Protein–RNA interactions for Protein: O75822

EIF3J, Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit J, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 258 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIF3JO75822 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
EIF3JO75822 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
EIF3JO75822 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
EIF3JO75822 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
EIF3JO75822 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
EIF3JO75822 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC26.18■■□□□ 1.78
EIF3JO75822 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
EIF3JO75822 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
EIF3JO75822 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
EIF3JO75822 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
EIF3JO75822 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
EIF3JO75822 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
EIF3JO75822 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
EIF3JO75822 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
EIF3JO75822 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
EIF3JO75822 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
EIF3JO75822 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
EIF3JO75822 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
EIF3JO75822 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
EIF3JO75822 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
EIF3JO75822 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
EIF3JO75822 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
EIF3JO75822 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
EIF3JO75822 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
EIF3JO75822 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
EIF3JO75822 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
EIF3JO75822 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
EIF3JO75822 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
EIF3JO75822 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
EIF3JO75822 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
EIF3JO75822 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
EIF3JO75822 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
EIF3JO75822 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
EIF3JO75822 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
EIF3JO75822 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
EIF3JO75822 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
EIF3JO75822 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
EIF3JO75822 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
EIF3JO75822 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC26.14■■□□□ 1.78
EIF3JO75822 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
EIF3JO75822 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
EIF3JO75822 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
EIF3JO75822 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
EIF3JO75822 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
EIF3JO75822 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
EIF3JO75822 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
EIF3JO75822 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
EIF3JO75822 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC26.14■■□□□ 1.77
EIF3JO75822 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
EIF3JO75822 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
EIF3JO75822 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
EIF3JO75822 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
EIF3JO75822 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
EIF3JO75822 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
EIF3JO75822 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
EIF3JO75822 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
EIF3JO75822 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
EIF3JO75822 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
EIF3JO75822 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
EIF3JO75822 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
EIF3JO75822 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
EIF3JO75822 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
EIF3JO75822 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
EIF3JO75822 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
EIF3JO75822 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
EIF3JO75822 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
EIF3JO75822 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
EIF3JO75822 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
EIF3JO75822 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
EIF3JO75822 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
EIF3JO75822 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
EIF3JO75822 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
EIF3JO75822 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
EIF3JO75822 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
EIF3JO75822 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
EIF3JO75822 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
EIF3JO75822 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
EIF3JO75822 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
EIF3JO75822 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
EIF3JO75822 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
EIF3JO75822 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
EIF3JO75822 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
EIF3JO75822 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
EIF3JO75822 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
EIF3JO75822 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
EIF3JO75822 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
EIF3JO75822 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
EIF3JO75822 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
EIF3JO75822 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
EIF3JO75822 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
EIF3JO75822 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
EIF3JO75822 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
EIF3JO75822 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
EIF3JO75822 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
EIF3JO75822 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
EIF3JO75822 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
EIF3JO75822 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
EIF3JO75822 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
EIF3JO75822 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
EIF3JO75822 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms