Protein–RNA interactions for Protein: Q8WZ74

CTTNBP2, Cortactin-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,663 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTTNBP2Q8WZ74 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CTTNBP2Q8WZ74 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CTTNBP2Q8WZ74 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CTTNBP2Q8WZ74 PLAC9-203ENST00000372270 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CTTNBP2Q8WZ74 SNRPC-202ENST00000374017 1054 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CTTNBP2Q8WZ74 TRBV4-1-201ENST00000390357 373 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CTTNBP2Q8WZ74 TRBV4-2-201ENST00000390392 455 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CTTNBP2Q8WZ74 KCNE1-203ENST00000399286 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CTTNBP2Q8WZ74 UBE2I-206ENST00000403747 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CTTNBP2Q8WZ74 EIF4E2-205ENST00000409394 604 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CTTNBP2Q8WZ74 RPL35P9-201ENST00000446059 350 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
CTTNBP2Q8WZ74 GNG10P1-201ENST00000452289 199 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
CTTNBP2Q8WZ74 GRPEL2P1-201ENST00000453145 339 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
CTTNBP2Q8WZ74 AL713999.1-201ENST00000473363 753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CTTNBP2Q8WZ74 EIF2B1-205ENST00000539951 848 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CTTNBP2Q8WZ74 VENTXP3-201ENST00000546480 773 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
CTTNBP2Q8WZ74 SNORD3B-1-201ENST00000577988 758 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
CTTNBP2Q8WZ74 DHPS-207ENST00000594424 1172 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CTTNBP2Q8WZ74 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CTTNBP2Q8WZ74 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CTTNBP2Q8WZ74 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CTTNBP2Q8WZ74 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CTTNBP2Q8WZ74 ODCP-201ENST00000459650 1639 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
CTTNBP2Q8WZ74 RHOH-220ENST00000615083 2156 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CTTNBP2Q8WZ74 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CTTNBP2Q8WZ74 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CTTNBP2Q8WZ74 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CTTNBP2Q8WZ74 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CTTNBP2Q8WZ74 CRYM-202ENST00000543948 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CTTNBP2Q8WZ74 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CTTNBP2Q8WZ74 LY86-202ENST00000379953 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CTTNBP2Q8WZ74 GEMIN8P4-201ENST00000380526 729 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
CTTNBP2Q8WZ74 PUS10-202ENST00000398658 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CTTNBP2Q8WZ74 GRAMD1A-203ENST00000424536 808 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CTTNBP2Q8WZ74 LRRC75A-AS1-213ENST00000484836 821 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CTTNBP2Q8WZ74 ALG1L7P-201ENST00000502317 768 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
CTTNBP2Q8WZ74 TGFB3-204ENST00000556285 1280 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CTTNBP2Q8WZ74 KRT16P3-202ENST00000580113 1012 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CTTNBP2Q8WZ74 KRT16P1-203ENST00000581027 1012 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CTTNBP2Q8WZ74 OCEL1-206ENST00000597836 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CTTNBP2Q8WZ74 AC008972.2-201ENST00000606587 494 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
CTTNBP2Q8WZ74 MYOZ3-209ENST00000615557 1031 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CTTNBP2Q8WZ74 LINC00115-201ENST00000473798 1317 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
CTTNBP2Q8WZ74 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CTTNBP2Q8WZ74 FAM90A21P-201ENST00000510875 1396 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
CTTNBP2Q8WZ74 FAM90A15P-201ENST00000514465 1395 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
CTTNBP2Q8WZ74 FAM90A6P-201ENST00000515148 1394 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
CTTNBP2Q8WZ74 FAM90A16P-201ENST00000526662 1395 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
CTTNBP2Q8WZ74 FAM90A9P-201ENST00000527940 1395 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
CTTNBP2Q8WZ74 FAM90A5P-201ENST00000528738 1395 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
CTTNBP2Q8WZ74 FAM90A14P-201ENST00000530386 1395 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
CTTNBP2Q8WZ74 FAM90A13P-201ENST00000534703 1395 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
CTTNBP2Q8WZ74 TACC3-212ENST00000612220 1756 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CTTNBP2Q8WZ74 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CTTNBP2Q8WZ74 ADPRH-205ENST00000478927 1501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CTTNBP2Q8WZ74 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CTTNBP2Q8WZ74 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CTTNBP2Q8WZ74 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CTTNBP2Q8WZ74 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CTTNBP2Q8WZ74 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CTTNBP2Q8WZ74 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CTTNBP2Q8WZ74 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CTTNBP2Q8WZ74 AC097059.1-201ENST00000413103 885 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CTTNBP2Q8WZ74 SF3B1-204ENST00000414963 651 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CTTNBP2Q8WZ74 AC011383.1-201ENST00000517474 617 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CTTNBP2Q8WZ74 AP003068.3-201ENST00000527789 175 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CTTNBP2Q8WZ74 INCA1-203ENST00000575780 1221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CTTNBP2Q8WZ74 AP005131.2-201ENST00000589045 487 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CTTNBP2Q8WZ74 C1orf232-202ENST00000635463 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CTTNBP2Q8WZ74 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CTTNBP2Q8WZ74 RHOG-201ENST00000351018 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CTTNBP2Q8WZ74 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CTTNBP2Q8WZ74 PSME2-201ENST00000216802 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CTTNBP2Q8WZ74 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CTTNBP2Q8WZ74 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CTTNBP2Q8WZ74 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CTTNBP2Q8WZ74 LINC01648-201ENST00000445180 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CTTNBP2Q8WZ74 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CTTNBP2Q8WZ74 INTS11-248ENST00000545578 2263 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CTTNBP2Q8WZ74 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CTTNBP2Q8WZ74 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CTTNBP2Q8WZ74 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CTTNBP2Q8WZ74 UBE2A-202ENST00000371558 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CTTNBP2Q8WZ74 PIGF-202ENST00000306465 1061 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CTTNBP2Q8WZ74 SURF4-203ENST00000371991 715 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CTTNBP2Q8WZ74 AC006329.1-201ENST00000419422 705 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CTTNBP2Q8WZ74 AC026470.1-201ENST00000478038 846 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
CTTNBP2Q8WZ74 RN7SL556P-201ENST00000582856 298 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
CTTNBP2Q8WZ74 AC006483.2-201ENST00000609813 515 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
CTTNBP2Q8WZ74 HMGB1P24-201ENST00000611897 328 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
CTTNBP2Q8WZ74 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CTTNBP2Q8WZ74 SCAF11-203ENST00000395453 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CTTNBP2Q8WZ74 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CTTNBP2Q8WZ74 CALCB-203ENST00000533448 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CTTNBP2Q8WZ74 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CTTNBP2Q8WZ74 TLE3-203ENST00000451782 2356 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CTTNBP2Q8WZ74 TADA3-204ENST00000440161 1617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CTTNBP2Q8WZ74 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CTTNBP2Q8WZ74 ETNPPL-206ENST00000510706 1692 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CTTNBP2Q8WZ74 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms