RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000566121.1

CMTM3-212, Transcript of CKLF like MARVEL transmembrane domain containing 3, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene CMTM3, Length 572 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMTM3-212ENST00000566121 NISCHQ9Y2I1 1504 aa37.81■■■■□ 3.64
CMTM3-212ENST00000566121 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa33.82■■■■□ 3
CMTM3-212ENST00000566121 ABCC9O60706 1549 aa33.44■■■□□ 2.94
CMTM3-212ENST00000566121 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa32.08■■■□□ 2.73
CMTM3-212ENST00000566121 NACADO15069 1562 aa31.99■■■□□ 2.71
CMTM3-212ENST00000566121 MYO15BQ96JP2 1530 aa31.79■■■□□ 2.68
CMTM3-212ENST00000566121 DCAF8L2P0C7V8 631 aa31.59■■■□□ 2.65
CMTM3-212ENST00000566121 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa31.4■■■□□ 2.62
CMTM3-212ENST00000566121 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP31.37■■■□□ 2.61
CMTM3-212ENST00000566121 DNAJC5BQ9UF47 199 aa31.26■■■□□ 2.59
CMTM3-212ENST00000566121 UNC13AQ9UPW8 1703 aa31.18■■■□□ 2.58
CMTM3-212ENST00000566121 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP31.18■■■□□ 2.58
CMTM3-212ENST00000566121 BICRAQ9NZM4 1560 aa31.11■■■□□ 2.57
CMTM3-212ENST00000566121 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa30.95■■■□□ 2.54
CMTM3-212ENST00000566121 SCRIBQ14160 1630 aa30.62■■■□□ 2.49
CMTM3-212ENST00000566121 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP30.32■■■□□ 2.44
CMTM3-212ENST00000566121 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa30.27■■■□□ 2.44
CMTM3-212ENST00000566121 CECR2Q9BXF3 1484 aa30.2■■■□□ 2.43
CMTM3-212ENST00000566121 NCAPD3P42695 1498 aa29.58■■■□□ 2.33
CMTM3-212ENST00000566121 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa29.42■■■□□ 2.3
CMTM3-212ENST00000566121 SMARCA2P51531 1590 aa29.37■■■□□ 2.29
CMTM3-212ENST00000566121 SMARCA4P51532 1647 aa29.37■■■□□ 2.29
CMTM3-212ENST00000566121 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP29.33■■■□□ 2.29
CMTM3-212ENST00000566121 HMGXB3Q12766 1538 aa29.31■■■□□ 2.28
CMTM3-212ENST00000566121 PEG3Q9GZU2 1588 aa29.24■■■□□ 2.27
CMTM3-212ENST00000566121 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP29.09■■■□□ 2.25
CMTM3-212ENST00000566121 MROH2BQ7Z745 1585 aa29.05■■■□□ 2.24
CMTM3-212ENST00000566121 CUX2O14529 1486 aa28.93■■■□□ 2.22
CMTM3-212ENST00000566121 ERCC6Q03468 1493 aa28.89■■■□□ 2.22
CMTM3-212ENST00000566121 NESP48681 1621 aa28.79■■■□□ 2.2
CMTM3-212ENST00000566121 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa28.79■■■□□ 2.2
CMTM3-212ENST00000566121 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa28.69■■■□□ 2.18
CMTM3-212ENST00000566121 PDS5BQ9NTI5 1447 aa28.65■■■□□ 2.18
CMTM3-212ENST00000566121 CADPSQ9ULU8 1353 aa28.64■■■□□ 2.18
CMTM3-212ENST00000566121 WIZO95785 1651 aa28.62■■■□□ 2.17
CMTM3-212ENST00000566121 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP28.6■■■□□ 2.17
CMTM3-212ENST00000566121 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP28.51■■■□□ 2.15
CMTM3-212ENST00000566121 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP28.4■■■□□ 2.14
CMTM3-212ENST00000566121 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa28.39■■■□□ 2.14
CMTM3-212ENST00000566121 CFTRP13569 1480 aa28.37■■■□□ 2.13
CMTM3-212ENST00000566121 MRC2Q9UBG0 1479 aa28.31■■■□□ 2.12
CMTM3-212ENST00000566121 WDR62O43379 1518 aa28.25■■■□□ 2.11
CMTM3-212ENST00000566121 FANCD2Q9BXW9 1451 aa28.21■■■□□ 2.11
CMTM3-212ENST00000566121 CEP164Q9UPV0 1460 aa28.21■■■□□ 2.11
CMTM3-212ENST00000566121 CCDC88BA6NC98 1476 aa28.08■■■□□ 2.09
CMTM3-212ENST00000566121 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP27.95■■■□□ 2.06
CMTM3-212ENST00000566121 PRDM2Q13029 1718 aa27.93■■■□□ 2.06
CMTM3-212ENST00000566121 ABCC8Q09428 1581 aa27.82■■■□□ 2.04
CMTM3-212ENST00000566121 IFT140Q96RY7 1462 aa27.72■■■□□ 2.03
CMTM3-212ENST00000566121 TOPBP1Q92547 1522 aa27.71■■■□□ 2.03
CMTM3-212ENST00000566121 OSCARQ8IYS5 282 aa27.65■■■□□ 2.02
CMTM3-212ENST00000566121 DNMBPQ6XZF7 1577 aa27.63■■■□□ 2.01
CMTM3-212ENST00000566121 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP27.52■■■□□ 2
CMTM3-212ENST00000566121 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP27.45■■□□□ 1.99
CMTM3-212ENST00000566121 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP27.44■■□□□ 1.98
CMTM3-212ENST00000566121 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP27.36■■□□□ 1.97
CMTM3-212ENST00000566121 SOGA1O94964 1423 aa27.34■■□□□ 1.97
CMTM3-212ENST00000566121 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP27.33■■□□□ 1.97
CMTM3-212ENST00000566121 WDR97A6NE52 1622 aa27.33■■□□□ 1.97
CMTM3-212ENST00000566121 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP27.3■■□□□ 1.96
CMTM3-212ENST00000566121 CUX1P39880 1505 aa27.27■■□□□ 1.96
CMTM3-212ENST00000566121 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa27.26■■□□□ 1.95
CMTM3-212ENST00000566121 FGD5Q6ZNL6 1462 aa27.25■■□□□ 1.95
CMTM3-212ENST00000566121 TRIM41Q8WV44 630 aa27.24■■□□□ 1.95
CMTM3-212ENST00000566121 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP27.2■■□□□ 1.94
CMTM3-212ENST00000566121 GRIN2BQ13224 1484 aa27.11■■□□□ 1.93
CMTM3-212ENST00000566121 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP27.11■■□□□ 1.93
CMTM3-212ENST00000566121 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa27.09■■□□□ 1.93
CMTM3-212ENST00000566121 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa27.09■■□□□ 1.93
CMTM3-212ENST00000566121 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa27.09■■□□□ 1.93
CMTM3-212ENST00000566121 ARHGEF11O15085 1522 aa27.09■■□□□ 1.93
CMTM3-212ENST00000566121 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa27.07■■□□□ 1.92
CMTM3-212ENST00000566121 CHD1O14646 1710 aa27.05■■□□□ 1.92
CMTM3-212ENST00000566121 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa27.03■■□□□ 1.92
CMTM3-212ENST00000566121 FBLN2P98095 1184 aa27.02■■□□□ 1.92
CMTM3-212ENST00000566121 GAPVD1Q14C86 1478 aa27.01■■□□□ 1.91
CMTM3-212ENST00000566121 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP27■■□□□ 1.91
CMTM3-212ENST00000566121 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP27■■□□□ 1.91
CMTM3-212ENST00000566121 SYNJ2O15056 1496 aa26.99■■□□□ 1.91
CMTM3-212ENST00000566121 TOP2BQ02880 1626 aa26.94■■□□□ 1.9
CMTM3-212ENST00000566121 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa26.92■■□□□ 1.9
CMTM3-212ENST00000566121 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa26.92■■□□□ 1.9
CMTM3-212ENST00000566121 CLASP1Q7Z460 1538 aa26.91■■□□□ 1.9
CMTM3-212ENST00000566121 SYNJ1O43426 1573 aa26.9■■□□□ 1.9
CMTM3-212ENST00000566121 CYB5RLQ6IPT4 315 aa26.86■■□□□ 1.89
CMTM3-212ENST00000566121 PBRM1Q86U86 1689 aa26.84■■□□□ 1.89
CMTM3-212ENST00000566121 ARAP1Q96P48 1450 aa26.83■■□□□ 1.89
CMTM3-212ENST00000566121 ERICH3Q5RHP9 1530 aa26.75■■□□□ 1.87
CMTM3-212ENST00000566121 FHAD1B1AJZ9 1412 aa26.73■■□□□ 1.87
CMTM3-212ENST00000566121 GRIN2AQ12879 1464 aa26.72■■□□□ 1.87
CMTM3-212ENST00000566121 NUP160Q12769 1436 aa26.7■■□□□ 1.86
CMTM3-212ENST00000566121 ADAMTS12P58397 1594 aa26.67■■□□□ 1.86
CMTM3-212ENST00000566121 CEP170Q5SW79 1584 aa26.54■■□□□ 1.84
CMTM3-212ENST00000566121 SHROOM2Q13796 1616 aa26.5■■□□□ 1.83
CMTM3-212ENST00000566121 IGF1RP08069 1367 aa26.47■■□□□ 1.83
CMTM3-212ENST00000566121 KIF27Q86VH2 1401 aa26.47■■□□□ 1.83
CMTM3-212ENST00000566121 TRHP20396 242 aaPredicted RBP26.42■■□□□ 1.82
CMTM3-212ENST00000566121 JPH4Q96JJ6 628 aa26.41■■□□□ 1.82
CMTM3-212ENST00000566121 ERCC6L2Q5T890 1561 aa26.37■■□□□ 1.81
CMTM3-212ENST00000566121 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP26.33■■□□□ 1.81
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