Protein–RNA interactions for Protein: Q53HC0

CCDC92, Coiled-coil domain-containing protein 92, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC92Q53HC0 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CCDC92Q53HC0 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CCDC92Q53HC0 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
CCDC92Q53HC0 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
CCDC92Q53HC0 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
CCDC92Q53HC0 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCDC92Q53HC0 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCDC92Q53HC0 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCDC92Q53HC0 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCDC92Q53HC0 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCDC92Q53HC0 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCDC92Q53HC0 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
CCDC92Q53HC0 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCDC92Q53HC0 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCDC92Q53HC0 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCDC92Q53HC0 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCDC92Q53HC0 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCDC92Q53HC0 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCDC92Q53HC0 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCDC92Q53HC0 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCDC92Q53HC0 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCDC92Q53HC0 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCDC92Q53HC0 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCDC92Q53HC0 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCDC92Q53HC0 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCDC92Q53HC0 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCDC92Q53HC0 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCDC92Q53HC0 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCDC92Q53HC0 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCDC92Q53HC0 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCDC92Q53HC0 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCDC92Q53HC0 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCDC92Q53HC0 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCDC92Q53HC0 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCDC92Q53HC0 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
CCDC92Q53HC0 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCDC92Q53HC0 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCDC92Q53HC0 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC92Q53HC0 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC92Q53HC0 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC92Q53HC0 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC92Q53HC0 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC92Q53HC0 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC92Q53HC0 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC92Q53HC0 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC92Q53HC0 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC92Q53HC0 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC92Q53HC0 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC92Q53HC0 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC92Q53HC0 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC92Q53HC0 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC92Q53HC0 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC92Q53HC0 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC92Q53HC0 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC92Q53HC0 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC92Q53HC0 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC92Q53HC0 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC92Q53HC0 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC92Q53HC0 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC92Q53HC0 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC92Q53HC0 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC92Q53HC0 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCDC92Q53HC0 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
CCDC92Q53HC0 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCDC92Q53HC0 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCDC92Q53HC0 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
CCDC92Q53HC0 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
CCDC92Q53HC0 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
CCDC92Q53HC0 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCDC92Q53HC0 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCDC92Q53HC0 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCDC92Q53HC0 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCDC92Q53HC0 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCDC92Q53HC0 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCDC92Q53HC0 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCDC92Q53HC0 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCDC92Q53HC0 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCDC92Q53HC0 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCDC92Q53HC0 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCDC92Q53HC0 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCDC92Q53HC0 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCDC92Q53HC0 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCDC92Q53HC0 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCDC92Q53HC0 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCDC92Q53HC0 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCDC92Q53HC0 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCDC92Q53HC0 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCDC92Q53HC0 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCDC92Q53HC0 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCDC92Q53HC0 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCDC92Q53HC0 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCDC92Q53HC0 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCDC92Q53HC0 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCDC92Q53HC0 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCDC92Q53HC0 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCDC92Q53HC0 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCDC92Q53HC0 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
CCDC92Q53HC0 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCDC92Q53HC0 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCDC92Q53HC0 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.2 ms