Protein–RNA interactions for Protein: Q9UID6

ZNF639, Zinc finger protein 639, humanhuman

Predictions only

Length 485 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF639Q9UID6 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ZNF639Q9UID6 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ZNF639Q9UID6 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ZNF639Q9UID6 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ZNF639Q9UID6 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ZNF639Q9UID6 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
ZNF639Q9UID6 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ZNF639Q9UID6 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ZNF639Q9UID6 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ZNF639Q9UID6 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ZNF639Q9UID6 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
ZNF639Q9UID6 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ZNF639Q9UID6 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ZNF639Q9UID6 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ZNF639Q9UID6 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ZNF639Q9UID6 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
ZNF639Q9UID6 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ZNF639Q9UID6 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ZNF639Q9UID6 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ZNF639Q9UID6 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
ZNF639Q9UID6 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ZNF639Q9UID6 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ZNF639Q9UID6 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ZNF639Q9UID6 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ZNF639Q9UID6 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ZNF639Q9UID6 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ZNF639Q9UID6 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
ZNF639Q9UID6 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
ZNF639Q9UID6 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
ZNF639Q9UID6 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
ZNF639Q9UID6 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
ZNF639Q9UID6 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ZNF639Q9UID6 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ZNF639Q9UID6 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ZNF639Q9UID6 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ZNF639Q9UID6 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ZNF639Q9UID6 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ZNF639Q9UID6 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ZNF639Q9UID6 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ZNF639Q9UID6 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ZNF639Q9UID6 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ZNF639Q9UID6 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ZNF639Q9UID6 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ZNF639Q9UID6 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ZNF639Q9UID6 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ZNF639Q9UID6 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ZNF639Q9UID6 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ZNF639Q9UID6 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ZNF639Q9UID6 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ZNF639Q9UID6 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ZNF639Q9UID6 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ZNF639Q9UID6 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ZNF639Q9UID6 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ZNF639Q9UID6 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ZNF639Q9UID6 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ZNF639Q9UID6 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ZNF639Q9UID6 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ZNF639Q9UID6 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ZNF639Q9UID6 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ZNF639Q9UID6 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ZNF639Q9UID6 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ZNF639Q9UID6 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ZNF639Q9UID6 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ZNF639Q9UID6 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ZNF639Q9UID6 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
ZNF639Q9UID6 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ZNF639Q9UID6 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ZNF639Q9UID6 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ZNF639Q9UID6 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
ZNF639Q9UID6 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ZNF639Q9UID6 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ZNF639Q9UID6 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ZNF639Q9UID6 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ZNF639Q9UID6 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ZNF639Q9UID6 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ZNF639Q9UID6 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ZNF639Q9UID6 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ZNF639Q9UID6 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
ZNF639Q9UID6 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ZNF639Q9UID6 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ZNF639Q9UID6 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ZNF639Q9UID6 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ZNF639Q9UID6 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ZNF639Q9UID6 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ZNF639Q9UID6 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ZNF639Q9UID6 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ZNF639Q9UID6 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ZNF639Q9UID6 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ZNF639Q9UID6 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ZNF639Q9UID6 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ZNF639Q9UID6 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
ZNF639Q9UID6 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ZNF639Q9UID6 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ZNF639Q9UID6 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ZNF639Q9UID6 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ZNF639Q9UID6 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ZNF639Q9UID6 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ZNF639Q9UID6 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ZNF639Q9UID6 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ZNF639Q9UID6 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.9 ms