Protein–RNA interactions for Protein: Q9HDB9

ERVK-5, Endogenous retrovirus group K member 5 Gag polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 667 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK-5Q9HDB9 ZCCHC4-206ENST00000612982 938 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ERVK-5Q9HDB9 ELOA3C-201ENST00000620688 1218 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ERVK-5Q9HDB9 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ERVK-5Q9HDB9 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ERVK-5Q9HDB9 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ERVK-5Q9HDB9 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ERVK-5Q9HDB9 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ERVK-5Q9HDB9 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ERVK-5Q9HDB9 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ERVK-5Q9HDB9 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ERVK-5Q9HDB9 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ERVK-5Q9HDB9 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ERVK-5Q9HDB9 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ERVK-5Q9HDB9 EHF-212ENST00000533754 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ERVK-5Q9HDB9 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ERVK-5Q9HDB9 AMPD3-203ENST00000396554 3806 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ERVK-5Q9HDB9 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ERVK-5Q9HDB9 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ERVK-5Q9HDB9 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ERVK-5Q9HDB9 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ERVK-5Q9HDB9 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ERVK-5Q9HDB9 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ERVK-5Q9HDB9 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ERVK-5Q9HDB9 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ERVK-5Q9HDB9 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ERVK-5Q9HDB9 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ERVK-5Q9HDB9 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ERVK-5Q9HDB9 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ERVK-5Q9HDB9 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ERVK-5Q9HDB9 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ERVK-5Q9HDB9 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ERVK-5Q9HDB9 ACOT7-203ENST00000377845 1432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ERVK-5Q9HDB9 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ERVK-5Q9HDB9 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ERVK-5Q9HDB9 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ERVK-5Q9HDB9 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ERVK-5Q9HDB9 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ERVK-5Q9HDB9 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ERVK-5Q9HDB9 CCDC121-202ENST00000394775 1472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ERVK-5Q9HDB9 ZNRD1ASP-217ENST00000437417 1497 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ERVK-5Q9HDB9 GSTT2B-201ENST00000290765 1099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ERVK-5Q9HDB9 ERCC1-203ENST00000340192 949 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ERVK-5Q9HDB9 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ERVK-5Q9HDB9 AL450469.2-201ENST00000427132 499 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ERVK-5Q9HDB9 BANF1-202ENST00000445560 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ERVK-5Q9HDB9 PENK-202ENST00000451791 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ERVK-5Q9HDB9 AC005586.1-201ENST00000488310 577 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ERVK-5Q9HDB9 IFITM3-202ENST00000526811 543 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ERVK-5Q9HDB9 FBXL12-204ENST00000586469 544 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ERVK-5Q9HDB9 USP28-214ENST00000545540 3431 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ERVK-5Q9HDB9 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ERVK-5Q9HDB9 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ERVK-5Q9HDB9 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ERVK-5Q9HDB9 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ERVK-5Q9HDB9 TUBA3D-201ENST00000321253 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ERVK-5Q9HDB9 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ERVK-5Q9HDB9 AL138725.1-201ENST00000407347 1314 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
ERVK-5Q9HDB9 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ERVK-5Q9HDB9 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ERVK-5Q9HDB9 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ERVK-5Q9HDB9 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ERVK-5Q9HDB9 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ERVK-5Q9HDB9 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ERVK-5Q9HDB9 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ERVK-5Q9HDB9 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ERVK-5Q9HDB9 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ERVK-5Q9HDB9 AC020910.5-201ENST00000623668 1865 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
ERVK-5Q9HDB9 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ERVK-5Q9HDB9 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ERVK-5Q9HDB9 TMEM51-204ENST00000428417 1942 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ERVK-5Q9HDB9 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
ERVK-5Q9HDB9 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ERVK-5Q9HDB9 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ERVK-5Q9HDB9 ACTA1-202ENST00000366684 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ERVK-5Q9HDB9 SHC1P1-201ENST00000425230 1745 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
ERVK-5Q9HDB9 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ERVK-5Q9HDB9 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ERVK-5Q9HDB9 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ERVK-5Q9HDB9 AC005089.1-201ENST00000619486 2241 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
ERVK-5Q9HDB9 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ERVK-5Q9HDB9 RBFOX2-201ENST00000262829 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ERVK-5Q9HDB9 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ERVK-5Q9HDB9 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ERVK-5Q9HDB9 TPRKB-202ENST00000318190 819 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ERVK-5Q9HDB9 C1orf53-201ENST00000367393 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ERVK-5Q9HDB9 MRPL43-206ENST00000370236 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ERVK-5Q9HDB9 MRPL43-207ENST00000370241 824 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ERVK-5Q9HDB9 PPIE-203ENST00000372830 1198 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ERVK-5Q9HDB9 FGF14-202ENST00000376143 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ERVK-5Q9HDB9 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ERVK-5Q9HDB9 MIR769-201ENST00000390225 118 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
ERVK-5Q9HDB9 AC010141.1-201ENST00000411585 623 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
ERVK-5Q9HDB9 UPF3AP2-201ENST00000457924 1132 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
ERVK-5Q9HDB9 TUBB8P8-201ENST00000458717 1058 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
ERVK-5Q9HDB9 RERG-205ENST00000537647 935 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ERVK-5Q9HDB9 EID1-202ENST00000560490 584 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ERVK-5Q9HDB9 AC013355.1-201ENST00000562625 723 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
ERVK-5Q9HDB9 AC005324.6-201ENST00000587972 613 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
ERVK-5Q9HDB9 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ERVK-5Q9HDB9 CYP1A1-203ENST00000395049 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms