Protein–RNA interactions for Protein: O43491

EPB41L2, Band 4.1-like protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,005 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPB41L2O43491 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
EPB41L2O43491 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
EPB41L2O43491 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
EPB41L2O43491 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
EPB41L2O43491 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
EPB41L2O43491 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
EPB41L2O43491 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
EPB41L2O43491 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
EPB41L2O43491 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
EPB41L2O43491 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
EPB41L2O43491 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
EPB41L2O43491 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
EPB41L2O43491 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
EPB41L2O43491 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
EPB41L2O43491 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
EPB41L2O43491 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
EPB41L2O43491 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
EPB41L2O43491 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
EPB41L2O43491 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
EPB41L2O43491 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
EPB41L2O43491 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
EPB41L2O43491 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
EPB41L2O43491 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
EPB41L2O43491 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
EPB41L2O43491 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
EPB41L2O43491 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
EPB41L2O43491 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
EPB41L2O43491 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
EPB41L2O43491 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
EPB41L2O43491 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
EPB41L2O43491 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
EPB41L2O43491 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
EPB41L2O43491 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
EPB41L2O43491 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
EPB41L2O43491 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
EPB41L2O43491 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
EPB41L2O43491 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
EPB41L2O43491 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
EPB41L2O43491 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
EPB41L2O43491 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
EPB41L2O43491 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
EPB41L2O43491 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
EPB41L2O43491 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
EPB41L2O43491 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
EPB41L2O43491 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
EPB41L2O43491 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
EPB41L2O43491 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
EPB41L2O43491 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
EPB41L2O43491 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
EPB41L2O43491 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
EPB41L2O43491 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
EPB41L2O43491 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
EPB41L2O43491 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
EPB41L2O43491 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
EPB41L2O43491 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
EPB41L2O43491 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
EPB41L2O43491 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
EPB41L2O43491 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
EPB41L2O43491 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
EPB41L2O43491 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
EPB41L2O43491 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
EPB41L2O43491 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
EPB41L2O43491 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
EPB41L2O43491 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
EPB41L2O43491 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
EPB41L2O43491 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
EPB41L2O43491 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
EPB41L2O43491 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
EPB41L2O43491 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
EPB41L2O43491 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
EPB41L2O43491 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
EPB41L2O43491 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
EPB41L2O43491 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
EPB41L2O43491 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
EPB41L2O43491 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
EPB41L2O43491 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
EPB41L2O43491 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
EPB41L2O43491 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
EPB41L2O43491 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
EPB41L2O43491 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC27.32■■□□□ 1.96
EPB41L2O43491 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
EPB41L2O43491 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
EPB41L2O43491 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
EPB41L2O43491 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC27.32■■□□□ 1.96
EPB41L2O43491 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
EPB41L2O43491 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
EPB41L2O43491 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
EPB41L2O43491 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
EPB41L2O43491 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
EPB41L2O43491 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
EPB41L2O43491 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
EPB41L2O43491 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
EPB41L2O43491 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
EPB41L2O43491 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
EPB41L2O43491 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
EPB41L2O43491 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
EPB41L2O43491 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
EPB41L2O43491 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
EPB41L2O43491 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
EPB41L2O43491 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms