Protein–RNA interactions for Protein: Q86W47

KCNMB4, Calcium-activated potassium channel subunit beta-4, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNMB4Q86W47 ANK1-201ENST00000265709 6379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KCNMB4Q86W47 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KCNMB4Q86W47 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KCNMB4Q86W47 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC15.03■□□□□ -0
KCNMB4Q86W47 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KCNMB4Q86W47 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
KCNMB4Q86W47 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
KCNMB4Q86W47 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC15.03■□□□□ -0
KCNMB4Q86W47 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
KCNMB4Q86W47 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
KCNMB4Q86W47 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
KCNMB4Q86W47 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
KCNMB4Q86W47 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC15.03■□□□□ -0
KCNMB4Q86W47 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KCNMB4Q86W47 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC15.03■□□□□ -0
KCNMB4Q86W47 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
KCNMB4Q86W47 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC15.03■□□□□ -0
KCNMB4Q86W47 AC090099.1-203ENST00000527059 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KCNMB4Q86W47 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KCNMB4Q86W47 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KCNMB4Q86W47 MFNG-202ENST00000416983 2034 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
KCNMB4Q86W47 ARMC5-202ENST00000408912 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
KCNMB4Q86W47 WDR59-201ENST00000262144 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
KCNMB4Q86W47 CHRD-206ENST00000450923 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KCNMB4Q86W47 DNAI1-209ENST00000614641 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
KCNMB4Q86W47 SRRD-201ENST00000215917 4020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KCNMB4Q86W47 CDK2AP1-205ENST00000542174 1812 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
KCNMB4Q86W47 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC15.03■□□□□ -0
KCNMB4Q86W47 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
KCNMB4Q86W47 FERMT3-201ENST00000279227 2489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KCNMB4Q86W47 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KCNMB4Q86W47 PHF24-201ENST00000242315 5718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KCNMB4Q86W47 CUEDC1-206ENST00000577830 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KCNMB4Q86W47 CAMKK2-201ENST00000324774 5598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KCNMB4Q86W47 FBXO42-201ENST00000375592 6202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KCNMB4Q86W47 SPN-201ENST00000360121 6894 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KCNMB4Q86W47 LHX6-207ENST00000541397 2942 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
KCNMB4Q86W47 AC104452.1-203ENST00000636166 2266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
KCNMB4Q86W47 TRMT11-201ENST00000334379 1565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
KCNMB4Q86W47 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
KCNMB4Q86W47 TMCO3-207ENST00000474393 2843 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
KCNMB4Q86W47 CDKL3-206ENST00000521118 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
KCNMB4Q86W47 GPR132-203ENST00000539291 2779 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
KCNMB4Q86W47 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
KCNMB4Q86W47 KIAA1683-209ENST00000612316 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
KCNMB4Q86W47 KIAA0930-203ENST00000391627 2623 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
KCNMB4Q86W47 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
KCNMB4Q86W47 ST20-AS1-201ENST00000560255 4223 ntBASIC15.02■□□□□ -0
KCNMB4Q86W47 LINC00475-202ENST00000416438 2506 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
KCNMB4Q86W47 TJP3-207ENST00000589378 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
KCNMB4Q86W47 TRAPPC8-201ENST00000283351 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
KCNMB4Q86W47 PEX5L-215ENST00000485199 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
KCNMB4Q86W47 NDNF-201ENST00000379692 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
KCNMB4Q86W47 RNF157-AS1-204ENST00000590137 1812 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
KCNMB4Q86W47 CDH20-201ENST00000262717 3882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
KCNMB4Q86W47 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
KCNMB4Q86W47 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
KCNMB4Q86W47 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
KCNMB4Q86W47 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
KCNMB4Q86W47 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
KCNMB4Q86W47 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
KCNMB4Q86W47 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
KCNMB4Q86W47 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC15.02■□□□□ -0
KCNMB4Q86W47 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
KCNMB4Q86W47 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC15.02■□□□□ -0
KCNMB4Q86W47 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC15.02■□□□□ -0
KCNMB4Q86W47 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
KCNMB4Q86W47 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
KCNMB4Q86W47 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
KCNMB4Q86W47 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
KCNMB4Q86W47 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
KCNMB4Q86W47 DKKL1-202ENST00000594268 524 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
KCNMB4Q86W47 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC15.02■□□□□ -0
KCNMB4Q86W47 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
KCNMB4Q86W47 CCNF-202ENST00000397066 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
KCNMB4Q86W47 RAPGEF4-201ENST00000397081 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
KCNMB4Q86W47 MLXIPL-203ENST00000354613 3215 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
KCNMB4Q86W47 BAIAP3-202ENST00000397488 4583 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
KCNMB4Q86W47 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
KCNMB4Q86W47 SFMBT1-201ENST00000394752 4548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
KCNMB4Q86W47 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
KCNMB4Q86W47 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
KCNMB4Q86W47 MAN1B1-202ENST00000371589 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
KCNMB4Q86W47 EXTL1-201ENST00000374280 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
KCNMB4Q86W47 SLC41A3-204ENST00000383598 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
KCNMB4Q86W47 FES-202ENST00000394300 2302 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
KCNMB4Q86W47 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
KCNMB4Q86W47 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
KCNMB4Q86W47 FAM120A-202ENST00000375389 3585 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
KCNMB4Q86W47 AC092506.1-201ENST00000634580 2275 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
KCNMB4Q86W47 FLII-201ENST00000327031 4338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
KCNMB4Q86W47 ECHDC1-220ENST00000528402 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
KCNMB4Q86W47 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
KCNMB4Q86W47 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
KCNMB4Q86W47 PNPLA5-201ENST00000216177 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
KCNMB4Q86W47 MAX-219ENST00000618858 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
KCNMB4Q86W47 COL9A2-202ENST00000372748 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
KCNMB4Q86W47 KLF11-205ENST00000535335 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
KCNMB4Q86W47 TJP2-208ENST00000535702 3984 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
KCNMB4Q86W47 TDRD12-202ENST00000444215 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.6 ms