Protein–RNA interactions for Protein: A2IDD5

CCDC78, Coiled-coil domain-containing protein 78, humanhuman

Predictions only

Length 438 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC78A2IDD5 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCDC78A2IDD5 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCDC78A2IDD5 CEP131-203ENST00000450824 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCDC78A2IDD5 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCDC78A2IDD5 MAGED4B-202ENST00000360134 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCDC78A2IDD5 TMCO3-202ENST00000434316 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCDC78A2IDD5 KIF3C-201ENST00000264712 5344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCDC78A2IDD5 CLCN1-201ENST00000343257 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCDC78A2IDD5 NELFA-202ENST00000382882 3343 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCDC78A2IDD5 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCDC78A2IDD5 SSTR2-201ENST00000357585 7683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCDC78A2IDD5 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCDC78A2IDD5 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCDC78A2IDD5 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCDC78A2IDD5 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCDC78A2IDD5 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCDC78A2IDD5 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
CCDC78A2IDD5 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCDC78A2IDD5 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCDC78A2IDD5 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCDC78A2IDD5 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCDC78A2IDD5 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
CCDC78A2IDD5 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCDC78A2IDD5 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCDC78A2IDD5 PATZ1-203ENST00000351933 3638 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCDC78A2IDD5 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCDC78A2IDD5 SYNRG-217ENST00000612223 8229 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCDC78A2IDD5 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCDC78A2IDD5 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCDC78A2IDD5 AC005899.8-201ENST00000625127 3153 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCDC78A2IDD5 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCDC78A2IDD5 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCDC78A2IDD5 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCDC78A2IDD5 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCDC78A2IDD5 ARID3B-201ENST00000346246 4271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCDC78A2IDD5 KLHDC7A-201ENST00000400664 5145 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCDC78A2IDD5 FUK-202ENST00000378912 3925 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCDC78A2IDD5 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCDC78A2IDD5 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCDC78A2IDD5 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCDC78A2IDD5 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCDC78A2IDD5 RREB1-202ENST00000349384 7440 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCDC78A2IDD5 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCDC78A2IDD5 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCDC78A2IDD5 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCDC78A2IDD5 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCDC78A2IDD5 ATP2C1-214ENST00000508532 4969 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCDC78A2IDD5 AC097374.1-201ENST00000568768 6624 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCDC78A2IDD5 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCDC78A2IDD5 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCDC78A2IDD5 MBD6-201ENST00000355673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCDC78A2IDD5 KIF7-201ENST00000394412 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCDC78A2IDD5 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCDC78A2IDD5 CENPO-202ENST00000380834 4386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCDC78A2IDD5 PSD-209ENST00000611678 3382 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCDC78A2IDD5 EHD4-201ENST00000220325 6416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCDC78A2IDD5 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCDC78A2IDD5 PLAGL1-201ENST00000354765 3663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCDC78A2IDD5 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCDC78A2IDD5 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCDC78A2IDD5 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCDC78A2IDD5 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCDC78A2IDD5 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCDC78A2IDD5 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCDC78A2IDD5 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCDC78A2IDD5 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCDC78A2IDD5 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCDC78A2IDD5 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCDC78A2IDD5 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCDC78A2IDD5 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCDC78A2IDD5 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCDC78A2IDD5 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCDC78A2IDD5 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCDC78A2IDD5 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCDC78A2IDD5 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCDC78A2IDD5 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCDC78A2IDD5 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CCDC78A2IDD5 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCDC78A2IDD5 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCDC78A2IDD5 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CCDC78A2IDD5 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CCDC78A2IDD5 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CCDC78A2IDD5 TRAFD1-201ENST00000257604 3178 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCDC78A2IDD5 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCDC78A2IDD5 TMEM230-202ENST00000342308 1562 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCDC78A2IDD5 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCDC78A2IDD5 AKAP12-204ENST00000402676 8432 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCDC78A2IDD5 AGRN-201ENST00000379370 7323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCDC78A2IDD5 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCDC78A2IDD5 AC005523.2-201ENST00000601192 3568 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCDC78A2IDD5 THBS2-206ENST00000617924 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCDC78A2IDD5 SCUBE1-202ENST00000360835 9808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCDC78A2IDD5 AC004706.4-201ENST00000634965 3537 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCDC78A2IDD5 GOLGA2P7-207ENST00000559668 4253 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCDC78A2IDD5 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCDC78A2IDD5 PDPK1-201ENST00000268673 4728 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCDC78A2IDD5 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCDC78A2IDD5 SEZ6L-202ENST00000343706 2898 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCDC78A2IDD5 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCDC78A2IDD5 CYB561-201ENST00000360793 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.2 ms