Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYR9

KRTAP2-4, Keratin-associated protein 2-4, humanhuman

Predictions only

Length 128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP2-4Q9BYR9 KRT8P31-201ENST00000504812 1408 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
KRTAP2-4Q9BYR9 MBD1-212ENST00000585672 2532 ntTSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
KRTAP2-4Q9BYR9 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
KRTAP2-4Q9BYR9 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
KRTAP2-4Q9BYR9 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
KRTAP2-4Q9BYR9 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
KRTAP2-4Q9BYR9 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
KRTAP2-4Q9BYR9 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
KRTAP2-4Q9BYR9 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.41□□□□□ -1.54
KRTAP2-4Q9BYR9 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
KRTAP2-4Q9BYR9 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
KRTAP2-4Q9BYR9 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
KRTAP2-4Q9BYR9 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC5.41□□□□□ -1.54
KRTAP2-4Q9BYR9 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
KRTAP2-4Q9BYR9 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
KRTAP2-4Q9BYR9 PRKD2-206ENST00000595515 3012 ntTSL 2 BASIC5.41□□□□□ -1.54
KRTAP2-4Q9BYR9 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
KRTAP2-4Q9BYR9 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
KRTAP2-4Q9BYR9 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
KRTAP2-4Q9BYR9 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.41□□□□□ -1.54
KRTAP2-4Q9BYR9 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
KRTAP2-4Q9BYR9 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
KRTAP2-4Q9BYR9 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
KRTAP2-4Q9BYR9 PAPD7-207ENST00000631941 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
KRTAP2-4Q9BYR9 HTR3D-201ENST00000334128 1459 ntTSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
KRTAP2-4Q9BYR9 LINC01229-201ENST00000561510 1494 ntTSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
KRTAP2-4Q9BYR9 ERCC1-208ENST00000589165 1453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
KRTAP2-4Q9BYR9 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
KRTAP2-4Q9BYR9 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
KRTAP2-4Q9BYR9 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
KRTAP2-4Q9BYR9 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
KRTAP2-4Q9BYR9 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
KRTAP2-4Q9BYR9 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
KRTAP2-4Q9BYR9 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
KRTAP2-4Q9BYR9 ZCCHC17-204ENST00000546109 1705 ntTSL 2 BASIC5.41□□□□□ -1.54
KRTAP2-4Q9BYR9 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
KRTAP2-4Q9BYR9 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
KRTAP2-4Q9BYR9 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
KRTAP2-4Q9BYR9 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
KRTAP2-4Q9BYR9 UPK1A-201ENST00000222275 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
KRTAP2-4Q9BYR9 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC5.41□□□□□ -1.54
KRTAP2-4Q9BYR9 KRTAP6-1-201ENST00000329122 500 ntAPPRIS P1 BASIC5.41□□□□□ -1.54
KRTAP2-4Q9BYR9 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
KRTAP2-4Q9BYR9 PIFO-201ENST00000369737 746 ntTSL 2 BASIC5.41□□□□□ -1.54
KRTAP2-4Q9BYR9 IFNLR1-204ENST00000374419 953 ntTSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
KRTAP2-4Q9BYR9 UPK1A-202ENST00000379013 1016 ntTSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
KRTAP2-4Q9BYR9 SOD1-202ENST00000389995 865 ntTSL 3 BASIC5.41□□□□□ -1.54
KRTAP2-4Q9BYR9 KRTAP2-3-201ENST00000391418 875 ntAPPRIS P1 BASIC5.41□□□□□ -1.54
KRTAP2-4Q9BYR9 ANG-202ENST00000397990 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
KRTAP2-4Q9BYR9 MIR1249-201ENST00000408671 66 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
KRTAP2-4Q9BYR9 FTH1P18-201ENST00000412071 549 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
KRTAP2-4Q9BYR9 DCAF7-201ENST00000415273 1220 ntTSL 2 BASIC5.41□□□□□ -1.54
KRTAP2-4Q9BYR9 SIX3-AS1-201ENST00000419364 844 ntTSL 2 BASIC5.41□□□□□ -1.54
KRTAP2-4Q9BYR9 FRGCA-201ENST00000424933 422 ntTSL 3 BASIC5.41□□□□□ -1.54
KRTAP2-4Q9BYR9 AC104961.1-201ENST00000427605 771 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
KRTAP2-4Q9BYR9 AC106017.1-201ENST00000428348 440 ntTSL 2 BASIC5.41□□□□□ -1.54
KRTAP2-4Q9BYR9 DMKN-211ENST00000436012 848 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.41□□□□□ -1.54
KRTAP2-4Q9BYR9 AC004771.1-201ENST00000438266 583 ntTSL 2 BASIC5.41□□□□□ -1.54
KRTAP2-4Q9BYR9 CCND3P1-201ENST00000438347 580 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
KRTAP2-4Q9BYR9 LAMTOR4-202ENST00000441173 730 ntTSL 2 BASIC5.41□□□□□ -1.54
KRTAP2-4Q9BYR9 AC007952.3-201ENST00000442355 440 ntTSL 2 BASIC5.41□□□□□ -1.54
KRTAP2-4Q9BYR9 CSNK1G2P1-201ENST00000442675 955 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
KRTAP2-4Q9BYR9 SHANK2-210ENST00000449116 939 ntTSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
KRTAP2-4Q9BYR9 RPS15P5-201ENST00000449885 432 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
KRTAP2-4Q9BYR9 RN7SL788P-201ENST00000460504 316 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
KRTAP2-4Q9BYR9 AC007952.8-202ENST00000495691 440 ntTSL 2 BASIC5.41□□□□□ -1.54
KRTAP2-4Q9BYR9 TMEM154-202ENST00000504064 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
KRTAP2-4Q9BYR9 FAM153C-208ENST00000511189 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
KRTAP2-4Q9BYR9 MSC-AS1-204ENST00000518916 864 ntTSL 3 BASIC5.41□□□□□ -1.54
KRTAP2-4Q9BYR9 FAM213AP2-201ENST00000521579 683 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
KRTAP2-4Q9BYR9 ACY3-202ENST00000529256 933 ntTSL 3 BASIC5.41□□□□□ -1.54
KRTAP2-4Q9BYR9 AC025419.1-201ENST00000537250 690 ntTSL 3 BASIC5.41□□□□□ -1.54
KRTAP2-4Q9BYR9 NDUFC1-209ENST00000539002 1198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.41□□□□□ -1.54
KRTAP2-4Q9BYR9 GABARAPL1-213ENST00000544284 531 ntTSL 3 BASIC5.41□□□□□ -1.54
KRTAP2-4Q9BYR9 NDUFC1-211ENST00000544855 1257 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.41□□□□□ -1.54
KRTAP2-4Q9BYR9 BLOC1S1-203ENST00000548925 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
KRTAP2-4Q9BYR9 CES1P2-201ENST00000566467 1242 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
KRTAP2-4Q9BYR9 AC091304.3-201ENST00000566500 716 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
KRTAP2-4Q9BYR9 AC007952.4-201ENST00000573866 637 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
KRTAP2-4Q9BYR9 DSCAS-201ENST00000581836 553 ntTSL 4 BASIC5.41□□□□□ -1.54
KRTAP2-4Q9BYR9 AC048380.1-201ENST00000589818 465 ntTSL 3 BASIC5.41□□□□□ -1.54
KRTAP2-4Q9BYR9 PSME3-213ENST00000592169 826 ntTSL 3 BASIC5.41□□□□□ -1.54
KRTAP2-4Q9BYR9 AC009955.4-201ENST00000597192 544 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
KRTAP2-4Q9BYR9 UBA52-213ENST00000599551 707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.41□□□□□ -1.54
KRTAP2-4Q9BYR9 DUSP22-213ENST00000605035 1231 ntTSL 2 BASIC5.41□□□□□ -1.54
KRTAP2-4Q9BYR9 AL121992.3-201ENST00000606186 346 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
KRTAP2-4Q9BYR9 AC073578.2-201ENST00000618927 464 ntTSL 4 BASIC5.41□□□□□ -1.54
KRTAP2-4Q9BYR9 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
KRTAP2-4Q9BYR9 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC5.41□□□□□ -1.54
KRTAP2-4Q9BYR9 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
KRTAP2-4Q9BYR9 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
KRTAP2-4Q9BYR9 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
KRTAP2-4Q9BYR9 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
KRTAP2-4Q9BYR9 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
KRTAP2-4Q9BYR9 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
KRTAP2-4Q9BYR9 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
KRTAP2-4Q9BYR9 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
KRTAP2-4Q9BYR9 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
KRTAP2-4Q9BYR9 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
KRTAP2-4Q9BYR9 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms