Protein–RNA interactions for Protein: Q03181

PPARD, Peroxisome proliferator-activated receptor delta, humanhuman

Predictions only

Length 441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPARDQ03181 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PPARDQ03181 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PPARDQ03181 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PPARDQ03181 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
PPARDQ03181 PRKN-204ENST00000366896 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PPARDQ03181 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PPARDQ03181 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PPARDQ03181 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PPARDQ03181 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PPARDQ03181 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
PPARDQ03181 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PPARDQ03181 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PPARDQ03181 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
PPARDQ03181 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PPARDQ03181 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PPARDQ03181 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
PPARDQ03181 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PPARDQ03181 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
PPARDQ03181 UBXN11-204ENST00000374217 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PPARDQ03181 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PPARDQ03181 NDRG4-217ENST00000562999 2931 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PPARDQ03181 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PPARDQ03181 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PPARDQ03181 GRIN1-202ENST00000371546 4114 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PPARDQ03181 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PPARDQ03181 MUC1-223ENST00000611571 4170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PPARDQ03181 NUCB1-201ENST00000405315 2668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PPARDQ03181 ZBTB2-201ENST00000325144 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PPARDQ03181 BAK1-201ENST00000360661 2132 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PPARDQ03181 LDLR-202ENST00000455727 2333 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PPARDQ03181 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PPARDQ03181 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PPARDQ03181 PCDHA11-201ENST00000398640 6115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PPARDQ03181 TRMT1-201ENST00000221504 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PPARDQ03181 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PPARDQ03181 LOXL3-202ENST00000393937 2398 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PPARDQ03181 FAM84B-201ENST00000304916 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PPARDQ03181 MGLL-201ENST00000265052 4642 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PPARDQ03181 SP8-203ENST00000617581 3496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PPARDQ03181 DAGLB-201ENST00000297056 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PPARDQ03181 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PPARDQ03181 ST7L-202ENST00000358039 4528 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PPARDQ03181 SPATS2L-209ENST00000409988 2698 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PPARDQ03181 HNRNPH3-201ENST00000265866 2339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PPARDQ03181 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PPARDQ03181 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PPARDQ03181 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PPARDQ03181 PURA-201ENST00000331327 11497 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PPARDQ03181 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PPARDQ03181 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PPARDQ03181 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PPARDQ03181 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PPARDQ03181 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PPARDQ03181 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PPARDQ03181 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PPARDQ03181 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
PPARDQ03181 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PPARDQ03181 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PPARDQ03181 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PPARDQ03181 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PPARDQ03181 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PPARDQ03181 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PPARDQ03181 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PPARDQ03181 HDAC11-213ENST00000437379 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PPARDQ03181 MAPRE2-201ENST00000300249 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PPARDQ03181 ABCA2-201ENST00000265662 8154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PPARDQ03181 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PPARDQ03181 MYOM3-202ENST00000374434 5804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PPARDQ03181 ZKSCAN4-201ENST00000377294 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PPARDQ03181 GMCL1-201ENST00000282570 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PPARDQ03181 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PPARDQ03181 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PPARDQ03181 MCM9-202ENST00000316316 5101 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PPARDQ03181 TRPV6-201ENST00000359396 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PPARDQ03181 NEK10-206ENST00000429845 4250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PPARDQ03181 GAD2-203ENST00000376261 5858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PPARDQ03181 AP4B1-201ENST00000256658 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PPARDQ03181 DDX17-202ENST00000396821 4791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PPARDQ03181 PTPRO-201ENST00000281171 5301 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PPARDQ03181 LINC01250-201ENST00000457478 2344 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PPARDQ03181 PLIN4-201ENST00000301286 6353 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PPARDQ03181 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PPARDQ03181 SNX19-211ENST00000533214 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PPARDQ03181 ANKMY1-210ENST00000406958 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PPARDQ03181 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PPARDQ03181 PHF24-201ENST00000242315 5718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PPARDQ03181 EGFR-207ENST00000455089 3844 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PPARDQ03181 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PPARDQ03181 PSIP1-203ENST00000380733 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PPARDQ03181 ADAM33-207ENST00000619289 3195 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PPARDQ03181 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PPARDQ03181 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PPARDQ03181 SPRED1-201ENST00000299084 7780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PPARDQ03181 HDAC2-206ENST00000519108 2000 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PPARDQ03181 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PPARDQ03181 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PPARDQ03181 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PPARDQ03181 ADAMTSL4-203ENST00000369039 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PPARDQ03181 RET-205ENST00000615310 4337 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PPARDQ03181 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.3 ms