Protein–RNA interactions for Protein: P67936

TPM4, Tropomyosin alpha-4 chain, humanhuman

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPM4P67936 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TPM4P67936 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TPM4P67936 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TPM4P67936 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
TPM4P67936 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TPM4P67936 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TPM4P67936 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TPM4P67936 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TPM4P67936 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TPM4P67936 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TPM4P67936 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TPM4P67936 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TPM4P67936 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TPM4P67936 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TPM4P67936 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TPM4P67936 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TPM4P67936 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TPM4P67936 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TPM4P67936 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TPM4P67936 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TPM4P67936 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TPM4P67936 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TPM4P67936 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TPM4P67936 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TPM4P67936 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TPM4P67936 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TPM4P67936 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TPM4P67936 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
TPM4P67936 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TPM4P67936 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TPM4P67936 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TPM4P67936 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
TPM4P67936 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
TPM4P67936 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
TPM4P67936 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
TPM4P67936 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TPM4P67936 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TPM4P67936 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TPM4P67936 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TPM4P67936 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TPM4P67936 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TPM4P67936 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TPM4P67936 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TPM4P67936 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TPM4P67936 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TPM4P67936 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TPM4P67936 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TPM4P67936 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TPM4P67936 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TPM4P67936 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TPM4P67936 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TPM4P67936 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TPM4P67936 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TPM4P67936 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TPM4P67936 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TPM4P67936 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TPM4P67936 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TPM4P67936 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TPM4P67936 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
TPM4P67936 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TPM4P67936 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TPM4P67936 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TPM4P67936 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TPM4P67936 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TPM4P67936 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TPM4P67936 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TPM4P67936 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TPM4P67936 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TPM4P67936 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TPM4P67936 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TPM4P67936 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TPM4P67936 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TPM4P67936 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
TPM4P67936 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
TPM4P67936 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
TPM4P67936 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TPM4P67936 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TPM4P67936 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TPM4P67936 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TPM4P67936 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TPM4P67936 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TPM4P67936 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TPM4P67936 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TPM4P67936 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TPM4P67936 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TPM4P67936 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TPM4P67936 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TPM4P67936 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TPM4P67936 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TPM4P67936 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TPM4P67936 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TPM4P67936 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TPM4P67936 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TPM4P67936 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TPM4P67936 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TPM4P67936 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TPM4P67936 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
TPM4P67936 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TPM4P67936 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TPM4P67936 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.1 ms