Protein–RNA interactions for Protein: Q86YC2

PALB2, Partner and localizer of BRCA2, humanhuman

Predictions only

Length 1,186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PALB2Q86YC2 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PALB2Q86YC2 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PALB2Q86YC2 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PALB2Q86YC2 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
PALB2Q86YC2 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PALB2Q86YC2 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PALB2Q86YC2 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PALB2Q86YC2 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PALB2Q86YC2 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PALB2Q86YC2 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
PALB2Q86YC2 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
PALB2Q86YC2 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
PALB2Q86YC2 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
PALB2Q86YC2 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PALB2Q86YC2 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PALB2Q86YC2 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PALB2Q86YC2 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PALB2Q86YC2 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PALB2Q86YC2 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PALB2Q86YC2 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PALB2Q86YC2 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
PALB2Q86YC2 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PALB2Q86YC2 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PALB2Q86YC2 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PALB2Q86YC2 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PALB2Q86YC2 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PALB2Q86YC2 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PALB2Q86YC2 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PALB2Q86YC2 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PALB2Q86YC2 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PALB2Q86YC2 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PALB2Q86YC2 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PALB2Q86YC2 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PALB2Q86YC2 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PALB2Q86YC2 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PALB2Q86YC2 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PALB2Q86YC2 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PALB2Q86YC2 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PALB2Q86YC2 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
PALB2Q86YC2 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PALB2Q86YC2 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PALB2Q86YC2 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PALB2Q86YC2 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PALB2Q86YC2 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PALB2Q86YC2 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PALB2Q86YC2 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PALB2Q86YC2 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PALB2Q86YC2 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PALB2Q86YC2 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PALB2Q86YC2 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PALB2Q86YC2 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PALB2Q86YC2 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PALB2Q86YC2 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PALB2Q86YC2 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PALB2Q86YC2 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
PALB2Q86YC2 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PALB2Q86YC2 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PALB2Q86YC2 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PALB2Q86YC2 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PALB2Q86YC2 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PALB2Q86YC2 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PALB2Q86YC2 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PALB2Q86YC2 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PALB2Q86YC2 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PALB2Q86YC2 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PALB2Q86YC2 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PALB2Q86YC2 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PALB2Q86YC2 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
PALB2Q86YC2 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PALB2Q86YC2 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PALB2Q86YC2 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PALB2Q86YC2 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PALB2Q86YC2 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
PALB2Q86YC2 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PALB2Q86YC2 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PALB2Q86YC2 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PALB2Q86YC2 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PALB2Q86YC2 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PALB2Q86YC2 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PALB2Q86YC2 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PALB2Q86YC2 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PALB2Q86YC2 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PALB2Q86YC2 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PALB2Q86YC2 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PALB2Q86YC2 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PALB2Q86YC2 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PALB2Q86YC2 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PALB2Q86YC2 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PALB2Q86YC2 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
PALB2Q86YC2 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PALB2Q86YC2 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PALB2Q86YC2 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PALB2Q86YC2 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PALB2Q86YC2 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PALB2Q86YC2 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PALB2Q86YC2 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PALB2Q86YC2 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PALB2Q86YC2 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PALB2Q86YC2 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PALB2Q86YC2 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms