Protein–RNA interactions for Protein: Q5TDP6

LGSN, Lengsin, humanhuman

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Length 509 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LGSNQ5TDP6 FAM9C-205ENST00000542843 5858 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LGSNQ5TDP6 DOCK4-206ENST00000437633 6212 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LGSNQ5TDP6 GET4-202ENST00000407192 4356 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LGSNQ5TDP6 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
LGSNQ5TDP6 PIK3R3-203ENST00000420542 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LGSNQ5TDP6 JMJD6-208ENST00000617192 5517 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LGSNQ5TDP6 STAB1-201ENST00000321725 7928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LGSNQ5TDP6 ANKHD1-203ENST00000360839 8221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LGSNQ5TDP6 SLC35E2B-205ENST00000617444 6283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LGSNQ5TDP6 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
LGSNQ5TDP6 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LGSNQ5TDP6 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LGSNQ5TDP6 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LGSNQ5TDP6 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LGSNQ5TDP6 FP565260.2-201ENST00000623476 1599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LGSNQ5TDP6 NDNF-201ENST00000379692 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LGSNQ5TDP6 NDUFC2-201ENST00000281031 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LGSNQ5TDP6 CDH1-201ENST00000261769 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LGSNQ5TDP6 CEP135-202ENST00000422247 2092 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LGSNQ5TDP6 SERINC2-206ENST00000536859 2072 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LGSNQ5TDP6 AC011474.4-201ENST00000623523 2076 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
LGSNQ5TDP6 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LGSNQ5TDP6 IL17RD-203ENST00000463523 2348 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LGSNQ5TDP6 KBTBD7-201ENST00000379483 4734 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LGSNQ5TDP6 SGK2-201ENST00000341458 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LGSNQ5TDP6 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LGSNQ5TDP6 KRTAP19-7-201ENST00000334849 440 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LGSNQ5TDP6 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LGSNQ5TDP6 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
LGSNQ5TDP6 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LGSNQ5TDP6 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LGSNQ5TDP6 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LGSNQ5TDP6 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LGSNQ5TDP6 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LGSNQ5TDP6 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LGSNQ5TDP6 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LGSNQ5TDP6 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LGSNQ5TDP6 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LGSNQ5TDP6 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
LGSNQ5TDP6 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LGSNQ5TDP6 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
LGSNQ5TDP6 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LGSNQ5TDP6 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LGSNQ5TDP6 DDN-201ENST00000421952 3749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LGSNQ5TDP6 BTN1A1-201ENST00000244513 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LGSNQ5TDP6 FOXD4L5-201ENST00000377420 3109 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LGSNQ5TDP6 INO80-202ENST00000401393 5991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LGSNQ5TDP6 MTMR9-201ENST00000221086 7481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LGSNQ5TDP6 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LGSNQ5TDP6 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LGSNQ5TDP6 ALCAM-201ENST00000306107 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LGSNQ5TDP6 MFSD11-211ENST00000588460 3612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LGSNQ5TDP6 NOTCH1-201ENST00000277541 9371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LGSNQ5TDP6 SLC6A5-202ENST00000525748 7084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LGSNQ5TDP6 EPHB3-201ENST00000330394 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LGSNQ5TDP6 ABCC10-204ENST00000372530 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LGSNQ5TDP6 MED4-201ENST00000258648 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LGSNQ5TDP6 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LGSNQ5TDP6 ZKSCAN7-201ENST00000273320 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LGSNQ5TDP6 DHCR24-201ENST00000371269 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LGSNQ5TDP6 HCFC2-201ENST00000229330 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LGSNQ5TDP6 ANKMY1-204ENST00000391987 3221 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LGSNQ5TDP6 CMBL-201ENST00000296658 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LGSNQ5TDP6 PPP1R26P4-201ENST00000619065 3527 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
LGSNQ5TDP6 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LGSNQ5TDP6 NRXN1-207ENST00000404971 7578 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LGSNQ5TDP6 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LGSNQ5TDP6 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LGSNQ5TDP6 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LGSNQ5TDP6 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LGSNQ5TDP6 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LGSNQ5TDP6 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LGSNQ5TDP6 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LGSNQ5TDP6 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LGSNQ5TDP6 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
LGSNQ5TDP6 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LGSNQ5TDP6 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LGSNQ5TDP6 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LGSNQ5TDP6 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
LGSNQ5TDP6 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
LGSNQ5TDP6 VILL-202ENST00000383759 2787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LGSNQ5TDP6 RPUSD2-201ENST00000315616 2358 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LGSNQ5TDP6 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LGSNQ5TDP6 IL20RA-201ENST00000316649 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LGSNQ5TDP6 RPARP-AS1-202ENST00000492465 1556 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LGSNQ5TDP6 MFNG-202ENST00000416983 2034 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LGSNQ5TDP6 MSH5-201ENST00000375703 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LGSNQ5TDP6 ADAMTS13-202ENST00000356589 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LGSNQ5TDP6 TMEM38A-201ENST00000187762 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LGSNQ5TDP6 PIGG-202ENST00000383028 2787 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LGSNQ5TDP6 SPOCK3-202ENST00000357545 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LGSNQ5TDP6 GSTCD-206ENST00000507281 2091 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LGSNQ5TDP6 PRPH-201ENST00000257860 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LGSNQ5TDP6 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LGSNQ5TDP6 MAPRE2-201ENST00000300249 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LGSNQ5TDP6 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LGSNQ5TDP6 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LGSNQ5TDP6 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LGSNQ5TDP6 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LGSNQ5TDP6 OPN5-202ENST00000371211 1801 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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