB2A2Q13296 PRSS30P-202ENST00000475030 752 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
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SCGB2A2Q13296 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
SCGB2A2Q13296 SOCS5-202ENST00000394861 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
SCGB2A2Q13296 SLC39A14-201ENST00000240095 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
SCGB2A2Q13296 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
SCGB2A2Q13296 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC12.32□□□□□ -0.44
SCGB2A2Q13296 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
SCGB2A2Q13296 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
SCGB2A2Q13296 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
SCGB2A2Q13296 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
SCGB2A2Q13296 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
SCGB2A2Q13296 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
SCGB2A2Q13296 FRMD3-202ENST00000328788 964 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
SCGB2A2Q13296 KRTAP21-2-201ENST00000333892 440 ntAPPRIS P1 BASIC12.32□□□□□ -0.44
SCGB2A2Q13296 MRPL55-214ENST00000366741 603 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
SCGB2A2Q13296 MRPL55-218ENST00000366747 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
SCGB2A2Q13296 KCNAB2-207ENST00000378111 822 ntTSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
SCGB2A2Q13296 IGLC7-201ENST00000390331 441 ntAPPRIS P1 BASIC12.32□□□□□ -0.44
SCGB2A2Q13296 SEPT12-202ENST00000396693 1156 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
SCGB2A2Q13296 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
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