Protein–RNA interactions for Protein: Q13601

KRR1, KRR1 small subunit processome component homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 381 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRR1Q13601 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
KRR1Q13601 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
KRR1Q13601 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
KRR1Q13601 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
KRR1Q13601 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
KRR1Q13601 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
KRR1Q13601 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
KRR1Q13601 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
KRR1Q13601 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
KRR1Q13601 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
KRR1Q13601 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
KRR1Q13601 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
KRR1Q13601 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
KRR1Q13601 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
KRR1Q13601 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
KRR1Q13601 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
KRR1Q13601 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
KRR1Q13601 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
KRR1Q13601 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
KRR1Q13601 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
KRR1Q13601 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
KRR1Q13601 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
KRR1Q13601 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
KRR1Q13601 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
KRR1Q13601 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
KRR1Q13601 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
KRR1Q13601 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
KRR1Q13601 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
KRR1Q13601 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
KRR1Q13601 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
KRR1Q13601 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
KRR1Q13601 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
KRR1Q13601 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
KRR1Q13601 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
KRR1Q13601 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
KRR1Q13601 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
KRR1Q13601 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
KRR1Q13601 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
KRR1Q13601 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
KRR1Q13601 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
KRR1Q13601 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
KRR1Q13601 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
KRR1Q13601 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
KRR1Q13601 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
KRR1Q13601 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
KRR1Q13601 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
KRR1Q13601 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
KRR1Q13601 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
KRR1Q13601 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
KRR1Q13601 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
KRR1Q13601 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
KRR1Q13601 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
KRR1Q13601 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
KRR1Q13601 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
KRR1Q13601 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
KRR1Q13601 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
KRR1Q13601 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
KRR1Q13601 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
KRR1Q13601 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
KRR1Q13601 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
KRR1Q13601 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
KRR1Q13601 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
KRR1Q13601 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
KRR1Q13601 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
KRR1Q13601 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
KRR1Q13601 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
KRR1Q13601 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
KRR1Q13601 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
KRR1Q13601 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
KRR1Q13601 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
KRR1Q13601 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
KRR1Q13601 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
KRR1Q13601 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
KRR1Q13601 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
KRR1Q13601 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
KRR1Q13601 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
KRR1Q13601 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
KRR1Q13601 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
KRR1Q13601 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
KRR1Q13601 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
KRR1Q13601 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
KRR1Q13601 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
KRR1Q13601 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
KRR1Q13601 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
KRR1Q13601 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
KRR1Q13601 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
KRR1Q13601 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
KRR1Q13601 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
KRR1Q13601 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
KRR1Q13601 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
KRR1Q13601 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
KRR1Q13601 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
KRR1Q13601 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
KRR1Q13601 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
KRR1Q13601 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
KRR1Q13601 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
KRR1Q13601 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
KRR1Q13601 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
KRR1Q13601 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
KRR1Q13601 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
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