Protein–RNA interactions for Protein: O14910

LIN7A, Protein lin-7 homolog A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIN7AO14910 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LIN7AO14910 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LIN7AO14910 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LIN7AO14910 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LIN7AO14910 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
LIN7AO14910 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LIN7AO14910 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LIN7AO14910 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LIN7AO14910 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LIN7AO14910 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LIN7AO14910 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LIN7AO14910 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LIN7AO14910 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LIN7AO14910 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
LIN7AO14910 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LIN7AO14910 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LIN7AO14910 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LIN7AO14910 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LIN7AO14910 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LIN7AO14910 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC22.9■■□□□ 1.26
LIN7AO14910 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LIN7AO14910 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LIN7AO14910 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LIN7AO14910 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
LIN7AO14910 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
LIN7AO14910 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
LIN7AO14910 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
LIN7AO14910 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
LIN7AO14910 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
LIN7AO14910 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
LIN7AO14910 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
LIN7AO14910 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LIN7AO14910 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
LIN7AO14910 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LIN7AO14910 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LIN7AO14910 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
LIN7AO14910 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LIN7AO14910 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LIN7AO14910 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LIN7AO14910 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LIN7AO14910 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LIN7AO14910 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LIN7AO14910 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LIN7AO14910 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LIN7AO14910 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LIN7AO14910 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
LIN7AO14910 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LIN7AO14910 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LIN7AO14910 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LIN7AO14910 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LIN7AO14910 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
LIN7AO14910 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LIN7AO14910 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LIN7AO14910 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LIN7AO14910 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LIN7AO14910 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LIN7AO14910 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LIN7AO14910 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LIN7AO14910 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LIN7AO14910 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LIN7AO14910 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LIN7AO14910 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LIN7AO14910 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LIN7AO14910 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LIN7AO14910 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LIN7AO14910 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LIN7AO14910 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LIN7AO14910 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LIN7AO14910 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LIN7AO14910 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LIN7AO14910 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LIN7AO14910 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LIN7AO14910 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LIN7AO14910 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
LIN7AO14910 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
LIN7AO14910 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LIN7AO14910 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LIN7AO14910 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LIN7AO14910 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LIN7AO14910 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LIN7AO14910 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LIN7AO14910 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LIN7AO14910 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LIN7AO14910 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LIN7AO14910 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LIN7AO14910 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LIN7AO14910 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LIN7AO14910 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LIN7AO14910 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LIN7AO14910 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LIN7AO14910 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LIN7AO14910 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LIN7AO14910 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LIN7AO14910 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LIN7AO14910 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LIN7AO14910 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LIN7AO14910 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LIN7AO14910 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LIN7AO14910 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LIN7AO14910 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms