Protein–RNA interactions for Protein: P23468

PTPRD, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase delta, humanhuman

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Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRDP23468 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PTPRDP23468 SGCE-202ENST00000415788 1871 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PTPRDP23468 CTSL-201ENST00000340342 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PTPRDP23468 STRADA-243ENST00000640086 1925 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PTPRDP23468 HTR3A-205ENST00000504030 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PTPRDP23468 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PTPRDP23468 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PTPRDP23468 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PTPRDP23468 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PTPRDP23468 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
PTPRDP23468 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PTPRDP23468 ZNF619-201ENST00000314686 2233 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PTPRDP23468 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PTPRDP23468 PPT2-245ENST00000361568 1759 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PTPRDP23468 CSNK2B-201ENST00000375865 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PTPRDP23468 AL365295.1-203ENST00000435322 566 ntTSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PTPRDP23468 HLA-DQB2-232ENST00000437316 1214 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PTPRDP23468 LINC02028-203ENST00000443776 453 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PTPRDP23468 RHEB-207ENST00000496004 744 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PTPRDP23468 EEF1D-218ENST00000526838 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PTPRDP23468 REC114-202ENST00000560581 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PTPRDP23468 AC005586.2-201ENST00000563946 837 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
PTPRDP23468 AC011498.6-201ENST00000592034 510 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PTPRDP23468 AC021016.3-201ENST00000608367 477 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
PTPRDP23468 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PTPRDP23468 SVOPL-201ENST00000288513 1413 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PTPRDP23468 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PTPRDP23468 FP565260.2-201ENST00000623476 1599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PTPRDP23468 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PTPRDP23468 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
PTPRDP23468 SPACA9-203ENST00000372136 2536 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PTPRDP23468 CHPF2-204ENST00000495645 2709 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PTPRDP23468 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PTPRDP23468 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PTPRDP23468 VDAC1-201ENST00000265333 1953 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PTPRDP23468 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PTPRDP23468 EFHC1-227ENST00000637089 2133 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PTPRDP23468 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PTPRDP23468 AC092506.1-201ENST00000634580 2275 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PTPRDP23468 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PTPRDP23468 PLEKHN1-202ENST00000379409 2455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PTPRDP23468 KRTAP19-7-201ENST00000334849 440 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.02
PTPRDP23468 AL080250.1-201ENST00000438676 445 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
PTPRDP23468 CFL1-214ENST00000534769 758 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
PTPRDP23468 PPFIBP1-204ENST00000535047 875 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
PTPRDP23468 SPAG5-AS1-203ENST00000554154 491 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
PTPRDP23468 AC106738.2-201ENST00000559802 557 ntTSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.02
PTPRDP23468 PHBP15-201ENST00000574228 665 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
PTPRDP23468 ZNF286A-219ENST00000585194 607 ntTSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.02
PTPRDP23468 PGPEP1-206ENST00000597431 545 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
PTPRDP23468 SNHG1-213ENST00000540725 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
PTPRDP23468 MRGPRX4-201ENST00000314254 1444 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.02
PTPRDP23468 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
PTPRDP23468 CD59-201ENST00000351554 1775 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
PTPRDP23468 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
PTPRDP23468 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
PTPRDP23468 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
PTPRDP23468 GMEB1-202ENST00000361872 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
PTPRDP23468 ERG-207ENST00000398919 1868 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
PTPRDP23468 ZNF34-201ENST00000343459 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
PTPRDP23468 ZNF34-202ENST00000429371 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
PTPRDP23468 PRNP-201ENST00000379440 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PTPRDP23468 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PTPRDP23468 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PTPRDP23468 TRMT1-201ENST00000221504 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PTPRDP23468 TNFAIP8L3-201ENST00000327536 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PTPRDP23468 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PTPRDP23468 CCNH-201ENST00000256897 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PTPRDP23468 RPP40-201ENST00000319533 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PTPRDP23468 AC091046.1-201ENST00000331871 207 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
PTPRDP23468 CELA3B-201ENST00000337107 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PTPRDP23468 PVR-202ENST00000344956 3166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PTPRDP23468 FMR1NB-201ENST00000370467 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PTPRDP23468 LCMT1-202ENST00000380966 989 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PTPRDP23468 MIR33B-201ENST00000385104 96 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
PTPRDP23468 FOLR1-202ENST00000393676 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PTPRDP23468 HDDC2-202ENST00000398153 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PTPRDP23468 LINC00963-203ENST00000423918 1654 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PTPRDP23468 LINC00313-205ENST00000427188 967 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PTPRDP23468 AL590617.2-201ENST00000432673 917 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PTPRDP23468 AC006335.1-201ENST00000445200 547 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
PTPRDP23468 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PTPRDP23468 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PTPRDP23468 SUPT4H1P2-201ENST00000501248 353 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
PTPRDP23468 PARP8-206ENST00000503665 572 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PTPRDP23468 TMEM223-202ENST00000525631 736 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PTPRDP23468 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PTPRDP23468 GOLGA8VP-201ENST00000559009 1798 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
PTPRDP23468 AC093752.3-201ENST00000567343 901 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
PTPRDP23468 NAT9-211ENST00000580632 799 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PTPRDP23468 AC021683.1-201ENST00000585798 1767 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PTPRDP23468 AL109837.1-201ENST00000603272 613 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
PTPRDP23468 LINC00969-294ENST00000627609 992 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PTPRDP23468 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PTPRDP23468 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PTPRDP23468 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PTPRDP23468 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PTPRDP23468 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PTPRDP23468 YME1L1-202ENST00000375972 2517 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PTPRDP23468 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
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