Protein–RNA interactions for Protein: Q09472

EP300, Histone acetyltransferase p300, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 2,414 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EP300Q09472 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
EP300Q09472 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
EP300Q09472 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
EP300Q09472 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
EP300Q09472 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
EP300Q09472 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
EP300Q09472 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
EP300Q09472 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
EP300Q09472 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
EP300Q09472 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
EP300Q09472 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
EP300Q09472 MYL4-202ENST00000393450 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
EP300Q09472 Z82185.1-201ENST00000417792 549 ntTSL 4 BASIC14.22□□□□□ -0.13
EP300Q09472 CSAG1-204ENST00000452779 627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
EP300Q09472 AC068057.1-201ENST00000453322 709 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
EP300Q09472 DUX4L50-201ENST00000455245 715 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
EP300Q09472 TGFBI-207ENST00000508076 1034 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
EP300Q09472 AC111149.2-202ENST00000518355 599 ntTSL 4 BASIC14.22□□□□□ -0.13
EP300Q09472 IGHEP2-201ENST00000519308 1256 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
EP300Q09472 TMEM123-208ENST00000532161 743 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.22□□□□□ -0.13
EP300Q09472 TSHR-205ENST00000554263 1184 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
EP300Q09472 TSHR-206ENST00000554435 1089 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
EP300Q09472 AC139099.2-201ENST00000572343 641 ntTSL 3 BASIC14.22□□□□□ -0.13
EP300Q09472 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
EP300Q09472 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC14.22□□□□□ -0.13
EP300Q09472 C3orf52-202ENST00000431717 2054 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
EP300Q09472 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
EP300Q09472 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
EP300Q09472 BTNL8-203ENST00000400707 1512 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
EP300Q09472 CST9-201ENST00000376971 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
EP300Q09472 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
EP300Q09472 ZDHHC6-201ENST00000369404 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
EP300Q09472 AP000552.1-203ENST00000416615 1930 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
EP300Q09472 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
EP300Q09472 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
EP300Q09472 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
EP300Q09472 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
EP300Q09472 PCBD1-201ENST00000299299 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
EP300Q09472 RNVU1-8-201ENST00000364272 125 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
EP300Q09472 SERF2-209ENST00000409646 559 ntTSL 4 BASIC14.22□□□□□ -0.13
EP300Q09472 AC098934.1-203ENST00000442868 1262 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
EP300Q09472 AC015795.2-201ENST00000512720 575 ntTSL 3 BASIC14.22□□□□□ -0.13
EP300Q09472 F11R-204ENST00000537746 1245 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
EP300Q09472 TMEM14C-205ENST00000541412 1177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
EP300Q09472 CYP1B1-AS1-221ENST00000627172 995 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
EP300Q09472 AL137793.2-201ENST00000632635 659 ntTSL 3 BASIC14.22□□□□□ -0.13
EP300Q09472 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
EP300Q09472 TARBP2-202ENST00000394357 1402 ntTSL 3 BASIC14.22□□□□□ -0.13
EP300Q09472 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
EP300Q09472 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
EP300Q09472 PPHLN1-223ENST00000610488 1521 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
EP300Q09472 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
EP300Q09472 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
EP300Q09472 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
EP300Q09472 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
EP300Q09472 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
EP300Q09472 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
EP300Q09472 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
EP300Q09472 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
EP300Q09472 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
EP300Q09472 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
EP300Q09472 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
EP300Q09472 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
EP300Q09472 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
EP300Q09472 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
EP300Q09472 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
EP300Q09472 NEDD4L-238ENST00000635997 4402 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
EP300Q09472 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
EP300Q09472 GLT1D1-201ENST00000281703 2725 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
EP300Q09472 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
EP300Q09472 PSMG2-201ENST00000317615 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
EP300Q09472 KRTAP19-5-201ENST00000334151 461 ntAPPRIS P1 BASIC14.21□□□□□ -0.13
EP300Q09472 NECTIN1-203ENST00000341398 1377 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
EP300Q09472 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
EP300Q09472 GEMIN8P4-201ENST00000380526 729 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
EP300Q09472 FAM9C-202ENST00000380625 1122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
EP300Q09472 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
EP300Q09472 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
EP300Q09472 HNRNPA1P27-201ENST00000412087 955 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
EP300Q09472 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
EP300Q09472 LINC01502-203ENST00000447907 880 ntTSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.13
EP300Q09472 AC106869.1-201ENST00000448713 577 ntTSL 4 BASIC14.21□□□□□ -0.13
EP300Q09472 AL355376.1-201ENST00000456082 517 ntTSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.13
EP300Q09472 TPT1P6-201ENST00000458298 514 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
EP300Q09472 AC128689.1-202ENST00000459861 827 ntTSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.13
EP300Q09472 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
EP300Q09472 MIR2278-201ENST00000516344 96 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
EP300Q09472 AC136601.1-201ENST00000521803 666 ntTSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.13
EP300Q09472 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
EP300Q09472 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
EP300Q09472 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
EP300Q09472 TSPAN3-205ENST00000558745 1340 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
EP300Q09472 COX5A-205ENST00000568517 582 ntTSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.13
EP300Q09472 RN7SL665P-201ENST00000578793 300 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
EP300Q09472 CBR3-AS1-206ENST00000608632 659 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
EP300Q09472 AC073578.2-201ENST00000618927 464 ntTSL 4 BASIC14.21□□□□□ -0.13
EP300Q09472 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
EP300Q09472 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
EP300Q09472 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
EP300Q09472 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53 ms