Protein–RNA interactions for Protein: A2RTX5

TARSL2, Probable threonine--tRNA ligase 2, cytoplasmic, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 802 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TARSL2A2RTX5 KCNC2-202ENST00000350228 3344 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TARSL2A2RTX5 SLC23A1-201ENST00000348729 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TARSL2A2RTX5 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TARSL2A2RTX5 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TARSL2A2RTX5 RASGEF1C-202ENST00000393371 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TARSL2A2RTX5 MTRF1L-202ENST00000367231 3539 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TARSL2A2RTX5 CALCB-203ENST00000533448 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TARSL2A2RTX5 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TARSL2A2RTX5 RER1-207ENST00000488353 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TARSL2A2RTX5 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TARSL2A2RTX5 MICAL3-206ENST00000441493 9445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TARSL2A2RTX5 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TARSL2A2RTX5 KRT4-204ENST00000551956 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TARSL2A2RTX5 RPS6KA4-202ENST00000528057 3121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TARSL2A2RTX5 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TARSL2A2RTX5 HCG27-201ENST00000383331 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TARSL2A2RTX5 CAMK2D-205ENST00000394524 5294 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TARSL2A2RTX5 FAM219A-209ENST00000445726 3644 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TARSL2A2RTX5 KIF7-201ENST00000394412 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TARSL2A2RTX5 AL354702.1-201ENST00000442006 1960 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
TARSL2A2RTX5 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TARSL2A2RTX5 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TARSL2A2RTX5 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TARSL2A2RTX5 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TARSL2A2RTX5 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TARSL2A2RTX5 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TARSL2A2RTX5 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TARSL2A2RTX5 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TARSL2A2RTX5 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
TARSL2A2RTX5 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TARSL2A2RTX5 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TARSL2A2RTX5 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
TARSL2A2RTX5 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TARSL2A2RTX5 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TARSL2A2RTX5 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TARSL2A2RTX5 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TARSL2A2RTX5 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
TARSL2A2RTX5 NAA60-202ENST00000407558 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TARSL2A2RTX5 NIPA1-201ENST00000337435 6567 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TARSL2A2RTX5 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TARSL2A2RTX5 FECH-201ENST00000262093 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TARSL2A2RTX5 FBXO34-201ENST00000313833 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TARSL2A2RTX5 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TARSL2A2RTX5 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TARSL2A2RTX5 SERPINA4-203ENST00000557004 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TARSL2A2RTX5 UPB1-201ENST00000326010 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TARSL2A2RTX5 BRSK2-202ENST00000382179 3576 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TARSL2A2RTX5 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TARSL2A2RTX5 VAC14-AS1-201ENST00000398177 2145 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TARSL2A2RTX5 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TARSL2A2RTX5 FAM8A1-201ENST00000259963 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TARSL2A2RTX5 CYP4F11-202ENST00000326742 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TARSL2A2RTX5 MED15-203ENST00000382974 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TARSL2A2RTX5 SARM1-208ENST00000585482 10309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TARSL2A2RTX5 SCUBE2-201ENST00000309263 3727 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TARSL2A2RTX5 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TARSL2A2RTX5 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TARSL2A2RTX5 TTC8-203ENST00000346301 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TARSL2A2RTX5 SHPK-201ENST00000225519 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TARSL2A2RTX5 SMARCA4-214ENST00000589677 5181 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TARSL2A2RTX5 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TARSL2A2RTX5 CDH20-201ENST00000262717 3882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TARSL2A2RTX5 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TARSL2A2RTX5 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TARSL2A2RTX5 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
TARSL2A2RTX5 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
TARSL2A2RTX5 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TARSL2A2RTX5 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TARSL2A2RTX5 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
TARSL2A2RTX5 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TARSL2A2RTX5 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TARSL2A2RTX5 FOSL2-201ENST00000264716 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TARSL2A2RTX5 STIP1-203ENST00000358794 2743 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TARSL2A2RTX5 C8orf31-201ENST00000395172 1875 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TARSL2A2RTX5 SLC6A6P1-201ENST00000413933 1850 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
TARSL2A2RTX5 UBE4B-201ENST00000253251 4772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TARSL2A2RTX5 AC067750.1-201ENST00000608826 6545 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
TARSL2A2RTX5 FLJ40288-201ENST00000332558 1998 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TARSL2A2RTX5 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
TARSL2A2RTX5 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TARSL2A2RTX5 EIF4G1-212ENST00000424196 5653 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TARSL2A2RTX5 DDX59-206ENST00000447706 2900 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TARSL2A2RTX5 DESI2-202ENST00000302550 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TARSL2A2RTX5 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TARSL2A2RTX5 RRAGB-202ENST00000374941 2061 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TARSL2A2RTX5 ZFP2-201ENST00000361362 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TARSL2A2RTX5 PPM1F-201ENST00000263212 5143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
TARSL2A2RTX5 KLHDC7A-201ENST00000400664 5145 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.14
TARSL2A2RTX5 CCT4-201ENST00000394440 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
TARSL2A2RTX5 KDM2B-201ENST00000377069 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
TARSL2A2RTX5 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.14
TARSL2A2RTX5 ANKRD18A-201ENST00000399703 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
TARSL2A2RTX5 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
TARSL2A2RTX5 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
TARSL2A2RTX5 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
TARSL2A2RTX5 TRPV6-201ENST00000359396 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TARSL2A2RTX5 RAD17-207ENST00000361732 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TARSL2A2RTX5 MAPT-IT1-201ENST00000624111 3016 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
TARSL2A2RTX5 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TARSL2A2RTX5 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms