Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2M1

LRP2BP, LRP2-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 347 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP2BPQ9P2M1 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
LRP2BPQ9P2M1 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
LRP2BPQ9P2M1 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
LRP2BPQ9P2M1 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
LRP2BPQ9P2M1 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
LRP2BPQ9P2M1 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
LRP2BPQ9P2M1 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
LRP2BPQ9P2M1 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
LRP2BPQ9P2M1 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
LRP2BPQ9P2M1 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
LRP2BPQ9P2M1 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
LRP2BPQ9P2M1 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
LRP2BPQ9P2M1 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
LRP2BPQ9P2M1 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
LRP2BPQ9P2M1 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
LRP2BPQ9P2M1 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
LRP2BPQ9P2M1 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC27.71■■■□□ 2.03
LRP2BPQ9P2M1 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
LRP2BPQ9P2M1 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
LRP2BPQ9P2M1 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC27.7■■■□□ 2.03
LRP2BPQ9P2M1 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
LRP2BPQ9P2M1 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
LRP2BPQ9P2M1 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
LRP2BPQ9P2M1 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
LRP2BPQ9P2M1 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
LRP2BPQ9P2M1 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
LRP2BPQ9P2M1 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
LRP2BPQ9P2M1 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
LRP2BPQ9P2M1 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
LRP2BPQ9P2M1 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC27.69■■■□□ 2.02
LRP2BPQ9P2M1 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
LRP2BPQ9P2M1 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
LRP2BPQ9P2M1 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
LRP2BPQ9P2M1 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
LRP2BPQ9P2M1 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
LRP2BPQ9P2M1 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
LRP2BPQ9P2M1 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
LRP2BPQ9P2M1 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
LRP2BPQ9P2M1 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
LRP2BPQ9P2M1 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
LRP2BPQ9P2M1 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
LRP2BPQ9P2M1 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
LRP2BPQ9P2M1 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
LRP2BPQ9P2M1 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
LRP2BPQ9P2M1 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
LRP2BPQ9P2M1 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
LRP2BPQ9P2M1 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
LRP2BPQ9P2M1 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
LRP2BPQ9P2M1 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
LRP2BPQ9P2M1 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
LRP2BPQ9P2M1 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC27.66■■■□□ 2.02
LRP2BPQ9P2M1 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
LRP2BPQ9P2M1 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
LRP2BPQ9P2M1 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
LRP2BPQ9P2M1 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
LRP2BPQ9P2M1 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
LRP2BPQ9P2M1 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
LRP2BPQ9P2M1 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
LRP2BPQ9P2M1 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
LRP2BPQ9P2M1 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
LRP2BPQ9P2M1 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
LRP2BPQ9P2M1 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
LRP2BPQ9P2M1 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
LRP2BPQ9P2M1 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
LRP2BPQ9P2M1 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
LRP2BPQ9P2M1 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
LRP2BPQ9P2M1 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
LRP2BPQ9P2M1 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
LRP2BPQ9P2M1 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
LRP2BPQ9P2M1 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
LRP2BPQ9P2M1 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
LRP2BPQ9P2M1 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
LRP2BPQ9P2M1 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
LRP2BPQ9P2M1 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
LRP2BPQ9P2M1 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
LRP2BPQ9P2M1 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
LRP2BPQ9P2M1 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
LRP2BPQ9P2M1 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
LRP2BPQ9P2M1 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
LRP2BPQ9P2M1 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
LRP2BPQ9P2M1 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
LRP2BPQ9P2M1 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
LRP2BPQ9P2M1 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
LRP2BPQ9P2M1 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
LRP2BPQ9P2M1 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
LRP2BPQ9P2M1 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC27.61■■■□□ 2.01
LRP2BPQ9P2M1 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
LRP2BPQ9P2M1 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
LRP2BPQ9P2M1 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
LRP2BPQ9P2M1 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
LRP2BPQ9P2M1 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
LRP2BPQ9P2M1 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
LRP2BPQ9P2M1 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
LRP2BPQ9P2M1 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
LRP2BPQ9P2M1 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
LRP2BPQ9P2M1 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
LRP2BPQ9P2M1 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
LRP2BPQ9P2M1 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
LRP2BPQ9P2M1 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
LRP2BPQ9P2M1 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms