Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRW3

APOBEC3C, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3C, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 190 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3CQ9NRW3 NFATC1-202ENST00000318065 4302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.466e-6■■□□□ 11.7
APOBEC3CQ9NRW3 LRRD1-202ENST00000422722 3511 ntTSL 210.47□□□□□ -0.736e-6■■□□□ 11.7
APOBEC3CQ9NRW3 CYP51A1-204ENST00000450723 1729 ntTSL 2 BASIC7.42□□□□□ -1.226e-6■■□□□ 11.7
APOBEC3CQ9NRW3 CYP51A1-205ENST00000482924 555 ntTSL 25.66□□□□□ -1.56e-6■■□□□ 11.7
APOBEC3CQ9NRW3 CYP51A1-202ENST00000422867 747 ntTSL 35.42□□□□□ -1.546e-6■■□□□ 11.7
APOBEC3CQ9NRW3 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.712e-7■■□□□ 11.6
APOBEC3CQ9NRW3 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.622e-7■■□□□ 11.6
APOBEC3CQ9NRW3 UXT-205ENST00000485641 627 ntTSL 317.82■□□□□ 0.442e-7■■□□□ 11.6
APOBEC3CQ9NRW3 UXT-203ENST00000376964 894 ntTSL 216.71■□□□□ 0.272e-7■■□□□ 11.6
APOBEC3CQ9NRW3 ATP5B-203ENST00000547808 705 ntTSL 520.98■□□□□ 0.957e-16■■□□□ 11.6
APOBEC3CQ9NRW3 STXBP2-205ENST00000593854 704 ntTSL 220.21■□□□□ 0.835e-7■■□□□ 11.6
APOBEC3CQ9NRW3 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.775e-7■■□□□ 11.6
APOBEC3CQ9NRW3 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.112e-6■■□□□ 11.6
APOBEC3CQ9NRW3 XRCC5-202ENST00000392133 3761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.3□□□□□ -1.089e-11■■□□□ 11.6
APOBEC3CQ9NRW3 XRCC5-209ENST00000485763 616 ntTSL 27.46□□□□□ -1.229e-11■■□□□ 11.6
APOBEC3CQ9NRW3 XRCC5-201ENST00000392132 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.459e-11■■□□□ 11.6
APOBEC3CQ9NRW3 XRCC5-206ENST00000460284 2962 ntTSL 1 (best)5.71□□□□□ -1.59e-11■■□□□ 11.6
APOBEC3CQ9NRW3 RPL15-209ENST00000436146 1990 ntTSL 56.92□□□□□ -1.32e-11■■□□□ 11.5
APOBEC3CQ9NRW3 APOC1-208ENST00000592535 430 ntTSL 1 (best)15.2■□□□□ 0.028e-7■■□□□ 11.5
APOBEC3CQ9NRW3 APOC1-209ENST00000592885 562 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.068e-7■■□□□ 11.5
APOBEC3CQ9NRW3 APOC1-203ENST00000588802 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.648e-7■■□□□ 11.5
APOBEC3CQ9NRW3 APOC1-205ENST00000589781 273 ntTSL 3 BASIC10.53□□□□□ -0.728e-7■■□□□ 11.5
APOBEC3CQ9NRW3 APOC1-202ENST00000588750 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.998e-7■■□□□ 11.5
APOBEC3CQ9NRW3 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.723e-43■■□□□ 11.5
APOBEC3CQ9NRW3 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.533e-43■■□□□ 11.5
APOBEC3CQ9NRW3 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.273e-43■■□□□ 11.5
APOBEC3CQ9NRW3 RPL36-204ENST00000579446 452 ntTSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.483e-43■■□□□ 11.5
APOBEC3CQ9NRW3 RPL36-205ENST00000579649 449 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.753e-43■■□□□ 11.5
APOBEC3CQ9NRW3 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.687e-16■■□□□ 11.5
APOBEC3CQ9NRW3 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.427e-16■■□□□ 11.5
APOBEC3CQ9NRW3 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.317e-16■■□□□ 11.5
APOBEC3CQ9NRW3 HMGA1-206ENST00000478214 716 ntTSL 1 (best)16.94■□□□□ 0.37e-16■■□□□ 11.5
APOBEC3CQ9NRW3 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.087e-16■■□□□ 11.5
APOBEC3CQ9NRW3 HMGA1-203ENST00000374116 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.047e-16■■□□□ 11.5
APOBEC3CQ9NRW3 BHLHE40-201ENST00000256495 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.411e-17■■□□□ 11.5
APOBEC3CQ9NRW3 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.211e-26■■□□□ 11.5
APOBEC3CQ9NRW3 YBX1-203ENST00000436427 1524 ntTSL 1 (best)22.54■■□□□ 1.21e-26■■□□□ 11.5
APOBEC3CQ9NRW3 APOC1-206ENST00000590334 508 ntTSL 512.9□□□□□ -0.349e-7■■□□□ 11.5
APOBEC3CQ9NRW3 APOC1-201ENST00000586638 425 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.739e-7■■□□□ 11.5
APOBEC3CQ9NRW3 APOC1-207ENST00000592176 514 ntTSL 510.23□□□□□ -0.779e-7■■□□□ 11.5
APOBEC3CQ9NRW3 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.132e-10■■□□□ 11.4
APOBEC3CQ9NRW3 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.72e-10■■□□□ 11.4
APOBEC3CQ9NRW3 COX6C-202ENST00000517682 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.82e-10■■□□□ 11.4
APOBEC3CQ9NRW3 COX6C-211ENST00000606245 646 nt9.93□□□□□ -0.822e-10■■□□□ 11.4
APOBEC3CQ9NRW3 COX6C-201ENST00000297564 433 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.882e-10■■□□□ 11.4
APOBEC3CQ9NRW3 COX6C-205ENST00000520468 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.13□□□□□ -1.112e-10■■□□□ 11.4
APOBEC3CQ9NRW3 COX6C-210ENST00000524245 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.71□□□□□ -1.182e-10■■□□□ 11.4
APOBEC3CQ9NRW3 COX6C-206ENST00000520517 566 ntTSL 45.23□□□□□ -1.572e-10■■□□□ 11.4
APOBEC3CQ9NRW3 COX6C-207ENST00000522934 562 ntTSL 44.95□□□□□ -1.622e-10■■□□□ 11.4
APOBEC3CQ9NRW3 SMAP2-202ENST00000372718 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best)16.85■□□□□ 0.291e-6■■□□□ 11.4
APOBEC3CQ9NRW3 SMAP2-205ENST00000539317 2501 ntTSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.611e-6■■□□□ 11.4
APOBEC3CQ9NRW3 SMAP2-206ENST00000614549 2570 ntTSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.941e-6■■□□□ 11.4
APOBEC3CQ9NRW3 SMAP2-201ENST00000372708 2473 ntTSL 1 (best)9□□□□□ -0.971e-6■■□□□ 11.4
APOBEC3CQ9NRW3 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.53e-6■■□□□ 11.4
APOBEC3CQ9NRW3 UQCRC1-203ENST00000415995 1387 ntTSL 517.08■□□□□ 0.323e-6■■□□□ 11.4
APOBEC3CQ9NRW3 SNRPD2-206ENST00000588301 702 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.081e-9■■□□□ 11.4
APOBEC3CQ9NRW3 SNRPD2-203ENST00000585392 379 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.231e-9■■□□□ 11.4
APOBEC3CQ9NRW3 SNRPD2-207ENST00000588599 805 ntTSL 3 BASIC12.49□□□□□ -0.411e-9■■□□□ 11.4
APOBEC3CQ9NRW3 SNRPD2-204ENST00000587367 596 ntTSL 3 BASIC12.02□□□□□ -0.491e-9■■□□□ 11.4
APOBEC3CQ9NRW3 SNRPD2-202ENST00000391932 615 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.581e-9■■□□□ 11.4
APOBEC3CQ9NRW3 SNRPD2-201ENST00000342669 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.621e-9■■□□□ 11.4
APOBEC3CQ9NRW3 SNRPD2-208ENST00000590212 454 ntTSL 3 BASIC10.9□□□□□ -0.661e-9■■□□□ 11.4
APOBEC3CQ9NRW3 FUS-212ENST00000569760 639 ntTSL 225.69■■□□□ 1.79e-12■■□□□ 11.4
APOBEC3CQ9NRW3 FUS-204ENST00000483853 778 ntTSL 223.39■■□□□ 1.339e-12■■□□□ 11.4
APOBEC3CQ9NRW3 COX7B-202ENST00000475465 685 ntTSL 210.01□□□□□ -0.813e-8■■□□□ 11.4
APOBEC3CQ9NRW3 SSBP1-203ENST00000463093 600 ntTSL 514.73□□□□□ -0.056e-9■■□□□ 11.4
APOBEC3CQ9NRW3 SSBP1-212ENST00000489378 1434 ntTSL 210.32□□□□□ -0.766e-9■■□□□ 11.4
APOBEC3CQ9NRW3 MIR20A-201ENST00000362279 71 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.454e-8■■□□□ 11.4
APOBEC3CQ9NRW3 SOD1-204ENST00000476106 586 ntTSL 514.75□□□□□ -0.051e-10■■□□□ 11.4
APOBEC3CQ9NRW3 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.122e-8■□□□□ 11.3
APOBEC3CQ9NRW3 CANX-202ENST00000452673 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.22e-8■□□□□ 11.3
APOBEC3CQ9NRW3 AL365205.1-201ENST00000456057 3947 ntTSL 215.57■□□□□ 0.085e-9■□□□□ 11.3
APOBEC3CQ9NRW3 AL365205.1-203ENST00000335515 2871 ntTSL 212.83□□□□□ -0.365e-9■□□□□ 11.3
APOBEC3CQ9NRW3 AL365205.1-202ENST00000487182 3043 ntTSL 212.21□□□□□ -0.455e-9■□□□□ 11.3
APOBEC3CQ9NRW3 TOMM6-201ENST00000398881 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.865e-9■□□□□ 11.3
APOBEC3CQ9NRW3 TOMM6-202ENST00000398884 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.215e-9■□□□□ 11.3
APOBEC3CQ9NRW3 ZFAS1-207ENST00000458653 596 ntTSL 230.8■■■□□ 2.524e-10■□□□□ 11.3
APOBEC3CQ9NRW3 PSMA4-212ENST00000559365 786 ntTSL 529.7■■■□□ 2.354e-10■□□□□ 11.3
APOBEC3CQ9NRW3 GUK1-218ENST00000469973 795 ntTSL 228.31■■■□□ 2.129e-7■□□□□ 11.3
APOBEC3CQ9NRW3 ZFAS1-202ENST00000371743 1008 ntTSL 1 (best)27.66■■■□□ 2.024e-10■□□□□ 11.3
APOBEC3CQ9NRW3 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.961e-8■□□□□ 11.3
APOBEC3CQ9NRW3 ZFAS1-203ENST00000417721 860 ntTSL 1 (best)26.71■■□□□ 1.874e-10■□□□□ 11.3
APOBEC3CQ9NRW3 LSM7-205ENST00000589532 539 ntTSL 326.24■■□□□ 1.791e-8■□□□□ 11.3
APOBEC3CQ9NRW3 SLC25A1-203ENST00000461267 804 ntTSL 325.84■■□□□ 1.739e-7■□□□□ 11.3
APOBEC3CQ9NRW3 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.691e-8■□□□□ 11.3
APOBEC3CQ9NRW3 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.669e-7■□□□□ 11.3
APOBEC3CQ9NRW3 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.631e-8■□□□□ 11.3
APOBEC3CQ9NRW3 VAPA-205ENST00000578314 532 ntTSL 325.16■■□□□ 1.624e-10■□□□□ 11.3
APOBEC3CQ9NRW3 LSM7-202ENST00000585395 621 ntTSL 325.03■■□□□ 1.61e-8■□□□□ 11.3
APOBEC3CQ9NRW3 LSM7-206ENST00000591515 710 ntTSL 224.97■■□□□ 1.591e-8■□□□□ 11.3
APOBEC3CQ9NRW3 SKP1-206ENST00000519321 692 ntTSL 324.43■■□□□ 1.51e-8■□□□□ 11.3
APOBEC3CQ9NRW3 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.499e-7■□□□□ 11.3
APOBEC3CQ9NRW3 RPL13-203ENST00000399461 879 ntTSL 224.36■■□□□ 1.491e-8■□□□□ 11.3
APOBEC3CQ9NRW3 SLC25A1-205ENST00000470922 1598 ntTSL 224■■□□□ 1.439e-7■□□□□ 11.3
APOBEC3CQ9NRW3 ZFAS1-205ENST00000441722 946 ntTSL 1 (best)23.5■■□□□ 1.354e-10■□□□□ 11.3
APOBEC3CQ9NRW3 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.354e-10■□□□□ 11.3
APOBEC3CQ9NRW3 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.081e-8■□□□□ 11.3
APOBEC3CQ9NRW3 RPL13-212ENST00000563749 2367 nt21.65■■□□□ 1.061e-8■□□□□ 11.3
APOBEC3CQ9NRW3 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.049e-7■□□□□ 11.3
APOBEC3CQ9NRW3 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.011e-8■□□□□ 11.3
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