Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP84

TNFRSF12A, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 12A, humanhuman

Predictions only

Length 129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF12AQ9NP84 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TNFRSF12AQ9NP84 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
TNFRSF12AQ9NP84 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TNFRSF12AQ9NP84 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
TNFRSF12AQ9NP84 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
TNFRSF12AQ9NP84 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TNFRSF12AQ9NP84 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TNFRSF12AQ9NP84 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TNFRSF12AQ9NP84 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TNFRSF12AQ9NP84 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TNFRSF12AQ9NP84 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TNFRSF12AQ9NP84 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TNFRSF12AQ9NP84 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TNFRSF12AQ9NP84 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TNFRSF12AQ9NP84 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TNFRSF12AQ9NP84 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TNFRSF12AQ9NP84 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TNFRSF12AQ9NP84 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TNFRSF12AQ9NP84 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TNFRSF12AQ9NP84 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TNFRSF12AQ9NP84 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TNFRSF12AQ9NP84 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TNFRSF12AQ9NP84 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TNFRSF12AQ9NP84 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TNFRSF12AQ9NP84 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TNFRSF12AQ9NP84 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TNFRSF12AQ9NP84 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TNFRSF12AQ9NP84 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TNFRSF12AQ9NP84 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TNFRSF12AQ9NP84 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TNFRSF12AQ9NP84 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TNFRSF12AQ9NP84 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TNFRSF12AQ9NP84 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TNFRSF12AQ9NP84 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TNFRSF12AQ9NP84 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TNFRSF12AQ9NP84 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TNFRSF12AQ9NP84 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TNFRSF12AQ9NP84 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TNFRSF12AQ9NP84 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TNFRSF12AQ9NP84 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TNFRSF12AQ9NP84 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TNFRSF12AQ9NP84 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TNFRSF12AQ9NP84 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TNFRSF12AQ9NP84 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TNFRSF12AQ9NP84 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TNFRSF12AQ9NP84 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TNFRSF12AQ9NP84 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TNFRSF12AQ9NP84 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TNFRSF12AQ9NP84 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TNFRSF12AQ9NP84 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TNFRSF12AQ9NP84 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TNFRSF12AQ9NP84 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
TNFRSF12AQ9NP84 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TNFRSF12AQ9NP84 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TNFRSF12AQ9NP84 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TNFRSF12AQ9NP84 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TNFRSF12AQ9NP84 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TNFRSF12AQ9NP84 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TNFRSF12AQ9NP84 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TNFRSF12AQ9NP84 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TNFRSF12AQ9NP84 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TNFRSF12AQ9NP84 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
TNFRSF12AQ9NP84 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
TNFRSF12AQ9NP84 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TNFRSF12AQ9NP84 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TNFRSF12AQ9NP84 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TNFRSF12AQ9NP84 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
TNFRSF12AQ9NP84 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TNFRSF12AQ9NP84 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TNFRSF12AQ9NP84 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TNFRSF12AQ9NP84 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TNFRSF12AQ9NP84 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TNFRSF12AQ9NP84 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TNFRSF12AQ9NP84 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
TNFRSF12AQ9NP84 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TNFRSF12AQ9NP84 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TNFRSF12AQ9NP84 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TNFRSF12AQ9NP84 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TNFRSF12AQ9NP84 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TNFRSF12AQ9NP84 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
TNFRSF12AQ9NP84 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TNFRSF12AQ9NP84 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TNFRSF12AQ9NP84 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TNFRSF12AQ9NP84 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TNFRSF12AQ9NP84 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TNFRSF12AQ9NP84 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TNFRSF12AQ9NP84 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
TNFRSF12AQ9NP84 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TNFRSF12AQ9NP84 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TNFRSF12AQ9NP84 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TNFRSF12AQ9NP84 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TNFRSF12AQ9NP84 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TNFRSF12AQ9NP84 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TNFRSF12AQ9NP84 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TNFRSF12AQ9NP84 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TNFRSF12AQ9NP84 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TNFRSF12AQ9NP84 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TNFRSF12AQ9NP84 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TNFRSF12AQ9NP84 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TNFRSF12AQ9NP84 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms