Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBB9

TFIP11, Tuftelin-interacting protein 11, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 837 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFIP11Q9UBB9 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TFIP11Q9UBB9 UBE4B-201ENST00000253251 4772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TFIP11Q9UBB9 PLEKHO2-202ENST00000616065 3569 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TFIP11Q9UBB9 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TFIP11Q9UBB9 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TFIP11Q9UBB9 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
TFIP11Q9UBB9 GIT1-211ENST00000581348 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TFIP11Q9UBB9 HNRNPLL-205ENST00000409636 3980 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TFIP11Q9UBB9 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TFIP11Q9UBB9 PTPRU-205ENST00000460170 5337 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TFIP11Q9UBB9 CRMP1-205ENST00000512574 2764 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TFIP11Q9UBB9 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TFIP11Q9UBB9 SAR1A-204ENST00000373241 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TFIP11Q9UBB9 PRAMEF25-202ENST00000619661 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TFIP11Q9UBB9 GLT1D1-201ENST00000281703 2725 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TFIP11Q9UBB9 SBF1P1-201ENST00000444527 5631 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
TFIP11Q9UBB9 GAK-214ENST00000511163 4280 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TFIP11Q9UBB9 UHRF1-204ENST00000616255 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TFIP11Q9UBB9 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TFIP11Q9UBB9 ATP6V0A1-203ENST00000393829 3028 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TFIP11Q9UBB9 ZKSCAN4-201ENST00000377294 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TFIP11Q9UBB9 ZBED1-203ENST00000381223 4510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TFIP11Q9UBB9 ARID3B-201ENST00000346246 4271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TFIP11Q9UBB9 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TFIP11Q9UBB9 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TFIP11Q9UBB9 RARG-203ENST00000425354 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TFIP11Q9UBB9 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TFIP11Q9UBB9 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TFIP11Q9UBB9 TRIM46-210ENST00000545012 2979 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TFIP11Q9UBB9 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TFIP11Q9UBB9 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TFIP11Q9UBB9 ELAC2-201ENST00000338034 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TFIP11Q9UBB9 TTC8-203ENST00000346301 2058 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TFIP11Q9UBB9 PPFIA3-203ENST00000602351 4341 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TFIP11Q9UBB9 IKBKB-217ENST00000520810 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TFIP11Q9UBB9 IGF2BP2-202ENST00000382199 3688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TFIP11Q9UBB9 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TFIP11Q9UBB9 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TFIP11Q9UBB9 SDCBP2-AS1-201ENST00000446423 1811 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TFIP11Q9UBB9 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TFIP11Q9UBB9 TYK2-210ENST00000529370 3176 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TFIP11Q9UBB9 PPIL2-202ENST00000398831 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TFIP11Q9UBB9 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TFIP11Q9UBB9 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TFIP11Q9UBB9 FRMD3-201ENST00000304195 5297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TFIP11Q9UBB9 PAX3-203ENST00000344493 3109 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TFIP11Q9UBB9 LBH-201ENST00000395323 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TFIP11Q9UBB9 HDAC9-208ENST00000417496 2524 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TFIP11Q9UBB9 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TFIP11Q9UBB9 XPNPEP1-201ENST00000322238 2467 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TFIP11Q9UBB9 UPB1-201ENST00000326010 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TFIP11Q9UBB9 ABCC10-201ENST00000244533 5088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TFIP11Q9UBB9 NUP50-201ENST00000347635 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TFIP11Q9UBB9 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TFIP11Q9UBB9 ANOS1-201ENST00000262648 6314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TFIP11Q9UBB9 GFRA1-201ENST00000355422 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TFIP11Q9UBB9 AP3M2-201ENST00000174653 3661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TFIP11Q9UBB9 DIXDC1-201ENST00000440460 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TFIP11Q9UBB9 CUL3-202ENST00000344951 6592 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TFIP11Q9UBB9 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TFIP11Q9UBB9 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TFIP11Q9UBB9 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TFIP11Q9UBB9 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TFIP11Q9UBB9 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TFIP11Q9UBB9 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TFIP11Q9UBB9 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TFIP11Q9UBB9 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
TFIP11Q9UBB9 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TFIP11Q9UBB9 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TFIP11Q9UBB9 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
TFIP11Q9UBB9 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
TFIP11Q9UBB9 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TFIP11Q9UBB9 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TFIP11Q9UBB9 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TFIP11Q9UBB9 MSH5-201ENST00000375703 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TFIP11Q9UBB9 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TFIP11Q9UBB9 THBS4-201ENST00000350881 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TFIP11Q9UBB9 KCNH4-201ENST00000264661 3920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
TFIP11Q9UBB9 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
TFIP11Q9UBB9 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
TFIP11Q9UBB9 OPA1-204ENST00000361828 6381 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
TFIP11Q9UBB9 BOLL-203ENST00000392296 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
TFIP11Q9UBB9 DDX20-201ENST00000369702 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
TFIP11Q9UBB9 SC5D-202ENST00000392789 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
TFIP11Q9UBB9 TM4SF19-203ENST00000446879 1582 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
TFIP11Q9UBB9 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
TFIP11Q9UBB9 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
TFIP11Q9UBB9 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
TFIP11Q9UBB9 KLHL25-201ENST00000337975 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
TFIP11Q9UBB9 SUOX-201ENST00000266971 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TFIP11Q9UBB9 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TFIP11Q9UBB9 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TFIP11Q9UBB9 BAIAP3-202ENST00000397488 4583 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TFIP11Q9UBB9 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TFIP11Q9UBB9 DRC3-203ENST00000399187 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TFIP11Q9UBB9 ENDOV-206ENST00000518901 2549 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TFIP11Q9UBB9 CPSF7-201ENST00000340437 3695 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TFIP11Q9UBB9 PTBP1-221ENST00000635647 3691 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TFIP11Q9UBB9 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TFIP11Q9UBB9 TPO-205ENST00000382201 2956 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.2 ms