Protein–RNA interactions for Protein: O43189

PHF1, PHD finger protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 567 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF1O43189 AC127070.2-201ENST00000424075 555 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
PHF1O43189 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
PHF1O43189 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
PHF1O43189 SNHG12-210ENST00000483436 682 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
PHF1O43189 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
PHF1O43189 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.02□□□□□ -0.33
PHF1O43189 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
PHF1O43189 MIR6727-201ENST00000620702 65 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
PHF1O43189 PAPSS2-201ENST00000361175 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
PHF1O43189 ADGRB2-205ENST00000398547 4857 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
PHF1O43189 RIOX2-202ENST00000360258 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
PHF1O43189 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
PHF1O43189 RAB43-202ENST00000393304 4230 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.02□□□□□ -0.33
PHF1O43189 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
PHF1O43189 ZBED1-203ENST00000381223 4510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
PHF1O43189 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
PHF1O43189 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
PHF1O43189 PAX8-AS1-204ENST00000436293 2687 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
PHF1O43189 SPIN3-204ENST00000638257 4835 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
PHF1O43189 RAB2A-201ENST00000262646 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
PHF1O43189 CICP4-201ENST00000447359 2812 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
PHF1O43189 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
PHF1O43189 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC13.02□□□□□ -0.33
PHF1O43189 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
PHF1O43189 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
PHF1O43189 GTF2H2C-210ENST00000510979 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
PHF1O43189 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
PHF1O43189 DTX3L-201ENST00000296161 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PHF1O43189 PWWP2A-201ENST00000307063 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PHF1O43189 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PHF1O43189 AC015656.1-201ENST00000624209 3578 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
PHF1O43189 RP1L1-202ENST00000382483 7973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PHF1O43189 NEDD4L-205ENST00000400345 3647 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PHF1O43189 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
PHF1O43189 RSBN1-201ENST00000261441 6621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
PHF1O43189 DLGAP1-204ENST00000400149 5203 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
PHF1O43189 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
PHF1O43189 CAB39-201ENST00000258418 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PHF1O43189 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PHF1O43189 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PHF1O43189 CA12-202ENST00000344366 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PHF1O43189 INPPL1-213ENST00000541756 4649 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
PHF1O43189 EVC2-201ENST00000310917 4828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PHF1O43189 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PHF1O43189 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
PHF1O43189 FCGR1B-203ENST00000369384 1044 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PHF1O43189 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
PHF1O43189 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PHF1O43189 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PHF1O43189 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PHF1O43189 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
PHF1O43189 FOS-206ENST00000555347 1280 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
PHF1O43189 CMTM3-212ENST00000566121 572 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
PHF1O43189 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
PHF1O43189 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
PHF1O43189 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
PHF1O43189 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
PHF1O43189 IKZF1-217ENST00000612658 962 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PHF1O43189 MEIKIN-203ENST00000442687 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PHF1O43189 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PHF1O43189 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
PHF1O43189 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
PHF1O43189 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PHF1O43189 COL4A3-202ENST00000396578 8097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PHF1O43189 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PHF1O43189 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
PHF1O43189 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PHF1O43189 ARHGEF7-201ENST00000218789 5233 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
PHF1O43189 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PHF1O43189 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PHF1O43189 PHF8-202ENST00000338154 6062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PHF1O43189 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PHF1O43189 SPPL2A-201ENST00000261854 7372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PHF1O43189 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
PHF1O43189 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PHF1O43189 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
PHF1O43189 PPFIBP1-216ENST00000545334 2805 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
PHF1O43189 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PHF1O43189 PRKD2-206ENST00000595515 3012 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
PHF1O43189 RNF222-202ENST00000399398 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
PHF1O43189 FGFR1-202ENST00000335922 4157 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PHF1O43189 ERC1-219ENST00000546231 4390 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
PHF1O43189 CFLAR-206ENST00000395148 4415 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PHF1O43189 ZNF541-203ENST00000391901 4580 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
PHF1O43189 PADI2-202ENST00000375486 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PHF1O43189 PTENP1-202ENST00000532280 3996 ntBASIC13□□□□□ -0.33
PHF1O43189 GGA1-206ENST00000406772 3205 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
PHF1O43189 PVR-202ENST00000344956 3166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
PHF1O43189 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PHF1O43189 PPP1R16A-201ENST00000292539 2722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
PHF1O43189 DMTN-203ENST00000381470 2601 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
PHF1O43189 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
PHF1O43189 LMX1B-202ENST00000373474 5797 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PHF1O43189 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
PHF1O43189 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PHF1O43189 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PHF1O43189 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PHF1O43189 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
PHF1O43189 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
PHF1O43189 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
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