Protein–RNA interactions for Protein: Q13029

PRDM2, PR domain zinc finger protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,718 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM2Q13029 MRPL55-205ENST00000366731 1423 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PRDM2Q13029 TMEM182-201ENST00000409173 3198 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PRDM2Q13029 AP000354.1-201ENST00000396982 456 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
PRDM2Q13029 PLA2G2A-202ENST00000400520 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PRDM2Q13029 RN7SL288P-201ENST00000490496 291 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
PRDM2Q13029 ALG10B-203ENST00000551464 571 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PRDM2Q13029 AC015712.5-201ENST00000558568 564 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PRDM2Q13029 AC005323.2-202ENST00000581304 493 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PRDM2Q13029 GGNBP1-204ENST00000613113 887 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
PRDM2Q13029 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PRDM2Q13029 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PRDM2Q13029 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PRDM2Q13029 ADD3-202ENST00000356080 3081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PRDM2Q13029 ATAT1-206ENST00000376485 1476 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PRDM2Q13029 APBB3-202ENST00000356738 1804 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PRDM2Q13029 PLSCR1-214ENST00000487389 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PRDM2Q13029 VAC14-AS1-201ENST00000398177 2145 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PRDM2Q13029 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PRDM2Q13029 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PRDM2Q13029 RPF1-201ENST00000370654 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PRDM2Q13029 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PRDM2Q13029 MRPL35-201ENST00000254644 1061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PRDM2Q13029 IGHV5-51-201ENST00000390626 410 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PRDM2Q13029 COLEC11-204ENST00000402794 1134 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PRDM2Q13029 SOD2-205ENST00000444946 917 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PRDM2Q13029 TEX36-AS1-202ENST00000446081 749 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PRDM2Q13029 FRMD4A-204ENST00000475141 1233 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PRDM2Q13029 STAT5A-208ENST00000587646 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PRDM2Q13029 CDC42SE2-202ENST00000395246 3485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PRDM2Q13029 CBX3-201ENST00000337620 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PRDM2Q13029 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PRDM2Q13029 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PRDM2Q13029 PLTP-203ENST00000372431 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PRDM2Q13029 AC138761.6-201ENST00000583997 1423 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
PRDM2Q13029 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PRDM2Q13029 SVOPL-203ENST00000421622 1653 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PRDM2Q13029 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PRDM2Q13029 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PRDM2Q13029 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PRDM2Q13029 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PRDM2Q13029 FAM227B-212ENST00000561064 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PRDM2Q13029 RPRD2-201ENST00000369067 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PRDM2Q13029 HMGCLL1-203ENST00000370850 1171 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PRDM2Q13029 EHMT2-AS1-201ENST00000434689 373 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PRDM2Q13029 AC253536.3-201ENST00000444093 558 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PRDM2Q13029 NAV1-210ENST00000593583 726 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
PRDM2Q13029 AL591424.3-201ENST00000614278 872 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
PRDM2Q13029 LUC7L2-208ENST00000541170 1525 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PRDM2Q13029 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PRDM2Q13029 BTNL8-206ENST00000508408 1717 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PRDM2Q13029 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PRDM2Q13029 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PRDM2Q13029 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PRDM2Q13029 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PRDM2Q13029 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PRDM2Q13029 AMT-256ENST00000638063 1783 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PRDM2Q13029 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PRDM2Q13029 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PRDM2Q13029 LINC01656-201ENST00000415702 630 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PRDM2Q13029 AL157392.3-204ENST00000440878 397 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PRDM2Q13029 LINC01056-201ENST00000455711 1234 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PRDM2Q13029 EIF2B1-205ENST00000539951 848 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PRDM2Q13029 AL590235.1-201ENST00000564650 861 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
PRDM2Q13029 AC004686.1-201ENST00000605113 538 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
PRDM2Q13029 ADAMTS9-AS1-216ENST00000626280 882 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PRDM2Q13029 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PRDM2Q13029 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PRDM2Q13029 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PRDM2Q13029 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
PRDM2Q13029 PRICKLE3-204ENST00000453382 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
PRDM2Q13029 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
PRDM2Q13029 IL18BP-205ENST00000393705 1549 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
PRDM2Q13029 MPI-203ENST00000535694 1523 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
PRDM2Q13029 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
PRDM2Q13029 CR382285.1-201ENST00000625012 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PRDM2Q13029 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
PRDM2Q13029 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PRDM2Q13029 OPN1SW-201ENST00000249389 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PRDM2Q13029 RHOC-205ENST00000369636 786 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PRDM2Q13029 HDAC8-204ENST00000373560 819 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PRDM2Q13029 OR10N1P-201ENST00000392758 869 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
PRDM2Q13029 ABCD1P4-201ENST00000399687 604 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
PRDM2Q13029 LINP1-201ENST00000417112 917 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PRDM2Q13029 EEF1DP5-201ENST00000431410 772 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
PRDM2Q13029 TMEM202-AS1-201ENST00000562573 723 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PRDM2Q13029 AC005586.2-201ENST00000563946 837 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
PRDM2Q13029 POLR2E-204ENST00000586746 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PRDM2Q13029 AL359091.4-201ENST00000610052 409 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
PRDM2Q13029 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PRDM2Q13029 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PRDM2Q13029 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PRDM2Q13029 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PRDM2Q13029 THY1-206ENST00000528522 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PRDM2Q13029 AC010255.3-203ENST00000509403 1727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PRDM2Q13029 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PRDM2Q13029 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PRDM2Q13029 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PRDM2Q13029 CALCB-203ENST00000533448 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PRDM2Q13029 AC092573.1-201ENST00000433054 884 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
PRDM2Q13029 SLC25A15P3-201ENST00000505530 290 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
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