Protein–RNA interactions for Protein: Q16825

PTPN21, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 21, humanhuman

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Length 1,174 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN21Q16825 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.68
PTPN21Q16825 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
PTPN21Q16825 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.68
PTPN21Q16825 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PTPN21Q16825 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PTPN21Q16825 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PTPN21Q16825 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
PTPN21Q16825 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PTPN21Q16825 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PTPN21Q16825 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PTPN21Q16825 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PTPN21Q16825 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PTPN21Q16825 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PTPN21Q16825 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PTPN21Q16825 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PTPN21Q16825 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PTPN21Q16825 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
PTPN21Q16825 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PTPN21Q16825 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PTPN21Q16825 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PTPN21Q16825 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PTPN21Q16825 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PTPN21Q16825 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PTPN21Q16825 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PTPN21Q16825 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PTPN21Q16825 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PTPN21Q16825 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PTPN21Q16825 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PTPN21Q16825 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PTPN21Q16825 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PTPN21Q16825 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PTPN21Q16825 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PTPN21Q16825 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PTPN21Q16825 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PTPN21Q16825 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PTPN21Q16825 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PTPN21Q16825 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PTPN21Q16825 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PTPN21Q16825 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PTPN21Q16825 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PTPN21Q16825 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PTPN21Q16825 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PTPN21Q16825 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PTPN21Q16825 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PTPN21Q16825 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PTPN21Q16825 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PTPN21Q16825 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PTPN21Q16825 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PTPN21Q16825 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PTPN21Q16825 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
PTPN21Q16825 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.68
PTPN21Q16825 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PTPN21Q16825 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PTPN21Q16825 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PTPN21Q16825 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PTPN21Q16825 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PTPN21Q16825 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PTPN21Q16825 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PTPN21Q16825 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PTPN21Q16825 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PTPN21Q16825 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PTPN21Q16825 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PTPN21Q16825 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PTPN21Q16825 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PTPN21Q16825 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PTPN21Q16825 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PTPN21Q16825 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PTPN21Q16825 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
PTPN21Q16825 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PTPN21Q16825 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PTPN21Q16825 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PTPN21Q16825 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PTPN21Q16825 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PTPN21Q16825 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PTPN21Q16825 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PTPN21Q16825 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PTPN21Q16825 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PTPN21Q16825 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PTPN21Q16825 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PTPN21Q16825 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PTPN21Q16825 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
PTPN21Q16825 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PTPN21Q16825 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PTPN21Q16825 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PTPN21Q16825 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PTPN21Q16825 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PTPN21Q16825 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PTPN21Q16825 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PTPN21Q16825 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
PTPN21Q16825 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PTPN21Q16825 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PTPN21Q16825 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PTPN21Q16825 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PTPN21Q16825 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PTPN21Q16825 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PTPN21Q16825 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PTPN21Q16825 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PTPN21Q16825 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PTPN21Q16825 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PTPN21Q16825 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
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